CNBP
|
---|
|
Ідентифікатори
|
---|
Символи
| CNBP, CNBP1, DM2, PROMM, RNF163, ZCCHC22, ZNF9, CCHC-type zinc finger nucleic acid binding protein |
---|
Зовнішні ІД |
OMIM: 116955 MGI: 88431 HomoloGene: 2567 GeneCards: CNBP
|
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція |
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • zinc ion binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • зв'язування з іоном металу • DNA binding • single-stranded DNA binding • single-stranded RNA binding • RNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • mRNA binding • translation regulator activity
|
---|
Клітинна компонента |
• клітинне ядро • цитоплазма • ендоплазматичний ретикулум • гіалоплазма
|
---|
Біологічний процес |
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • cholesterol biosynthetic process • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of cell population proliferation • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of cytoplasmic translation
|
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних
|
Ортологи |
---|
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
---|
Ensembl |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 3: 129.17 – 129.18 Mb
| Хр. 6: 87.82 – 87.83 Mb
|
---|
PubMed search |
[1]
| [2] |
---|
Вікідані |
|
CNBP (англ. CCHC-type zinc finger nucleic acid binding protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 177 амінокислот, а молекулярна маса — 19 463[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSSNECFKCG | | RSGHWARECP | | TGGGRGRGMR | | SRGRGGFTSD | | RGFQFVSSSL |
PDICYRCGES | | GHLAKDCDLQ | | EDACYNCGRG | | GHIAKDCKEP | | KREREQCCYN |
CGKPGHLARD | | CDHADEQKCY | | SCGEFGHIQK | | DCTKVKCYRC | | GETGHVAINC |
SKTSEVNCYR | | CGESGHLARE | | CTIEATA |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетиляція, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК.
Локалізований у цитоплазмі, ендоплазматичному ретикулумі.
Література
Примітки
Див. також
|
---|
(1) Основні домени |
---|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
(1.4) NF-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
підродина 2 | |
---|
підродина 3 | |
---|
підродина 4 | |
---|
підродина 5 | |
---|
підродина 6 | |
---|
підродина 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
(3.1) Гомеобокс | |
---|
(3.2) Парний бокс | |
---|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
(3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
(3.5) Триптофановий кластер | |
---|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
(4.1) RHR | |
---|
(4.2) STAT | |
---|
(4.3) p53 | |
---|
(4.4) MADS | |
---|
(4.6) TATA | |
---|
(4.7) Високомобільна група | |
---|
(4.9) Grainyhead | |
---|
(4.10) Домен холодового шоку | |
---|
(4.11) Runt | |
---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
(0.2) HMGI(Y) | |
---|
(0.3) Pocket домен | |
---|
(0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
(0.6) Інші | |
---|
|
|