ZNF644
Ідентифікатори
Символи
ZNF644 , BM-005, MYP21, NatF, ZEP-2, zinc finger protein 644
Зовнішні ІД
OMIM : 614159 MGI: 1277212 HomoloGene: 12971 GeneCards: ZNF644
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
Клітинна компонента
• клітинне ядро
Біологічний процес
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 1: 90.92 – 91.02 Mb
Хр. 5: 106.62 – 106.7 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
ZNF644 (англ. Zinc finger protein 644 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 327 амінокислот , а молекулярна маса — 149 565[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MRSFLQQDVN KTKSRLNVLN GLANNMDDLK INTDITGAKE ELLDDNNFIS
DKESGVHKPK DCQTSFQKNN TLTLPEELSK DKSENALSGG QSSLFIHAGA
PTVSSENFIL PKGAAVNGPV SHSSLTKTSN MNKGSVSLTT GQPVDQPTTE
SCSTLKVAAD LQLSTPQKAS QHQVLFLLSD VAHAKNPTHS NKKLPTSASV
GCDIQNSVGS NIKSDGTLIN QVEVGEDGED LLVKDDCVNT VTGISSGTDG
FRSENDTNWD PQKEFIQFLM TNEETVDKAP PHSKIGLEKK RKRKMDVSKI
TRYTEDCFSD SNCVPNKSKM QEVDFLEQNE ELQAVDSQKY ALSKVKPEST
DEDLESVDAF QHLIYNPDKC GEESSPVHTS TFLSNTLKKK CEESDSESPA
TFSTEEPSFY PCTKCNVNFR EKKHLHRHMM YHLDGNSHFR HLNVPRPYAC
RECGRTFRDR NSLLKHMIIH QERRQKLMEE IRELKELQDE GRSARLQCPQ
CVFGTNCPKT FVQHAKTHEK DKRYYCCEEC NFMAVTENEL ECHRGIAHGA
VVKCPMVTSD IAQRKTQKKT FMKDSVVGSS KKSATYICKM CPFTTSAKSV
LKKHTEYLHS SSCVDSFGSP LGLDKRKNDI LEEPVDSDST KTLTKQQSTT
FPKNSALKQD VKRTFGSTSQ SSSFSKIHKR PHRIQKARKS IAQSGVNMCN
QNSSPHKNVT IKSSVDQKPK YFHQAAKEKS NAKANSHYLY RHKYENYRMI
KKSGESYPVH FKKEEASSLN SLHLFSSSSN SHNNFISDPH KPDAKRPESF
KDHRRVAVKR VIKESKKESS VGGEDLDSYP DFLHKMTVVV LQKLNSAEKK
DSYETEDESS WDNVELGDYT TQAIEDETYS DINQEHVNLF PLFKSKVEGQ
EPGENATLSY DQNDGFYFEY YEDTGSNNFL HEIHDPQHLE TADASLSKHS
SVFHWTDLSL EKKSCPYCPA TFETGVGLSN HVRGHLHRAG LSYEARHVVS
PEQIATSDKM QHFKRTGTGT PVKRVRKAIE KSETTSEHTC QLCGGWFDTK
IGLSNHVRGH LKRLGKTKWD AHKSPICVLN EMMQNEEKYE KILKALNSRR
IIPRPFVAQK LASSDDFISQ NVIPLEAYRN GLKTEALSVS ASEEEGLNFL
NEYDETKPEL PSGKKNQSLT LIELLKNKRM GEERNSAISP QKIHNQTARK
RFVQKCVLPL NEDSPLMYQP QKMDLTMHSA LDCKQKKSRS RSGSKKKMLT
LPHGADEVYI LRCRFCGLVF RGPLSVQEDW IKHLQRHIVN ANLPRTGAGM
VEVTSLLKKP ASITETSFSL LMAEAAS
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція , регуляція транскрипції , поліморфізм, альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку , ДНК .
Локалізований у ядрі .
Література
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A . 111 : 12432—12437. PMID 25114211 DOI :10.1073/pnas.1413825111
Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep . 10 : 1778—1791. PMID 25772364 DOI :10.1016/j.celrep.2015.02.033
Примітки
Див. також
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші