uk SOX8

SOX8
Ідентифікатори
Символи	SOX8, SRY-box 8, SRY-box transcription factor 8
Зовнішні ІД	OMIM: 605923 MGI: 98370 HomoloGene: 7950 GeneCards: SOX8
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • sequence-specific DNA binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • transcription factor binding; • protein heterodimerization activity; • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• positive regulation of osteoblast proliferation; • cell fate commitment; • negative regulation of myoblast differentiation; • positive regulation of branching involved in ureteric bud morphogenesis; • male gonad development; • peripheral nervous system development; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • morphogenesis of a branching epithelium; • ureter morphogenesis; • regulation of hormone levels; • oligodendrocyte differentiation; • negative regulation of apoptotic process; • in utero embryonic development; • cell maturation; • Sertoli cell development; • transcription, DNA-templated; • metanephric nephron tubule formation; • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated; • negative regulation of photoreceptor cell differentiation; • enteric nervous system development; • renal vesicle induction; • positive regulation of kidney development; • GO:1901313 positive regulation of gene expression; • retina development in camera-type eye; • astrocyte fate commitment; • osteoblast differentiation; • neural crest cell migration; • Сперматогенез; • retinal rod cell differentiation; • skeletal muscle cell differentiation; • adipose tissue development; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • fat cell differentiation; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • positive regulation of gliogenesis; • morphogenesis of an epithelium; • central nervous system development;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	30812
	20681
	ENSG00000005513
	ENSMUSG00000024176
	P57073
	Q04886
	NM_014587
	NM_011447
	NP_055402
	NP_035577
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SOX8 (англ. SRY-box 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 446 амінокислот, а молекулярна маса — 47 314^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLDMSEARSQ	PPCSPSGTAS	SMSHVEDSDS	DAPPSPAGSE	GLGRAGVAVG
GARGDPAEAA	DERFPACIRD	AVSQVLKGYD	WSLVPMPVRG	GGGGALKAKP
HVKRPMNAFM	VWAQAARRKL	ADQYPHLHNA	ELSKTLGKLW	RLLSESEKRP
FVEEAERLRV	QHKKDHPDYK	YQPRRRKSAK	AGHSDSDSGA	ELGPHPGGGA
VYKAEAGLGD	GHHHGDHTGQ	THGPPTPPTT	PKTELQQAGA	KPELKLEGRR
PVDSGRQNID	FSNVDISELS	SEVMGTMDAF	DVHEFDQYLP	LGGPAPPEPG
QAYGGAYFHA	GASPVWAHKS	APSASASPTE	TGPPRPHIKT	EQPSPGHYGD
QPRGSPDYGS	CSGQSSATPA	APAGPFAGSQ	GDYGDLQASS	YYGAYPGYAP
GLYQYPCFHS	PRRPYASPLL	NGLALPPAHS	PTSHWDQPVY	TTLTRP

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Pfeifer D., Poulat F., Holinski-Feder E., Kooy F., Scherer G. (2000). The SOX8 gene is located within 700 kb of the tip of chromosome 16p and is deleted in a patient with ATR-16 syndrome. Genomics. 63: 108—116. PMID 10662550 DOI:10.1006/geno.1999.6060

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11203 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P57073 (англ.) . Архів оригіналу за 13 березня 2018. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 16

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11203 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, P57073 (англ.) . Архів оригіналу за 13 березня 2018. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]