GTF3C1

GTF3C1
Ідентифікатори
Символи	GTF3C1, TFIIIC, TFIIIC220, TFIIICalpha, general transcription factor IIIC subunit 1
Зовнішні ІД	OMIM: 603246 MGI: 107887 HomoloGene: 31040 GeneCards: GTF3C1
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA polymerase III general transcription initiation factor activity • RNA polymerase III type 1 promoter sequence-specific DNA binding • RNA polymerase III type 2 promoter sequence-specific DNA binding Клітинна компонента • transcription factor TFIIIC complex • ядерце • мембрана • клітинне ядро • нуклеоплазма • Рибонуклеопротеїни Біологічний процес • tRNA transcription by RNA polymerase III • rRNA transcription • tRNA transcription • transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase III • regulation of transcription by RNA polymerase III • transcription initiation from RNA polymerase III promoter • 5S class rRNA transcription by RNA polymerase III Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2975	233863
Ensembl	ENSG00000077235	ENSMUSG00000032777
UniProt	Q12789	Q8K284
RefSeq (мРНК)	NM_001286242 NM_001520	NM_207239
RefSeq (білок)	NP_001273171 NP_001511	NP_997122
Локус (UCSC)	Хр. 16: 27.46 – 27.55 Mb	Хр. 7: 125.24 – 125.31 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GTF3C1 (англ. General transcription factor IIIC subunit 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 109 амінокислот, а молекулярна маса — 238 875[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDALESLLDE		VALEGLDGLC		LPALWSRLET		RVPPFPLPLE		PCTQEFLWRA
LATHPGISFY		EEPRERPDLQ		LQDRYEEIDL		ETGILESRRD		PVALEDVYPI
HMILENKDGI		QGSCRYFKER		KNITNDIRTK		SLQPRCTMVE		AFDRWGKKLI
IVASQAMRYR		ALIGQEGDPD		LKLPDFSYCI		LERLGRSRWQ		GELQRDLHTT
AFKVDAGKLH		YHRKILNKNG		LITMQSHVIR		LPTGAQQHSI		LLLLNRFHVD
RRSKYDILME		KLSVMLSTRT		NHIETLGKLR		EELGLCERTF		KRLYQYMLNA
GLAKVVSLRL		QEIHPECGPC		KTKKGTDVMV		RCLKLLKEFK		RNDHDDDEDE
EVISKTVPPV		DIVFERDMLT		QTYDLIERRG		TKGISQAEIR		VAMNVGKLEA
RMLCRLLQRF		KVVKGFMEDE		GRQRTTKYIS		CVFAEESDLS		RQYQREKARS
ELLTTVSLAS		MQEESLLPEG		EDTFLSESDS		EEERSSSKRR		GRGSQKDTRA
SANLRPKTQP		HHSTPTKGGW		KVVNLHPLKK		QPPSFPGAAE		ERACQSLASR
DSLLDTSSVS		EPNVSFVSHC		ADSNSGDIAV		IEEVRMENPK		ESSSSLKTGR
HSSGQDKPHE		TYRLLKRRNL		IIEAVTNLRL		IESLFTIQKM		IMDQEKQEGV
STKCCKKSIV		RLVRNLSEEG		LLRLYRTTVI		QDGIKKKVDL		VVHPSMDQND
PLVRSAIEQV		RFRISNSSTA		NRVKTSQPPV		PQGEAEEDSQ		GKEGPSGSGD
SQLSASSRSE		SGRMKKSDNK		MGITPLRNYH		PIVVPGLGRS		LGFLPKMPRL
RVVHMFLWYL		IYGHPASNTV		EKPSFISERR		TIKQESGRAG		VRPSSSGSAW
EACSEAPSKG		SQDGVTWEAE		VELATETVYV		DDASWMRYIP		PIPVHRDFGF
GWALVSDILL		CLPLSIFIQI		VQVSYKVDNL		EEFLNDPLKK		HTLIRFLPRP
IRQQLLYKRR		YIFSVVENLQ		RLCYMGLLQF		GPTEKFQDKD		QVFIFLKKNA
VIVDTTICDP		HYNLARSSRP		FERRLYVLNS		MQDVENYWFD		LQCVCLNTPL
GVVRCPRVRK		NSSTDQGSDE		EGSLQKEQES		AMDKHNLERK		CAMLEYTTGS
REVVDEGLIP		GDGLGAAGLD		SSFYGHLKRN		WIWTSYIINQ		AKKENTAAEN
GLTVRLQTFL		SKRPMPLSAR		GNSRLNIWGE		ARVGSELCAG		WEEQFEVDRE
PSLDRNRRVR		GGKSQKRKRL		KKDPGKKIKR		KKKGEFPGEK		SKRLRYHDEA
DQSALQRMTR		LRVTWSMQED		GLLVLCRIAS		NVLNTKVKGP		FVTWQVVRDI
LHATFEESLD		KTSHSVGRRA		RYIVKNPQAY		LNYKVCLAEV		YQDKALVGDF
MNRRGDYDDP		KVCANEFKEF		VEKLKEKFSS		ALRNSNLEIP		DTLQELFARY
RVLAIGDEKD		QTRKEDELNS		VDDIHFLVLQ		NLIQSTLALS		DSQMKSYQSF
QTFRLYREYK		DHVLVKAFME		CQKRSLVNRR		RVNHTLGPKK		NRALPFVPMS
YQLSQTYYRI		FTWRFPSTIC		TESFQFLDRM		RAAGKLDQPD		RFSFKDQDNN
EPTNDMVAFS		LDGPGGNCVA		VLTLFSLGLI		SVDVRIPEQI		IVVDSSMVEN
EVIKSLGKDG		SLEDDEDEED		DLDEGVGGKR		RSMEVKPAQA		SHTNYLLMRG
YYSPGIVSTR		NLNPNDSIVV		NSCQMKFQLR		CTPVPARLRP		AAAPLEELTM
GTSCLPDTFT		KLINPQENTC		SLEEFVLQLE		LSGYSPEDLT		AALEILEAII
ATGCFGIDKE		ELRRRFSALE		KAGGGRTRTF		ADCIQALLEQ		HQVLEVGGNT
ARLVAMGSAW		PWLLHSVRLK		DREDADIQRE		DPQARPLEGS		SSEDSPPEGQ
APPSHSPRGT		KRRASWASEN		GETDAEGTQM		TPAKRPALQD		SNLAPSLGPG
AEDGAEAQAP		SPPPALEDTA		AAGAAQEDQE		GVGEFSSPGQ		EQLSGQAQPP
EGSEDPRGFT		ESFGAANISQ		AARERDCESV		CFIGRPWRVV		DGHLNLPVCK
GMMEAMLYHI		MTRPGIPESS		LLRHYQGVLQ		PVAVLELLQG		LESLGCIRKR
WLRKPRPVSL		FSTPVVEEVE		VPSSLDESPM		AFYEPTLDCT		LRLGRVFPHE
VNWNKWIHL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• L'Etoile N.D., Fahnestock M.L., Shen Y., Aebersold R., Berk A.J. (1994). Human transcription factor IIIC box B binding subunit. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 1652—1656. PMID 8127861 DOI:10.1073/pnas.91.5.1652
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Lagna G., Kovelman R., Sukegawa J., Roeder R.G. (1994). Cloning and characterization of an evolutionarily divergent DNA-binding subunit of mammalian TFIIIC. Mol. Cell. Biol. 14: 3053—3064. PMID 8164661 DOI:10.1128/MCB.14.5.3053
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• de Planell-Saguer M., Schroeder D.G., Rodicio M.C., Cox G.A., Mourelatos Z. (2009). Biochemical and genetic evidence for a role of IGHMBP2 in the translational machinery. Hum. Mol. Genet. 18: 2115—2126. PMID 19299493 DOI:10.1093/hmg/ddp134

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4664 (англ.) . Архів оригіналу за 16 березня 2016. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2016-03-16 у Wayback Machine.]
4. UniProt, Q12789 (англ.) . Архів оригіналу за 7 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 16

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»