NFAT5

NFAT5
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1IMH
Ідентифікатори
Символи	NFAT5, NF-AT5, NFATL1, NFATZ, OREBP, TONEBP, nuclear factor of activated T-cells 5, tonicity-responsive, nuclear factor of activated T-cells 5, nuclear factor of activated T cells 5
Зовнішні ІД	OMIM: 604708 MGI: 1859333 HomoloGene: 4811 GeneCards: NFAT5
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • chromatin binding • transcription factor binding Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • цитоплазма • гіалоплазма • transcription regulator complex Біологічний процес • regulation of calcineurin-NFAT signaling cascade • GO:0032617 творба цитокінів • GO:1901313 positive regulation of gene expression • виділення • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • calcineurin-NFAT signaling cascade • response to osmotic stress • cellular response to cytokine stimulus • positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling • positive regulation of leukocyte adhesion to vascular endothelial cell Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10725	54446
Ensembl	ENSG00000102908	ENSMUSG00000003847
UniProt	O94916	Q9WV30
RefSeq (мРНК)	NM_001113178 NM_006599 NM_138713 NM_138714 NM_173214 NM_173215 NM_001367709	NM_001286260 NM_018823 NM_133957
RefSeq (білок)	NP_001106649 NP_006590 NP_619727 NP_619728 NP_775321 NP_775322 NP_001354638	NP_001273189 NP_061293 NP_598718
Локус (UCSC)	Хр. 16: 69.57 – 69.7 Mb	Хр. 8: 108.02 – 108.11 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NFAT5 (англ. Nuclear factor of activated T-cells 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 531 амінокислот, а молекулярна маса — 165 763[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPSDFISLLS		ADLDLESPKS		LYSRESVYDL		LPKELQLPPS		RETSVASMSQ
TSGGEAGSPP		PAVVAADASS		APSSSSMGGA		CSSFTTSSSP		TIYSTSVTDS
KAMQVESCSS		AVGVSNRGVS		EKQLTSNTVQ		QHPSTPKRHT		VLYISPPPED
LLDNSRMSCQ		DEGCGLESEQ		SCSMWMEDSP		SNFSNMSTSS		YNDNTEVPRK
SRKRNPKQRP		GVKRRDCEES		NMDIFDADSA		KAPHYVLSQL		TTDNKGNSKA
GNGTLENQKG		TGVKKSPMLC		GQYPVKSEGK		ELKIVVQPET		QHRARYLTEG
SRGSVKDRTQ		QGFPTVKLEG		HNEPVVLQVF		VGNDSGRVKP		HGFYQACRVT
GRNTTPCKEV		DIEGTTVIEV		GLDPSNNMTL		AVDCVGILKL		RNADVEARIG
IAGSKKKSTR		ARLVFRVNIM		RKDGSTLTLQ		TPSSPILCTQ		PAGVPEILKK
SLHSCSVKGE		EEVFLIGKNF		LKGTKVIFQE		NVSDENSWKS		EAEIDMELFH
QNHLIVKVPP		YHDQHITLPV		SVGIYVVTNA		GRSHDVQPFT		YTPDPAAAGA
LNVNVKKEIS		SPARPCSFEE		AMKAMKTTGC		NLDKVNIIPN		ALMTPLIPSS
MIKSEDVTPM		EVTAEKRSST		IFKTTKSVGS		TQQTLENISN		IAGNGSFSSP
SSSHLPSENE		KQQQIQPKAY		NPETLTTIQT		QDISQPGTFP		AVSASSQLPN
SDALLQQATQ		FQTRETQSRE		ILQSDGTVVN		LSQLTEASQQ		QQQSPLQEQA
QTLQQQISSN		IFPSPNSVSQ		LQNTIQQLQA		GSFTGSTASG		SSGSVDLVQQ
VLEAQQQLSS		VLFSAPDGNE		NVQEQLSADI		FQQVSQIQSG		VSPGMFSSTE
PTVHTRPDNL		LPGRAESVHP		QSENTLSNQQ		QQQQQQQQVM		ESSAAMVMEM
QQSICQAAAQ		IQSELFPSTA		SANGNLQQSP		VYQQTSHMMS		ALSTNEDMQM
QCELFSSPPA		VSGNETSTTT		TQQVATPGTT		MFQTSSSGDG		EETGTQAKQI
QNSVFQTMVQ		MQHSGDNQPQ		VNLFSSTKSM		MSVQNSGTQQ		QGNGLFQQGN
EMMSLQSGNF		LQQSSHSQAQ		LFHPQNPIAD		AQNLSQETQG		SLFHSPNPIV
HSQTSTTSSE		QMQPPMFHSQ		STIAVLQGSS		VPQDQQSTNI		FLSQSPMNNL
QTNTVAQEAF		FAAPNSISPL		QSTSNSEQQA		AFQQQAPISH		IQTPMLSQEQ
AQPPQQGLFQ		PQVALGSLPP		NPMPQSQQGT		MFQSQHSIVA		MQSNSPSQEQ
QQQQQQQQQQ		QQQQQQSILF		SNQNTMATMA		SPKQPPPNMI		FNPNQNPMAN
QEQQNQSIFH		QQSNMAPMNQ		EQQPMQFQSQ		STVSSLQNPG		PTQSESSQTP
LFHSSPQIQL		VQGSPSSQEQ		QVTLFLSPAS		MSALQTSINQ		QDMQQSPLYS
PQNNMPGIQG		ATSSPQPQAT		LFHNTAGGTM		NQLQNSPGSS		QQTSGMFLFG
IQNNCSQLLT		SGPATLPDQL		MAISQPGQPQ		NEGQPPVTTL		LSQQMPENSP
LASSINTNQN		IEKIDLLVSL		QNQGNNLTGS		F

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Miyakawa H., Woo S.K., Dahl S.C., Handler J.S., Kwon H.M. (1999). Tonicity-responsive enhancer binding protein, a rel-like protein that stimulates transcription in response to hypertonicity. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96: 2538—2542. PMID 10051678 doi:10.1073/pnas.96.5.2538
• Lopez-Rodriguez C., Aramburu J., Rakeman A.S., Rao A. (1999). NFAT5, a constitutively nuclear NFAT protein that does not cooperate with Fos and Jun. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96: 7214—7219. PMID 10377394 doi:10.1073/pnas.96.13.7214
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Zuehlke C., Kiehl R., Johannsmeyer A., Grzeschik K.H., Schwinger E. (1999). Isolation and characterization of novel CAG repeat containing genes expressed in human brain. DNA Seq. 10: 1—6. PMID 10565538 doi:10.3109/10425179909033929
• Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 doi:10.1073/pnas.1413825111
• Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 doi:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7774 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
4. UniProt, O94916 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 16

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»