HIC2
Ідентифікатори
Символи
HIC2 , HRG22, ZBTB30, ZNF907, hypermethylated in cancer 2, HIC ZBTB transcriptional repressor 2
Зовнішні ІД
OMIM : 607712 MGI: 1929869 HomoloGene: 9020 GeneCards: HIC2
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • protein C-terminus binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• клітинне ядро
Біологічний процес
• GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 22: 21.42 – 21.45 Mb
Хр. 16: 17.05 – 17.08 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
HIC2 (англ. HIC ZBTB transcriptional repressor 2 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 615 амінокислот , а молекулярна маса — 66 156[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MVSGPLALRW CAWAGRGDMG PDMELPSHSK QLLLQLNQQR TKGFLCDVII
MVENSIFRAH KNVLAASSIY FKSLVLHDNL INLDTDMVSS TVFQQILDFI
YTGKLLPSDQ PAEPNFSTLL TAASYLQLPE LAALCRRKLK RAGKPFGSGR
AGSTGMGRPP RSQRLSTASV IQARYQGLVD GRKGAHAPQE LPQAKGSDDE
LFLGGSNQDS VQGLGRAVCP AGGEAGLGGC SSSTNGSSGG CEQELGLDLS
KKSPPLPPAT PGPHLTPDDA AQLSDSQHGS PPAASAPPVA NSASYSELGG
TPDEPMDLEG AEDNHLSLLE APGGQPRKSL RHSTRKKEWG KKEPVAGSPF
ERREAGPKGP CPGEEGEGVG DRVPNGILAS GAGPSGPYGE PPYPCKEEEE
NGKDASEDSA QSGSEGGSGH ASAHYMYRQE GYETVSYGDN LYVCIPCAKG
FPSSEQLNAH VETHTEEELF IKEEGAYETG SGGAEEEAED LSAPSAAYTA
EPRPFKCSVC EKTYKDPATL RQHEKTHWLT RPFPCNICGK MFTQRGTMTR
HMRSHLGLKP FACDECGMRF TRQYRLTEHM RVHSGEKPYE CQLCGGKFTQ
QRNLISHLRM HTSPS
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку , ДНК .
Локалізований у ядрі .
Література
Deltour S., Pinte S., Guerardel C., Leprince D. (2001). Characterization of HRG22, a human homologue of the putative tumor suppressor gene HIC1. Biochem. Biophys. Res. Commun . 287 : 427—434. PMID 11554746 DOI :10.1006/bbrc.2001.5624
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Примітки
Див. також
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші