TAF4B

TAF4B
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1H3O, 2P6V
Ідентифікатори
Символи	TAF4B, SPGF13, TAF2C2, TAFII105, TATA-box binding protein associated factor 4b
Зовнішні ІД	OMIM: 601689 MGI: 2152345 HomoloGene: 28266 GeneCards: TAF4B
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • NF-kappaB binding • protein heterodimerization activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • transcription factor binding • GO:0000983 RNA polymerase II general transcription initiation factor activity Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро • нуклеоплазма • fibrillar center • transcription factor TFIID complex Біологічний процес • DNA-templated transcription, initiation • диференціація клітин • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • Сперматогенез • transcription, DNA-templated • Оогенез • regulation of signal transduction by p53 class mediator • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • RNA polymerase II preinitiation complex assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6875	72504
Ensembl	ENSG00000141384	ENSMUSG00000054321
UniProt	Q92750	G5E8Z2
RefSeq (мРНК)	NM_001293725 NM_005640	NM_001100449 NM_001369357 NM_001369358
RefSeq (білок)	NP_001280654 NP_005631	NP_001093919 NP_001356286 NP_001356287
Локус (UCSC)	Хр. 18: 26.23 – 26.39 Mb	Хр. 18: 14.92 – 15.03 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TAF4B (англ. TATA-box binding protein associated factor 4b) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 862 амінокислот, а молекулярна маса — 91 091[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPAGLTEPAG		AAPPAAVSAS		GTVTMAPAGA		LPVRVESTPV		ALGAVTKAPV
SVCVEPTASQ		PLRSPVGTLV		TKVAPVSAPP		KVSSGPRLPA		PQIVAVKAPN
TTTIQFPANL		QLPPGTVLIK		SNSGPLMLVS		PQQTVTRAET		TSNITSRPAV
PANPQTVKIC		TVPNSSSQLI		KKVAVTPVKK		LAQIGTTVVT		TVPKPSSVQS
VAVPTSVVTV		TPGKPLNTVT		TLKPSSLGAS		STPSNEPNLK		AENSAAVQIN
LSPTMLENVK		KCKNFLAMLI		KLACSGSQSP		EMGQNVKKLV		EQLLDAKIEA
EEFTRKLYVE		LKSSPQPHLV		PFLKKSVVAL		RQLLPNSQSF		IQQCVQQTSS
DMVIATCTTT		VTTSPVVTTT		VSSSQSEKSI		IVSGATAPRT		VSVQTLNPLA
GPVGAKAGVV		TLHSVGPTAA		TGGTTAGTGL		LQTSKPLVTS		VANTVTTVSL
QPEKPVVSGT		AVTLSLPAVT		FGETSGAAIC		LPSVKPVVSS		AGTTSDKPVI
GTPVQIKLAQ		PGPVLSQPAG		IPQAVQVKQL		VVQQPSGGNE		KQVTTISHSS
TLTIQKCGQK		TMPVNTIIPT		SQFPPASILK		QITLPGNKIL		SLQASPTQKN
RIKENVTSCF		RDEDDINDVT		SMAGVNLNEE		NACILATNSE		LVGTLIQSCK
DEPFLFIGAL		QKRILDIGKK		HDITELNSDA		VNLISQATQE		RLRGLLEKLT
AIAQHRMTTY		KASENYILCS		DTRSQLKFLE		KLDQLEKQRK		DLEEREMLLK
AAKSRSNKED		PEQLRLKQKA		KELQQLELAQ		IQHRDANLTA		LAAIGPRKKR
PLESGIEGLK		DNLLASGTSS		LTATKQLHRP		RITRICLRDL		IFCMEQEREM
KYSRALYLAL		LK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, сперматогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Wu Y., Lu Y., Hu Y., Li R. (2005). Cyclic AMP-dependent modification of gonad-selective TAF(II)105 in a human ovarian granulosa cell line. J. Cell. Biochem. 96: 751—759. PMID 16088961 doi:10.1002/jcb.20577
• Dikstein R., Zhou S., Tjian R. (1996). Human TAFII 105 is a cell type-specific TFIID subunit related to hTAFII130. Cell. 87: 137—146. PMID 8858156 doi:10.1016/S0092-8674(00)81330-6
• Wolstein O., Silkov A., Revach M., Dikstein R. (2000). Specific interaction of TAFII105 with OCA-B is involved in activation of octamer-dependent transcription. J. Biol. Chem. 275: 16459—16465. PMID 10828057 doi:10.1074/jbc.275.22.16459
• Yamit-Hezi A., Nir S., Wolstein O., Dikstein R. (2000). Interaction of TAFII105 with selected p65/RelA dimers is associated with activation of subset of NF-kappa B genes. J. Biol. Chem. 275: 18180—18187. PMID 10849440 doi:10.1074/jbc.275.24.18180
• Rashevsky-Finkel A., Silkov A., Dikstein R. (2001). A composite nuclear export signal in the TBP-associated factor TAFII105. J. Biol. Chem. 276: 44963—44969. PMID 11567023 doi:10.1074/jbc.M106112200

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11538 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
4. UniProt, Q92750 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 18

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»