CUX1
Ідентифікатори
Символи
CUX1 , CASP, CDP, CDP/Cut, CDP1, COY1, CUTL1, CUX, Clox, Cux/CDP, GOLIM6, Nbla10317, p100, p110, p200, p75, cut like homeobox 1, GDDI
Зовнішні ІД
OMIM : 116896 HomoloGene: 22551 GeneCards: CUX1
Онтологія гена
Молекулярна функція
• sequence-specific DNA binding • DNA binding • protein tyrosine kinase activity • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • protein-macromolecule adaptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• гіалоплазма • комплекс Ґольджі • клітинне ядро • нуклеоплазма • Golgi membrane • integral component of membrane • integral component of Golgi membrane • мембрана
Біологічний процес
• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • multicellular organism development • retrograde transport, vesicle recycling within Golgi • positive regulation of dendrite morphogenesis • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • peptidyl-tyrosine phosphorylation • Golgi vesicle transport • intra-Golgi vesicle-mediated transport
Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 7: 101.82 – 102.28 Mb
н/д
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
CUX1 (англ. Homeobox protein cut-like 1 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 505 амінокислот , а молекулярна маса — 164 187[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MLCVAGARLK RELDATATVL ANRQDESEQS RKRLIEQSRE FKKNTPEDLR
KQVAPLLKSF QGEIDALSKR SKEAEAAFLN VYKRLIDVPD PVPALDLGQQ
LQLKVQRLHD IETENQKLRE TLEEYNKEFA EVKNQEVTIK ALKEKIREYE
QTLKNQAETI ALEKEQKLQN DFAEKERKLQ ETQMSTTSKL EEAEHKVQSL
QTALEKTRTE LFDLKTKYDE ETTAKADEIE MIMTDLERAN QRAEVAQREA
ETLREQLSSA NHSLQLASQI QKAPDVEQAI EVLTRSSLEV ELAAKEREIA
QLVEDVQRLQ ASLTKLRENS ASQISQLEQQ LSAKNSTLKQ LEEKLKGQAD
YEEVKKELNI LKSMEFAPSE GAGTQDAAKP LEVLLLEKNR SLQSENAALR
ISNSDLSGSA RRKGKDQPES RRPGSLPAPP PSQLPRNPGE QASNTNGTHQ
FSPAGLSQDF FSSSLASPSL PLASTGKFAL NSLLQRQLMQ SFYSKAMQEA
GSTSMIFSTG PYSTNSISSQ SPLQQSPDVN GMAPSPSQSE SAGSVSEGEE
MDTAEIARQV KEQLIKHNIG QRIFGHYVLG LSQGSVSEIL ARPKPWNKLT
VRGKEPFHKM KQFLSDEQNI LALRSIQGRQ RENPGQSLNR LFQEVPKRRN
GSEGNITTRI RASETGSDEA IKSILEQAKR ELQVQKTAEP AQPSSASGSG
NSDDAIRSIL QQARREMEAQ QAALDPALKQ APLSQSDITI LTPKLLSTSP
MPTVSSYPPL AISLKKPSAA PEAGASALPN PPALKKEAQD APGLDPQGAA
DCAQGVLRQV KNEVGRSGAW KDHWWSAVQP ERRNAASSEE AKAEETGGGK
EKGSGGSGGG SQPRAERSQL QGPSSSEYWK EWPSAESPYS QSSELSLTGA
SRSETPQNSP LPSSPIVPMS KPTKPSVPPL TPEQYEVYMY QEVDTIELTR
QVKEKLAKNG ICQRIFGEKV LGLSQGSVSD MLSRPKPWSK LTQKGREPFI
RMQLWLNGEL GQGVLPVQGQ QQGPVLHSVT SLQDPLQQGC VSSESTPKTS
ASCSPAPESP MSSSESVKSL TELVQQPCPP IEASKDSKPP EPSDPPASDS
QPTTPLPLSG HSALSIQELV AMSPELDTYG ITKRVKEVLT DNNLGQRLFG
ETILGLTQGS VSDLLARPKP WHKLSLKGRE PFVRMQLWLN DPNNVEKLMD
MKRMEKKAYM KRRHSSVSDS QPCEPPSVGT EYSQGASPQP QHQLKKPRVV
LAPEEKEALK RAYQQKPYPS PKTIEDLATQ LNLKTSTVIN WFHNYRSRIR
RELFIEEIQA GSQGQAGASD SPSARSGRAA PSSEGDSCDG VEATEGPGSA
DTEEPKSQGE AEREEVPRPA EQTEPPPSGT PGPDDARDDD HEGGPVEGPG
PLPSPASATA TAAPAAPEDA ATSAAAAPGE GPAAPSSAPP PSNSSSSSAP
RRPSSLQSLF GLPEAAGARD SRDNPLRKKK AANLNSIIHR LEKAASREEP
IEWEF
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів , білків розвитку , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
Література
Neufeld E.J., Skalnik D.G., Lievens P.M.-J., Orkin S.H. (1992). Human CCAAT displacement protein is homologous to the Drosophila homeoprotein, cut. Nat. Genet . 1 : 50—55. PMID 1301999 DOI :10.1038/ng0492-50
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep . 10 : 1778—1791. PMID 25772364 DOI :10.1016/j.celrep.2015.02.033
Примітки
Див. також
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші