ILF3

ILF3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2L33, 3P1X
Ідентифікатори
Символи	ILF3, CBTF, DRBF, DRBP76, MMP4, MPHOSPH4, MPP4, NF-AT-90, NF110, NF110b, NF90, NF90a, NF90b, NFAR, NFAR-1, NFAR2, TCP110, TCP80, interleukin enhancer binding factor 3, NFAR110, MPP4110, NFAR-2, NF90c, NFAR90, NF90ctv
Зовнішні ІД	OMIM: 603182 MGI: 1339973 HomoloGene: 7785 GeneCards: ILF3
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • DNA binding • double-stranded RNA binding • RNA binding • single-stranded RNA binding • mRNA 3'-UTR AU-rich region binding Клітинна компонента • мембрана • нуклеоплазма • мітохондрія • цитоплазма • ядерце • клітинне ядро • extracellular region • Рибонуклеопротеїни Біологічний процес • defense response to virus • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • protein phosphorylation • negative regulation of viral genome replication • negative regulation of translation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3609	16201
Ensembl	ENSG00000129351	ENSMUSG00000032178
UniProt	Q12906	Q9Z1X4
RefSeq (мРНК)	NM_001137673 NM_004516 NM_012218 NM_017620 NM_153464	NM_001042707 NM_001042708 NM_001042709 NM_001277321 NM_001277322 NM_010561
RefSeq (білок)	NP_001131145 NP_004507 NP_036350 NP_060090 NP_703194	NP_001036172 NP_001036173 NP_001036174 NP_001264250 NP_001264251 NP_034691
Локус (UCSC)	Хр. 19: 10.65 – 10.69 Mb	Хр. 9: 21.28 – 21.32 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ILF3 (англ. Interleukin enhancer binding factor 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 894 амінокислот, а молекулярна маса — 95 338[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRPMRIFVND		DRHVMAKHSS		VYPTQEELEA		VQNMVSHTER		ALKAVSDWID
EQEKGSSEQA		ESDNMDVPPE		DDSKEGAGEQ		KTEHMTRTLR		GVMRVGLVAK
GLLLKGDLDL		ELVLLCKEKP		TTALLDKVAD		NLAIQLAAVT		EDKYEILQSV
DDAAIVIKNT		KEPPLSLTIH		LTSPVVREEM		EKVLAGETLS		VNDPPDVLDR
QKCLAALASL		RHAKWFQARA		NGLKSCVIVI		RVLRDLCTRV		PTWGPLRGWP
LELLCEKSIG		TANRPMGAGE		ALRRVLECLA		SGIVMPDGSG		IYDPCEKEAT
DAIGHLDRQQ		REDITQSAQH		ALRLAAFGQL		HKVLGMDPLP		SKMPKKPKNE
NPVDYTVQIP		PSTTYAITPM		KRPMEEDGEE		KSPSKKKKKI		QKKEEKAEPP
QAMNALMRLN		QLKPGLQYKL		VSQTGPVHAP		IFTMSVEVDG		NSFEASGPSK
KTAKLHVAVK		VLQDMGLPTG		AEGRDSSKGE		DSAEETEAKP		AVVAPAPVVE
AVSTPSAAFP		SDATAEQGPI		LTKHGKNPVM		ELNEKRRGLK		YELISETGGS
HDKRFVMEVE		VDGQKFQGAG		SNKKVAKAYA		ALAALEKLFP		DTPLALDANK
KKRAPVPVRG		GPKFAAKPHN		PGFGMGGPMH		NEVPPPPNLR		GRGRGGSIRG
RGRGRGFGGA		NHGGYMNAGA		GYGSYGYGGN		SATAGYSQFY		SNGGHSGNAS
GGGGGGGGGS		SGYGSYYQGD		NYNSPVPPKH		AGKKQPHGGQ		QKPSYGSGYQ
SHQGQQQSYN		QSPYSNYGPP		QGKQKGYNHG		QGSYSYSNSY		NSPGGGGGSD
YNYESKFNYS		GSGGRSGGNS		YGSGGASYNP		GSHGGYGGGS		GGGSSYQGKQ
GGYSQSNYNS		PGSGQNYSGP		PSSYQSSQGG		YGRNADHSMN		YQYR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, противірусний захист, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Xu Y.-H., Grabowski G.A. (1999). Molecular cloning and characterization of a translational inhibitory protein that binds to coding sequences of human acid beta-glucosidase and other mRNAs. Mol. Genet. Metab. 68: 441—454. PMID 10607473 DOI:10.1006/mgme.1999.2934
• Duchange N., Pidoux J., Camus E., Sauvaget D. (2000). Alternative splicing in the human interleukin enhancer binding factor 3 (ILF3) gene. Gene. 261: 345—353. PMID 11167023 DOI:10.1016/S0378-1119(00)00495-9
• Saunders L.R., Jurecic V., Barber G.N. (2001). The 90- and 110-kDa human NFAR proteins are translated from two differentially spliced mRNAs encoded on chromosome 19p13. Genomics. 71: 256—259. PMID 11161820 DOI:10.1006/geno.2000.6423
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Matsumoto-Taniura N., Pirollet F., Monroe R., Gerace L., Westendorf J.M. (1996). Identification of novel M phase phosphoproteins by expression cloning. Mol. Biol. Cell. 7: 1455—1469. PMID 8885239 DOI:10.1091/mbc.7.9.1455
• Ting N.S.Y., Kao P.N., Chan D.W., Lintott L.G., Lees-Miller S.P. (1998). DNA-dependent protein kinase interacts with antigen receptor response element binding proteins NF90 and NF45. J. Biol. Chem. 273: 2136—2145. PMID 9442054 DOI:10.1074/jbc.273.4.2136

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з ILF3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6038 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
5. UniProt, Q12906 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 19

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»