uk TAF6

TAF6
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	5FUR
Ідентифікатори
Символи	TAF6, MGC:8964, TAF(II)70, TAF(II)80, TAF2E, TAFII-70, TAFII-80, TAFII70, TAFII80, TAFII85, TATA-box binding protein associated factor 6, ALYUS
Зовнішні ІД	OMIM: 602955 MGI: 109129 HomoloGene: 7561 GeneCards: TAF6
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • protein heterodimerization activity; • aryl hydrocarbon receptor binding;
Клітинна компонента	• MLL1 complex; • transcription factor TFTC complex; • гіалоплазма; • клітинне ядро; • нуклеоплазма; • SAGA complex; • transcription factor TFIID complex; • SLIK (SAGA-like) complex; • GO:0009327 protein-containing complex;
Біологічний процес	• negative regulation of cell cycle; • transcription initiation from RNA polymerase II promoter; • transcription by RNA polymerase II; • regulation of DNA-binding transcription factor activity; • transcription, DNA-templated; • DNA-templated transcription, initiation; • negative regulation of cell population proliferation; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • snRNA transcription by RNA polymerase II; • regulation of signal transduction by p53 class mediator; • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization; • RNA polymerase II preinitiation complex assembly; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • GO:0097285 апоптоз;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	6878
	21343
	ENSG00000106290
	ENSMUSG00000036980
	P49848
	Q62311
NM_001190415; NM_005641; NM_139122; NM_139123; NM_139315;
	NM_001364998; NM_001364999; NM_001365000; NM_001365001; NM_001365002; NM_001365003; NM_001365004
	NM_009315; NM_001356600; NM_001356601; NM_001356602
NP_001177344; NP_005632; NP_647476; NP_001351927; NP_001351928;
	NP_001351929; NP_001351930; NP_001351931; NP_001351932; NP_001351933
	NP_033341; NP_001343529; NP_001343530; NP_001343531
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TAF6 (англ. TATA-box binding protein associated factor 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 677 амінокислот, а молекулярна маса — 72 668^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAEEKKLKLS	NTVLPSESMK	VVAESMGIAQ	IQEETCQLLT	DEVSYRIKEI
AQDALKFMHM	GKRQKLTTSD	IDYALKLKNV	EPLYGFHAQE	FIPFRFASGG
GRELYFYEEK	EVDLSDIINT	PLPRVPLDVC	LKAHWLSIEG	CQPAIPENPP
PAPKEQQKAE	ATEPLKSAKP	GQEEDGPLKG	KGQGATTADG	KGKEKKAPPL
LEGAPLRLKP	RSIHELSVEQ	QLYYKEITEA	CVGSCEAKRA	EALQSIATDP
GLYQMLPRFS	TFISEGVRVN	VVQNNLALLI	YLMRMVKALM	DNPTLYLEKY
VHELIPAVMT	CIVSRQLCLR	PDVDNHWALR	DFAARLVAQI	CKHFSTTTNN
IQSRITKTFT	KSWVDEKTPW	TTRYGSIAGL	AELGHDVIKT	LILPRLQQEG
ERIRSVLDGP	VLSNIDRIGA	DHVQSLLLKH	CAPVLAKLRP	PPDNQDAYRA
EFGSLGPLLC	SQVVKARAQA	ALQAQQVNRT	TLTITQPRPT	LTLSQAPQPG
PRTPGLLKVP	GSIALPVQTL	VSARAAAPPQ	PSPPPTKFIV	MSSSSSAPST
QQVLSLSTSA	PGSGSTTTSP	VTTTVPSVQP	IVKLVSTATT	APPSTAPSGP
GSVQKYIVVS	LPPTGEGKGG	PTSHPSPVPP	PASSPSPLSG	SALCGGKQEA
GDSPPPAPGT	PKANGSQPNS	GSPQPAP

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Cavusoglu N., Brand M., Tora L., van Dorsselaer A. (2003). Novel subunits of the TATA binding protein free TAFII-containing transcription complex identified by matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight mass spectrometry following one-dimensional gel electrophoresis. Proteomics. 3: 217—223. PMID 12601814 DOI:10.1002/pmic.200390030
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Weinzierl R.O., Ruppert S., Dynlacht B.D., Tanese N., Tjian R. (1993). Cloning and expression of Drosophila TAFII60 and human TAFII70 reveal conserved interactions with other subunits of TFIID. EMBO J. 12: 5303—5309. PMID 8262073

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11540 (англ.) . Архів оригіналу за 15 березня 2016. Процитовано 7 вересня 2017. [Архівовано 2016-03-15 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, P49848 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 7

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11540 (англ.) . Архів оригіналу за 15 березня 2016. Процитовано 7 вересня 2017. [Архівовано 2016-03-15 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, P49848 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]