HIVEP2
Ідентифікатори
Символи
HIVEP2 , HIV-EP2, MBP-2, MIBP1, SHN2, ZAS2, ZNF40B, human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 2, MRD43
Зовнішні ІД
OMIM : 143054 MGI: 1338076 HomoloGene: 4900 GeneCards: HIVEP2
Пов'язані генетичні захворювання
autosomal dominant non-syndromic intellectual disability 43 [ 1]
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • sequence-specific DNA binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• клітинне ядро • нуклеоплазма
Біологічний процес
• multicellular organism development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • GO:0072468 сигнальна трансдукція • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 6: 142.75 – 142.96 Mb
Хр. 10: 13.97 – 14.15 Mb
PubMed search
[ 2]
[ 3] Вікідані
HIVEP2 (англ. Human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 2 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[ 4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 446 амінокислот , а молекулярна маса — 269 053[ 5] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MDTGDTALGQ KATSRSGETD KASGRWRQEQ SAVIKMSTFG SHEGQRQPQI
EPEQIGNTAS AQLFGSGKLA SPSEVVQQVA EKQYPPHRPS PYSCQHSLSF
PQHSLPQGVM HSTKPHQSLE GPPWLFPGPL PSVASEDLFP FPIHGHSGGY
PRKKISSLNP AYSQYSQKSI EQAEEAHKKE HKPKKPGKYI CPYCSRACAK
PSVLKKHIRS HTGERPYPCI PCGFSFKTKS NLYKHRKSHA HAIKAGLVPF
TESAVSKLDL EAGFIDVEAE IHSDGEQSTD TDEESSLFAE ASDKMSPGPP
IPLDIASRGG YHGSLEESLG GPMKVPILII PKSGIPLPNE SSQYIGPDML
PNPSLNTKAD DSHTVKQKLA LRLSEKKGQD SEPSLNLLSP HSKGSTDSGY
FSRSESAEQQ ISPPNTNAKS YEEIIFGKYC RLSPRNALSV TTTSQERAAM
GRKGIMEPLP HVNTRLDVKM FEDPVSQLIP SKGDVDPSQT SMLKSTKFNS
ESRQPQIIPS SIRNEGKLYP ANFQGSNPVL LEAPVDSSPL IRSNSVPTSS
ATNLTIPPSL RGSHSFDERM TGSDDVFYPG TVGIPPQRML RRQAAFELPS
VQEGHVEVEH HGRMLKGISS SSLKEKKLSP GDRVGYDYDV CRKPYKKWED
SETPKQNYRD ISCLSSLKHG GEYFMDPVVP LQGVPSMFGT TCENRKRRKE
KSVGDEEDTP MICSSIVSTP VGIMASDYDP KLQMQEGVRS GFAMAGHENL
SHGHTERFDP CRPQLQPGSP SLVSEESPSA IDSDKMSDLG GRKPPGNVIS
VIQHTNSLSR PNSFERSESA ELVACTQDKA PSPSETCDSE ISEAPVSPEW
APPGDGAESG GKPSPSQQVQ QQSYHTQPRL VRQHNIQVPE IRVTEEPDKP
EKEKEAQSKE PEKPVEEFQW PQRSETLSQL PAEKLPPKKK RLRLADMEHS
SGESSFESTG TGLSRSPSQE SNLSHSSSFS MSFEREETSK LSALPKQDEF
GKHSEFLTVP AGSYSLSVPG HHHQKEMRRC SSEQMPCPHP AEVPEVRSKS
FDYGNLSHAP VSGAAASTVS PSRERKKCFL VRQASFSGSP EISQGEVGMD
QSVKQEQLEH LHAGLRSGWH HGPPAVLPPL QQEDPGKQVA GPCPPLSSGP
LHLAQPQIMH MDSQESLRNP LIQPTSYMTS KHLPEQPHLF PHQETIPFSP
IQNALFQFQY PTVCMVHLPA QQPPWWQAHF PHPFAQHPQK SYGKPSFQTE
IHSSYPLEHV AEHTGKKPAE YAHTKEQTYP CYSGASGLHP KNLLPKFPSD
QSSKSTETPS EQVLQEDFAS ANAGSLQSLP GTVVPVRIQT HVPSYGSVMY
TSISQILGQN SPAIVICKVD ENMTQRTLVT NAAMQGIGFN IAQVLGQHAG
LEKYPIWKAP QTLPLGLESS IPLCLPSTSD SVATLGGSKR MLSPASSLEL
FMETKQQKRV KEEKMYGQIV EELSAVELTN SDIKKDLSRP QKPQLVRQGC
ASEPKDGLQS GSSSFSSLSP SSSQDYPSVS PSSREPFLPS KEMLSGSRAP
LPGQKSSGPS ESKESSDELD IDETASDMSM SPQSSSLPAG DGQLEEEGKG
HKRPVGMLVR MASAPSGNVA DSTLLLTDMA DFQQILQFPS LRTTTTVSWC
FLNYTKPNYV QQATFKSSVY ASWCISSCNP NPSGLNTKTT LALLRSKQKI
TAEIYTLAAM HRPGTGKLTS SSAWKQFTQM KPDASFLFGS KLERKLVGNI
LKERGKGDIH GDKDIGSKQT EPIRIKIFEG GYKSNEDYVY VRGRGRGKYI
CEECGIRCKK PSMLKKHIRT HTDVRPYVCK LCNFAFKTKG NLTKHMKSKA
HMKKCLELGV SMTSVDDTET EEAENLEDLH KAAEKHSMSS ISTDHQFSDA
EESDGEDGDD NDDDDEDEDD FDDQGDLTPK TRSRSTSPQP PRFSSLPVNV
GAVPHGVPSD SSLGHSSLIS YLVTLPSIRV TQLMTPSDSC EDTQMTEYQR
LFQSKSTDSE PDKDRLDIPS CMDEECMLPS EPSSSPRDFS PSSHHSSPGY
DSSPCRDNSP KRYLIPKGDL SPRRHLSPRR DLSPMRHLSP RKEAALRREM
SQRDVSPRRH LSPRRPVSPG KDITARRDLS PRRERRYMTT IRAPSPRRAL
YHNPPLSMGQ YLQAEPIVLG PPNLRRGLPQ VPYFSLYGDQ EGAYEHPGSS
LFPEGPNDYV FSHLPLHSQQ QVRAPIPMVP VGGIQMVHSM PPALSSLHPS
PTLPLPMEGF EEKKGASGES FSKDPYVLSK QHEKRGPHAL QSSGPPSTPS
SPRLLMKQST SEDSLNATER EQEENIQTCT KAIASLRIAT EEAALLGPDQ
PARVQEPHQN PLGSAHVSIR HFSRPEPGQP CTSATHPDLH DGEKDNFGTS
QTPLAHSTFY SKSCVDDKQL DFHSSKELSS STEESKDPSS EKSQLH
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції .
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку , ДНК .
Локалізований у ядрі .
Література
Van't Veer L.J., Lutz P., Isselbacher K.J., Bernards R. (1992). Structure and expression of MBP-2: a 275 kDa zinc finger protein that binds to an enhancer of major histocompatibility complex class 1 genes. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A . 89 : 8971—8975. PMID 1409593 doi :10.1073/pnas.89.19.8971
Rustgi A.K., Van't Veer L.J., Bernards R. (1990). Two genes encode factors with NF-kappa B- and H2TF1-like DNA-binding properties. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A . 87 : 8707—8710. PMID 2247438 doi :10.1073/pnas.87.22.8707
Примітки
Див. також
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші