uk ELK1

ELK1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1DUX
Ідентифікатори
Символи	ELK1, ETS transcription factor, ETS transcription factor ELK1
Зовнішні ІД	OMIM: 311040 MGI: 101833 HomoloGene: 3832 GeneCards: ELK1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • sequence-specific DNA binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • chromatin binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • double-stranded DNA binding; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • axon terminus; • нуклеоплазма; • soma; • дендрит (нейробіологія); • мітохондрія; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• диференціація клітин; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • response to light stimulus; • cellular response to testosterone stimulus; • response to fibroblast growth factor; • positive regulation of neuron death; • transcription, DNA-templated; • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated; • cellular response to gamma radiation; • cellular response to lipid; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription by RNA polymerase II; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	2002
	13712
	ENSG00000126767
	ENSMUSG00000009406
	P19419
	P41969
	NM_005229; NM_001114123; NM_001257168
	NM_007922
	NP_001107595; NP_001244097; NP_005220
	NP_031948
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ELK1 (англ. ELK1, ETS transcription factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 428 амінокислот, а молекулярна маса — 44 888^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDPSVTLWQF	LLQLLREQGN	GHIISWTSRD	GGEFKLVDAE	EVARLWGLRK
NKTNMNYDKL	SRALRYYYDK	NIIRKVSGQK	FVYKFVSYPE	VAGCSTEDCP
PQPEVSVTST	MPNVAPAAIH	AAPGDTVSGK	PGTPKGAGMA	GPGGLARSSR
NEYMRSGLYS	TFTIQSLQPQ	PPPHPRPAVV	LPSAAPAGAA	APPSGSRSTS
PSPLEACLEA	EEAGLPLQVI	LTPPEAPNLK	SEELNVEPGL	GRALPPEVKV
EGPKEELEVA	GERGFVPETT	KAEPEVPPQE	GVPARLPAVV	MDTAGQAGGH
AASSPEISQP	QKGRKPRDLE	LPLSPSLLGG	PGPERTPGSG	SGSGLQAPGP
ALTPSLLPTH	TLTPVLLTPS	SLPPSIHFWS	TLSPIAPRSP	AKLSFQFPSS
GSAQVHIPSI	SVDGLSTPVV	LSPGPQKP

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Harindranath N., Mills F.C., Mitchell M.P., Meindl A., Max E.E. (1998). The human elk-1 gene family: the functional gene and two processed pseudogenes embedded in the IgH locus. Gene. 221: 215—224. PMID 9795224 doi:10.1016/S0378-1119(98)00448-X
Yamauchi T., Toko M., Suga M., Hatakeyama T., Isobe M. (1999). Structural organization of the human ELK1 gene and its processed pseudogene ELK2 genes. DNA Res. 6: 21—27. PMID 10231026 doi:10.1093/dnares/6.1.21
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Janknecht R., Nordheim A. (1992). Elk-1 protein domains required for direct and SRF-assisted DNA-binding. Nucleic Acids Res. 20: 3317—3324. PMID 1630903 doi:10.1093/nar/20.13.3317
Enslen H., Tokumitsu H., Stork P.J., Davis R.J., Soderling T.R. (1996). Regulation of mitogen-activated protein kinases by a calcium/calmodulin-dependent protein kinase cascade. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93: 10803—10808. PMID 8855261 doi:10.1073/pnas.93.20.10803
Enslen H., Raingeaud J., Davis R.J. (1998). Selective activation of p38 mitogen-activated protein (MAP) kinase isoforms by the MAP kinase kinases MKK3 and MKK6. J. Biol. Chem. 273: 1741—1748. PMID 9430721 doi:10.1074/jbc.273.3.1741