NR4A1
Наявні структури
PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
2QW4 , 3V3E , 3V3Q , 4JGV , 4KZI , 4KZJ , 4KZM , 4RZE , 4RZF , 4RZG , 4RE8 , 4REE , 4REF , 4WHF , 4WHG
Ідентифікатори
Символи
NR4A1 , GFRP1, HMR, N10, NAK-1, NGFIB, NP10, NUR77, TR3, nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, NH41
Зовнішні ІД
OMIM : 139139 MGI: 1352454 HomoloGene: 1612 GeneCards: NR4A1
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • zinc ion binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • зв'язування з іоном металу • steroid hormone receptor activity • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • glucocorticoid receptor binding
Клітинна компонента
• ядерна мембрана • нуклеоплазма • клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма • transcription regulator complex
Біологічний процес
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of endothelial cell proliferation • negative regulation of cell cycle • cellular response to fibroblast growth factor stimulus • transcription, DNA-templated • cell migration involved in sprouting angiogenesis • endothelial cell chemotaxis • cellular response to corticotropin-releasing hormone stimulus • cellular response to vascular endothelial growth factor stimulus • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • fat cell differentiation • regulation of type B pancreatic cell proliferation • GO:0072468 сигнальна трансдукція • steroid hormone mediated signaling pathway • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • intracellular receptor signaling pathway
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 12: 52.02 – 52.06 Mb
Хр. 15: 101.15 – 101.17 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
NR4A1 (англ. Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 598 амінокислот , а молекулярна маса — 64 463[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MPCIQAQYGT PAPSPGPRDH LASDPLTPEF IKPTMDLASP EAAPAAPTAL
PSFSTFMDGY TGEFDTFLYQ LPGTVQPCSS ASSSASSTSS SSATSPASAS
FKFEDFQVYG CYPGPLSGPV DEALSSSGSD YYGSPCSAPS PSTPSFQPPQ
LSPWDGSFGH FSPSQTYEGL RAWTEQLPKA SGPPQPPAFF SFSPPTGPSP
SLAQSPLKLF PSQATHQLGE GESYSMPTAF PGLAPTSPHL EGSGILDTPV
TSTKARSGAP GGSEGRCAVC GDNASCQHYG VRTCEGCKGF FKRTVQKNAK
YICLANKDCP VDKRRRNRCQ FCRFQKCLAV GMVKEVVRTD SLKGRRGRLP
SKPKQPPDAS PANLLTSLVR AHLDSGPSTA KLDYSKFQEL VLPHFGKEDA
GDVQQFYDLL SGSLEVIRKW AEKIPGFAEL SPADQDLLLE SAFLELFILR
LAYRSKPGEG KLIFCSGLVL HRLQCARGFG DWIDSILAFS RSLHSLLVDV
PAFACLSALV LITDRHGLQE PRRVEELQNR IASCLKEHVA AVAGEPQPAS
CLSRLLGKLP ELRTLCTQGL QRIFYLKLED LVPPPPIIDK IFMDTLPF
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , ацетилювання , альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку , ДНК .
Локалізований у цитоплазмі , ядрі .
Література
Nakai A., Kartha S., Sakurai A., Toback F.G., Degroot L.J. (1990). A human early response gene homologous to murine nur77 and rat NGFI-B, and related to the nuclear receptor superfamily. Mol. Endocrinol . 4 : 1438—1443. PMID 2283997 doi :10.1210/mend-4-10-1438
Chang C., Kokontis J., Liao S., Chang Y. (1989). Isolation and characterization of human TR3 receptor: a member of steroid receptor superfamily . J. Steroid Biochem . 34 : 391—395. PMID 2626032 doi :10.1016/0022-4731(89)90114-3
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi :10.1101/gr.2596504
Harant H., Lindley I.J. (2004). Negative cross-talk between the human orphan nuclear receptor Nur77/NAK-1/TR3 and nuclear factor-kappaB. Nucleic Acids Res . 32 : 5280—5290. PMID 15466594 doi :10.1093/nar/gkh856
Bondy G.P. (1991). Phorbol ester, forskolin, and serum induction of a human colon nuclear hormone receptor gene related to the NUR 77/NGFI-B genes. Cell Growth Differ . 2 : 203—208. PMID 1651101
Примітки
Див. також
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші