HOXD3

HOXD3
Ідентифікатори
Символи	HOXD3, HOX1D, HOX4, HOX4A, Hox-4.1, homeobox D3
Зовнішні ІД	OMIM: 142980 MGI: 96207 HomoloGene: 5034 GeneCards: HOXD3
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding Клітинна компонента • aggresome • нуклеоплазма • клітинне ядро • ядерні тільця Біологічний процес • Сигнальний шлях Notch • glossopharyngeal nerve morphogenesis • embryonic skeletal system morphogenesis • multicellular organism development • thyroid gland development • cartilage development • GO:1901313 positive regulation of gene expression • cell-matrix adhesion • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of neuron differentiation • transcription, DNA-templated • anterior/posterior pattern specification • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3232	15434
Ensembl	ENSG00000128652	ENSMUSG00000079277
UniProt	P31249	P09027
RefSeq (мРНК)	NM_006898	NM_010468
RefSeq (білок)	NP_008829	NP_034598
Локус (UCSC)	Хр. 2: 176.14 – 176.17 Mb	Хр. 2: 74.54 – 74.58 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HOXD3 (англ. Homeobox D3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 432 амінокислот, а молекулярна маса — 45 730[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLFEQGQQAL		ELPECTMQKA		AYYENPGLFG		GYGYSKTTDT		YGYSTPHQPY
PPPAAASSLD		TDYPGSACSI		QSSAPLRAPA		HKGAELNGSC		MRPGTGNSQG
GGGGSQPPGL		NSEQQPPQPP		PPPPTLPPSS		PTNPGGGVPA		KKPKGGPNAS
SSSATISKQI		FPWMKESRQN		SKQKNSCATA		GESCEDKSPP		GPASKRVRTA
YTSAQLVELE		KEFHFNRYLC		RPRRVEMANL		LNLTERQIKI		WFQNRRMKYK
KDQKAKGILH		SPASQSPERS		PPLGGAAGHV		AYSGQLPPVP		GLAYDAPSPP
AFAKSQPNMY		GLAAYTAPLS		SCLPQQKRYA		APEFEPHPMA		SNGGGFASAN
LQGSPVYVGG		NFVESMAPAS		GPVFNLGHLS		HPSSASVDYS		CAAQIPGNHH
HGPCDPHPTY		TDLSAHHSSQ		GRLPEAPKLT		HL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Taniguchi Y., Fujii A., Moriuchi T. (1992). Cloning and sequencing of the human homeobox gene HOX4A. Biochim. Biophys. Acta. 1132: 332—334. PMID 1358204 DOI:10.1016/0167-4781(92)90173-W
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5137 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
4. UniProt, P31249 (англ.) . Архів оригіналу за 22 вересня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

• Хромосома 2

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»