E4F1
Ідентифікатори
Символи
E4F1 , E4F, E4F transcription factor 1
Зовнішні ІД
OMIM : 603022 MGI: 109530 HomoloGene: 3259 GeneCards: E4F1
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • nucleic acid binding • cAMP response element binding • transferase activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• цитоплазма • веретено поділу • нуклеоплазма • клітинне ядро
Біологічний процес
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • поділ клітини • реплікація ДНК • regulation of mitotic cell cycle, embryonic • Убіквітин-залежний протеоліз • regulation of growth • клітинний цикл • проліферація • GO:0022415 viral process • regulation of cell cycle process • positive regulation of nucleic acid-templated transcription
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 16: 2.22 – 2.24 Mb
Хр. 17: 24.66 – 24.69 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
E4F1 (англ. E4F transcription factor 1 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 784 амінокислот , а молекулярна маса — 83 496[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MEGAMAVRVT AAHTAEAQAE AGREAGEGAV AAVAAALAPS GFLGLPAPFS
EEDEDDVHRC GRCQAEFTAL EDFVQHKIQK ACQRAPPEAL PATPATTALL
GQEVVPAAPG PEEPITVAHI VVEAASLAAD ISHASDLVGG GHIKEVIVAA
EAELGDGEMA EAPGSPRQQG LGLAGEGEQA QVKLLVNKDG RYVCALCHKT
FKTGSILKAH MVTHSSRKDH ECKLCGASFR TKGSLIRHHR RHTDERPYKC
SKCGKSFRES GALTRHLKSL TPCTEKIRFS VSKDVVVSKE DARAGSGAGA
AGLGTATSSV TGEPIETSPV IHLVTDAKGT VIHEVHVQMQ ELSLGMKALA
PEPPVSQELP CSSEGSRENL LHQAMQNSGI VLERAAGEEG ALEPAPAAGS
SPQPLAVAAP QLPVLEVQPL ETQVASEASA VPRTHPCPQC SETFPTAATL
EAHKRGHTGP RPFACAQCGK AFPKAYLLKK HQEVHVRERR FRCGDCGKLY
KTIAHVRGHR RVHSDERPYP CPKCGKRYKT KNAQQVHFRT HLEEKPHVCQ
FCSRGFREKG SLVRHVRHHT GEKPFKCYKC GRGFAEHGTL NRHLRTKGGC
LLEVEELLVS EDSPAAATTV LTEDPHTVLV EFSSVVADTQ EYIIEATADD
AETSEATEII EGTQTEVDSH IMKVVQQIVH QASAGHQIIV QNVTMDEETA
LGPEAAAADT ITIATPESLT EQVAMTLASA ISEGTVLAAR AGTSGTEQAT
VTMVSSEDIE ILEHAGELVI ASPEGQLEVQ TVIV
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз , репресорів , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус , транскрипція , регуляція транскрипції , клітинний цикл , поділ клітини , мітоз , убіквітинування білків, регуляція росту.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку , ДНК .
Локалізований у цитоплазмі , ядрі .
Література
Fernandes E.R., Rooney R.J. (1997). The adenovirus E1A-regulated transcription factor E4F is generated from the human homolog of nuclear factor phiAP3 . Mol. Cell. Biol . 17 : 1890—1903. PMID 9121437 doi :10.1128/MCB.17.4.1890
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi :10.1101/gr.2596504
Fernandes E.R., Zhang J.Y., Rooney R.J. (1998). Adenovirus E1A-regulated transcription factor p120E4F inhibits cell growth and induces the stabilization of the cdk inhibitor p21WAF1 . Mol. Cell. Biol . 18 : 459—467. PMID 9418893 doi :10.1128/MCB.18.1.459
Rooney R.J., Rothammer K., Fernandes E.R. (1998). Mutational analysis of p50E4F suggests that DNA binding activity is mediated through an alternative structure in a zinc finger domain that is regulated by phosphorylation. Nucleic Acids Res . 26 : 1681—1688. PMID 9512539 doi :10.1093/nar/26.7.1681
Fernandes E.R., Rooney R.J. (1999). Suppression of E1A-mediated transformation by the p50E4F transcription factor . Mol. Cell. Biol . 19 : 4739—4749. PMID 10373523 doi :10.1128/MCB.19.7.4739
Colombo R., Draetta G.F., Chiocca S. (2003). Modulation of p120E4F transcriptional activity by the Gam1 adenoviral early protein. Oncogene . 22 : 2541—2547. PMID 12730668 doi :10.1038/sj.onc.1206379
Примітки
Див. також
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші