AHR
Ідентифікатори
Символи
AHR , bHLHe76, aryl hydrocarbon receptor, Aryl hydrocarbon receptor, RP85
Зовнішні ІД
OMIM : 600253 MGI: 105043 HomoloGene: 1224 GeneCards: AHR
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • Hsp90 protein binding • protein dimerization activity • transcription factor binding • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity • E-box binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • TFIID-class transcription factor complex binding • transcription coactivator binding • TBP-class protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • protein homodimerization activity • sequence-specific double-stranded DNA binding
Клітинна компонента
• цитоплазма • transcription regulator complex • cytosolic aryl hydrocarbon receptor complex • nuclear aryl hydrocarbon receptor complex • клітинне ядро • aryl hydrocarbon receptor complex • гіалоплазма • нуклеоплазма • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • ритмічний процес • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • circadian regulation of gene expression • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • regulation of B cell proliferation • blood vessel development • регуляція експресії генів • xenobiotic metabolic process • клітинний цикл • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • response to toxic substance • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0097285 апоптоз • intracellular receptor signaling pathway • GO:1901555, GO:1905705 response to drug • cAMP-mediated signaling • cellular response to cAMP • cellular response to forskolin • cellular response to 2,3,7,8-tetrachlorodibenzodioxine
Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 7: 16.92 – 17.35 Mb
Хр. 12: 35.55 – 35.59 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
AHR (англ. Aryl hydrocarbon receptor ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 848 амінокислот , а молекулярна маса — 96 147[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MNSSSANITY ASRKRRKPVQ KTVKPIPAEG IKSNPSKRHR DRLNTELDRL
ASLLPFPQDV INKLDKLSVL RLSVSYLRAK SFFDVALKSS PTERNGGQDN
CRAANFREGL NLQEGEFLLQ ALNGFVLVVT TDALVFYASS TIQDYLGFQQ
SDVIHQSVYE LIHTEDRAEF QRQLHWALNP SQCTESGQGI EEATGLPQTV
VCYNPDQIPP ENSPLMERCF ICRLRCLLDN SSGFLAMNFQ GKLKYLHGQK
KKGKDGSILP PQLALFAIAT PLQPPSILEI RTKNFIFRTK HKLDFTPIGC
DAKGRIVLGY TEAELCTRGS GYQFIHAADM LYCAESHIRM IKTGESGMIV
FRLLTKNNRW TWVQSNARLL YKNGRPDYII VTQRPLTDEE GTEHLRKRNT
KLPFMFTTGE AVLYEATNPF PAIMDPLPLR TKNGTSGKDS ATTSTLSKDS
LNPSSLLAAM MQQDESIYLY PASSTSSTAP FENNFFNESM NECRNWQDNT
APMGNDTILK HEQIDQPQDV NSFAGGHPGL FQDSKNSDLY SIMKNLGIDF
EDIRHMQNEK FFRNDFSGEV DFRDIDLTDE ILTYVQDSLS KSPFIPSDYQ
QQQSLALNSS CMVQEHLHLE QQQQHHQKQV VVEPQQQLCQ KMKHMQVNGM
FENWNSNQFV PFNCPQQDPQ QYNVFTDLHG ISQEFPYKSE MDSMPYTQNF
ISCNQPVLPQ HSKCTELDYP MGSFEPSPYP TTSSLEDFVT CLQLPENQKH
GLNPQSAIIT PQTCYAGAVS MYQCQPEPQH THVGQMQYNP VLPGQQAFLN
KFQNGVLNET YPAELNNINN TQTTTHLQPL HHPSEARPFP DLTSSGFL
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів , рецепторів , активаторів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , клітинний цикл , біологічні ритми, ацетилювання.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у цитоплазмі , ядрі .
Література
Itoh S., Kamataki T. (1993). Human Ah receptor cDNA: analysis for highly conserved sequences. Nucleic Acids Res . 21 : 3578—3578. PMID 8393992 DOI :10.1093/nar/21.15.3578
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Bennett P., Ramsden D.B., Williams A.C. (1996). Complete structural characterisation of the human aryl hydrocarbon receptor gene. Clin. Mol. Pathol . 49 : M12—M16. PMID 16696038 DOI :10.1136/mp.49.1.M12
Nguyen T.A., Hoivik D., Lee J.-E., Safe S. (1999). Interactions of nuclear receptor coactivator/corepressor proteins with the aryl hydrocarbon receptor complex. Arch. Biochem. Biophys. 367 : 250—257. PMID 10395741 DOI :10.1006/abbi.1999.1282
Puga A., Xia Y., Elferink C. (2002). Role of the aryl hydrocarbon receptor in cell cycle regulation. Chem. Biol. Interact . 141 : 117—130. PMID 12213388 DOI :10.1016/S0009-2797(02)00069-8
Antenos M., Casper R.F., Brown T.J. (2002). Interaction with Nedd8, a ubiquitin-like protein, enhances the transcriptional activity of the aryl hydrocarbon receptor. J. Biol. Chem . 277 : 44028—44034. PMID 12215427 DOI :10.1074/jbc.M202413200
Примітки
Див. також
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші