NFYA
Ідентифікатори
Символи
NFYA , CBF-A, CBF-B, HAP2, NF-YA, nuclear transcription factor Y subunit alpha
Зовнішні ІД
OMIM : 189903 MGI: 97316 HomoloGene: 32114 GeneCards: NFYA
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • core promoter sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• CCAAT-binding factor complex • protein-DNA complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • RNA polymerase II transcription regulator complex
Біологічний процес
• GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • ритмічний процес • regulation of cholesterol biosynthetic process • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 6: 41.07 – 41.1 Mb
Хр. 17: 48.69 – 48.72 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
NFYA (англ. Nuclear transcription factor Y subunit alpha ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 347 амінокислот , а молекулярна маса — 36 877[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MEQYTANSNS STEQIVVQAG QIQQQQQGGV TAVQLQTEAQ VASASGQQVQ
TLQVVQGQPL MVQVSGGQLI TSTGQPIMVQ AVPGGQGQTI MQVPVSGTQG
LQQIQLVPPG QIQIQGGQAV QVQGQQGQTQ QIIIQQPQTA VTAGQTQTQQ
QIAVQGQQVA QTAEGQTIVY QPVNADGTIL QQVTVPVSGM ITIPAASLAG
AQIVQTGANT NTTSSGQGTV TVTLPVAGNV VNSGGMVMMV PGAGSVPAIQ
RIPLPGAEML EEEPLYVNAK QYHRILKRRQ ARAKLEAEGK IPKERRKYLH
ESRHRHAMAR KRGEGGRFFS PKEKDSPHMQ DPNQADEEAM TQIIRVS
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , біологічні ритми, альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
Література
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Becker D.M., Fikes J.D., Guarente L. (1991). A cDNA encoding a human CCAAT-binding protein cloned by functional complementation in yeast. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A . 88 : 1968—1972. PMID 2000400 DOI :10.1073/pnas.88.5.1968
Yamada K., Printz R.L., Osawa H., Granner D.K. (1999). Human ZHX1: cloning, chromosomal location, and interaction with transcription factor NF-Y. Biochem. Biophys. Res. Commun . 261 : 614—621. PMID 10441475 DOI :10.1006/bbrc.1999.1087
Yamada K., Osawa H., Granner D.K. (1999). Identification of proteins that interact with NF-YA. FEBS Lett . 460 : 41—45. PMID 10571058 DOI :10.1016/S0014-5793(99)01311-3
Lim K., Chang H.I. (2009). O-GlcNAcylation of Sp1 interrupts Sp1 interaction with NF-Y. Biochem. Biophys. Res. Commun . 382 : 593—597. PMID 19302979 DOI :10.1016/j.bbrc.2009.03.075
Примітки
Див. також
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші