NFIC
Ідентифікатори
Символи
NFIC , CTF, CTF5, NF-I, NFI, nuclear factor I C
Зовнішні ІД
OMIM : 600729 MGI: 109591 HomoloGene: 4088 GeneCards: NFIC
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • double-stranded DNA binding • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• внутрішньоклітинний • клітинне ядро • fibrillar center
Біологічний процес
• odontogenesis of dentin-containing tooth • реплікація ДНК • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 19: 3.31 – 3.47 Mb
Хр. 10: 81.23 – 81.29 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
NFIC (англ. Nuclear factor I C ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 508 амінокислот , а молекулярна маса — 55 675[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MYSSPLCLTQ DEFHPFIEAL LPHVRAFAYT WFNLQARKRK YFKKHEKRMS
KDEERAVKDE LLGEKPEVKQ KWASRLLAKL RKDIRPECRE DFVLSITGKK
APGCVLSNPD QKGKMRRIDC LRQADKVWRL DLVMVILFKG IPLESTDGER
LVKAAQCGHP VLCVQPHHIG VAVKELDLYL AYFVRERDAE QSGSPRTGMG
SDQEDSKPIT LDTTDFQESF VTSGVFSVTE LIQVSRTPVV TGTGPNFSLG
ELQGHLAYDL NPASTGLRRT LPSTSSSGSK RHKSGSMEED VDTSPGGDYY
TSPSSPTSSS RNWTEDMEGG ISSPVKKTEM DKSPFNSPSP QDSPRLSSFT
QHHRPVIAVH SGIARSPHPS SALHFPTTSI LPQTASTYFP HTAIRYPPHL
NPQDPLKDLV SLACDPASQQ PGPLNGSGQL KMPSHCLSAQ MLAPPPPGLP
RLALPPATKP ATTSEGGATS PTSPSYSPPD TSPANRSFVG LGPRDPAGIY
QAQSWYLG
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , реплікація ДНК , ацетилювання , альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
Література
Santoro C., Mermod N., Andrews P.C., Tjian R. (1988). A family of human CCAAT-box-binding proteins active in transcription and DNA replication: cloning and expression of multiple cDNAs. Nature . 334 : 218—224. PMID 3398920 DOI :10.1038/334218a0
Wenzelides S., Altmann S., Wendler W., Winnacker E.L. (1996). CTF5 -- a new transcriptional activator of the NFI/CTF family. Nucleic Acids Res . 24 : 2416—2421. PMID 8710515 DOI :10.1093/nar/24.12.2416
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Примітки
Див. також
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші