ATF5
Ідентифікатори
Символи
ATF5 , ATFX, HMFN0395, activating transcription factor 5
Зовнішні ІД
OMIM : 606398 MGI: 2141857 HomoloGene: 32142 GeneCards: ATF5
Онтологія гена
Молекулярна функція
• sequence-specific DNA binding • DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • chromatin binding • tubulin binding • kinase binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• центросома • transcription regulator complex • нуклеоплазма • центр організації мікротрубочок • цитоскелет • клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма
Біологічний процес
• negative regulation of cell cycle G2/M phase transition • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • olfactory bulb interneuron differentiation • multicellular organism growth • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of apoptotic process • post-embryonic development • transcription, DNA-templated • cerebellar granule cell precursor proliferation • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • regulation of centrosome cycle • циркадний ритм • olfactory bulb interneuron development • регуляція експресії генів • olfactory lobe development • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • fat cell differentiation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of cell population proliferation • transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 19: 49.93 – 49.93 Mb
Хр. 7: 44.46 – 44.47 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
ATF5 (англ. Activating transcription factor 5 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 282 амінокислот , а молекулярна маса — 30 674[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MSLLATLGLE LDRALLPASG LGWLVDYGKL PPAPAPLAPY EVLGGALEGG
LPVGGEPLAG DGFSDWMTER VDFTALLPLE PPLPPGTLPQ PSPTPPDLEA
MASLLKKELE QMEDFFLDAP PLPPPSPPPL PPPPLPPAPS LPLSLPSFDL
PQPPVLDTLD LLAIYCRNEA GQEEVGMPPL PPPQQPPPPS PPQPSRLAPY
PHPATTRGDR KQKKRDQNKS AALRYRQRKR AEGEALEGEC QGLEARNREL
KERAESVERE IQYVKDLLIE VYKARSQRTR SC
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , ацетилювання .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у цитоплазмі , цитоскелеті , ядрі .
Література
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Pati D., Meistrich M.L., Plon S.E. (1999). Human Cdc34 and Rad6B ubiquitin-conjugating enzymes target repressors of cyclic AMP-induced transcription for proteolysis . Mol. Cell. Biol . 19 : 5001—5013. PMID 10373550 DOI :10.1128/MCB.19.7.5001
Pascual M., Gomez-Lechon M.J., Castell J.V., Jover R. (2008). ATF5 is a highly abundant liver-enriched transcription factor that cooperates with constitutive androstane receptor in the transactivation of CYP2B6: implications in hepatic stress responses. Drug Metab. Dispos . 36 : 1063—1072. PMID 18332083 DOI :10.1124/dmd.107.019380
Dluzen D., Li G., Tacelosky D., Moreau M., Liu D.X. (2011). BCL-2 is a downstream target of ATF5 that mediates the prosurvival function of ATF5 in a cell type-dependent manner. J. Biol. Chem . 286 : 7705—7713. PMID 21212266 DOI :10.1074/jbc.M110.207639
Liu D.X., Qian D., Wang B., Yang J.M., Lu Z. (2011). p300-Dependent ATF5 acetylation is essential for Egr-1 gene activation and cell proliferation and survival. Mol. Cell. Biol . 31 : 3906—3916. PMID 21791614 DOI :10.1128/MCB.05887-11
Примітки
Див. також
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші