NFATC1

NFATC1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1A66, 1NFA
Ідентифікатори
Символи	NFATC1, NF-ATC, NFAT2, NFATc, NF-ATc1.2, nuclear factor of activated T-cells 1, nuclear factor of activated T cells 1
Зовнішні ІД	OMIM: 600489 MGI: 102469 HomoloGene: 32336 GeneCards: NFATC1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • mitogen-activated protein kinase p38 binding • FK506 binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • chromatin binding • transcription factor binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • клітинне ядро • нуклеоплазма • ядерні тільця • transcription regulator complex Біологічний процес • GO:0007243 intracellular signal transduction • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • calcineurin-NFAT signaling cascade • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • Fc-epsilon receptor signaling pathway • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • Wnt signaling pathway, calcium modulating pathway • negative regulation of Wnt signaling pathway • negative regulation of vascular associated smooth muscle cell differentiation • GO:0032617 творба цитокінів • aortic valve morphogenesis • pulmonary valve morphogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4772	18018
Ensembl	ENSG00000131196	ENSMUSG00000033016
UniProt	O95644	O88942
RefSeq (мРНК)	NM_172390 NM_001278669 NM_001278670 NM_001278672 NM_001278673 NM_001278675 NM_006162 NM_172387 NM_172388 NM_172389	NM_001164109 NM_001164110 NM_001164111 NM_001164112 NM_016791 NM_198429
RefSeq (білок)	NP_001265598 NP_001265599 NP_001265601 NP_001265602 NP_001265604 NP_006153 NP_765975 NP_765976 NP_765977 NP_765978	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 18: 79.4 – 79.53 Mb	Хр. 18: 80.65 – 80.76 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NFATC1 (англ. Nuclear factor of activated T-cells 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 943 амінокислот, а молекулярна маса — 101 243[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPSTSFPVPS		KFPLGPAAAV		FGRGETLGPA		PRAGGTMKSA		EEEHYGYASS
NVSPALPLPT		AHSTLPAPCH		NLQTSTPGII		PPADHPSGYG		AALDGGPAGY
FLSSGHTRPD		GAPALESPRI		EITSCLGLYH		NNNQFFHDVE		VEDVLPSSKR
SPSTATLSLP		SLEAYRDPSC		LSPASSLSSR		SCNSEASSYE		SNYSYPYASP
QTSPWQSPCV		SPKTTDPEEG		FPRGLGACTL		LGSPRHSPST		SPRASVTEES
WLGARSSRPA		SPCNKRKYSL		NGRQPPYSPH		HSPTPSPHGS		PRVSVTDDSW
LGNTTQYTSS		AIVAAINALT		TDSSLDLGDG		VPVKSRKTTL		EQPPSVALKV
EPVGEDLGSP		PPPADFAPED		YSSFQHIRKG		GFCDQYLAVP		QHPYQWAKPK
PLSPTSYMSP		TLPALDWQLP		SHSGPYELRI		EVQPKSHHRA		HYETEGSRGA
VKASAGGHPI		VQLHGYLENE		PLMLQLFIGT		ADDRLLRPHA		FYQVHRITGK
TVSTTSHEAI		LSNTKVLEIP		LLPENSMRAV		IDCAGILKLR		NSDIELRKGE
TDIGRKNTRV		RLVFRVHVPQ		PSGRTLSLQV		ASNPIECSQR		SAQELPLVEK
QSTDSYPVVG		GKKMVLSGHN		FLQDSKVIFV		EKAPDGHHVW		EMEAKTDRDL
CKPNSLVVEI		PPFRNQRITS		PVHVSFYVCN		GKRKRSQYQR		FTYLPANVPI
IKTEPTDDYE		PAPTCGPVSQ		GLSPLPRPYY		SQQLAMPPDP		SSCLVAGFPP
CPQRSTLMPA		APGVSPKLHD		LSPAAYTKGV		ASPGHCHLGL		PQPAGEAPAV
QDVPRPVATH		PGSPGQPPPA		LLPQQVSAPP		SSSCPPGLEH		SLCPSSPSPP
LPPATQEPTC		LQPCSPACPP		ATGRPQHLPS		TVRRDESPTA		GPRLLPEVHE
DGSPNLAPIP		VTVKREPEEL		DQLYLDDVNE		IIRNDLSSTS		THS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Park J., Takeuchi A., Sharma S. (1996). Characterization of a new isoform of the NFAT (nuclear factor of activated T cells) gene family member NFATc. J. Biol. Chem. 271: 20914—20921. PMID 8702849 doi:10.1074/jbc.271.34.20914
• Vihma H., Pruunsild P., Timmusk T. (2008). Alternative splicing and expression of human and mouse NFAT genes. Genomics. 92: 279—291. PMID 18675896 doi:10.1016/j.ygeno.2008.06.011
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Lyakh L., Ghosh P., Rice N.R. (1997). Expression of NFAT-family proteins in normal human T cells. Mol. Cell. Biol. 17: 2475—2484. PMID 9111316 doi:10.1128/MCB.17.5.2475
• Beals C.R., Sheridan C.M., Turck C.W., Gardner P., Crabtree G.R. (1997). Nuclear export of NF-ATc enhanced by glycogen synthase kinase-3. Science. 275: 1930—1934. PMID 9072970 doi:10.1126/science.275.5308.1930
• Crabtree G.R. (1999). Generic signals and specific outcomes: signaling through Ca2+, calcineurin, and NF-AT. Cell. 96: 611—614. PMID 10089876 doi:10.1016/S0092-8674(00)80571-1

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7775 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
4. UniProt, O95644 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 18

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»