MEF2D
Ідентифікатори
Символи
MEF2D , myocyte enhancer factor 2D
Зовнішні ІД
OMIM : 600663 MGI: 99533 HomoloGene: 4327 GeneCards: MEF2D
Пов'язані генетичні захворювання
мігрень [ 1]
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • protein dimerization activity • protein homodimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • histone deacetylase binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • enzyme binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• цитоплазма • внутрішньоклітинна мембранна органела • нуклеоплазма • клітинне ядро
Біологічний процес
• диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • chondrocyte differentiation • adult heart development • muscle organ development • осифікація ендохондральна • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • нейробіологія розвитку • multicellular organism development • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • osteoblast differentiation • skeletal muscle cell differentiation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0097285 апоптоз • positive regulation of vascular associated smooth muscle cell proliferation
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 1: 156.46 – 156.5 Mb
Хр. 3: 88.05 – 88.08 Mb
PubMed search
[ 2]
[ 3] Вікідані
MEF2D (англ. Myocyte enhancer factor 2D ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [ 4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 521 амінокислот , а молекулярна маса — 55 938[ 5] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MGRKKIQIQR ITDERNRQVT FTKRKFGLMK KAYELSVLCD CEIALIIFNH
SNKLFQYAST DMDKVLLKYT EYNEPHESRT NADIIETLRK KGFNGCDSPE
PDGEDSLEQS PLLEDKYRRA SEELDGLFRR YGSTVPAPNF AMPVTVPVSN
QSSLQFSNPS GSLVTPSLVT SSLTDPRLLS PQQPALQRNS VSPGLPQRPA
SAGAMLGGDL NSANGACPSP VGNGYVSARA SPGLLPVANG NSLNKVIPAK
SPPPPTHSTQ LGAPSRKPDL RVITSQAGKG LMHHLTEDHL DLNNAQRLGV
SQSTHSLTTP VVSVATPSLL SQGLPFSSMP TAYNTDYQLT SAELSSLPAF
SSPGGLSLGN VTAWQQPQQP QQPQQPQPPQ QQPPQPQQPQ PQQPQQPQQP
PQQQSHLVPV SLSNLIPGSP LPHVGAALTV TTHPHISIKS EPVSPSRERS
PAPPPPAVFP AARPEPGDGL SSPAGGSYET GDRDDGRGDF GPTLGLLRPA
PEPEAEGSAV KRMRLDTWTL K
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів , білків розвитку , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз , транскрипція , регуляція транскрипції , диференціація, нейрогенез, ацетиляція.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
Література
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Blaeser F., Ho N., Prywes R., Chatila T.A. (2000). Ca(2+)-dependent gene expression mediated by MEF2 transcription factors. J. Biol. Chem . 275 : 197—209. PMID 10617605 DOI :10.1074/jbc.275.1.197
Zhu B., Ramachandran B., Gulick T. (2005). Alternative pre-mRNA splicing governs expression of a conserved acidic transactivation domain in myocyte enhancer factor 2 factors of striated muscle and brain. J. Biol. Chem . 280 : 28749—28760. PMID 15834131 DOI :10.1074/jbc.M502491200
Gregoire S., Yang X.-J. (2005). Association with class IIa histone deacetylases upregulates the sumoylation of MEF2 transcription factors . Mol. Cell. Biol . 25 : 2273—2287. PMID 15743823 DOI :10.1128/MCB.25.6.2273-2287.2005
Zhao X., Sternsdorf T., Bolger T.A., Evans R.M., Yao T.-P. (2005). Regulation of MEF2 by histone deacetylase 4- and SIRT1 deacetylase-mediated lysine modifications . Mol. Cell. Biol . 25 : 8456—8464. PMID 16166628 DOI :10.1128/MCB.25.19.8456-8464.2005
Ma K., Chan J.K., Zhu G., Wu Z. (2005). Myocyte enhancer factor 2 acetylation by p300 enhances its DNA binding activity, transcriptional activity, and myogenic differentiation . Mol. Cell. Biol . 25 : 3575—3582. PMID 15831463 DOI :10.1128/MCB.25.9.3575-3582.2005
Примітки
Див. також
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші