ETV4
Ідентифікатори
Символи
ETV4 , E1A-F, E1AF, PEA3, PEAS3, ETS variant 4, ETS variant transcription factor 4
Зовнішні ІД
OMIM : 600711 MGI: 99423 HomoloGene: 1504 GeneCards: ETV4
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• нуклеоплазма • ядерце • клітинне ядро
Біологічний процес
• диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 17: 43.53 – 43.58 Mb
Хр. 11: 101.66 – 101.68 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
ETV4 (англ. ETS variant 4 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 484 амінокислот , а молекулярна маса — 53 938[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MERRMKAGYL DQQVPYTFSS KSPGNGSLRE ALIGPLGKLM DPGSLPPLDS
EDLFQDLSHF QETWLAEAQV PDSDEQFVPD FHSENLAFHS PTTRIKKEPQ
SPRTDPALSC SRKPPLPYHH GEQCLYSSAY DPPRQIAIKS PAPGALGQSP
LQPFPRAEQR NFLRSSGTSQ PHPGHGYLGE HSSVFQQPLD ICHSFTSQGG
GREPLPAPYQ HQLSEPCPPY PQQSFKQEYH DPLYEQAGQP AVDQGGVNGH
RYPGAGVVIK QEQTDFAYDS DVTGCASMYL HTEGFSGPSP GDGAMGYGYE
KPLRPFPDDV CVVPEKFEGD IKQEGVGAFR EGPPYQRRGA LQLWQFLVAL
LDDPTNAHFI AWTGRGMEFK LIEPEEVARL WGIQKNRPAM NYDKLSRSLR
YYYEKGIMQK VAGERYVYKF VCEPEALFSL AFPDNQRPAL KAEFDRPVSE
EDTVPLSHLD ESPAYLPELA GPAQPFGPKG GYSY
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
Література
Coutte L., Monte D., Baert J.-L., de Launoit Y. (1999). Genomic organization of the human e1af gene, a member of Ets transcription factors. Gene . 240 : 201—207. PMID 10564827 doi :10.1016/S0378-1119(99)00400-X
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi :10.1101/gr.2596504
Higashino F., Yoshida K., Fujinaga K., Kamio K., Fujinaga K. (1993). Isolation of a cDNA encoding the adenovirus E1A enhancer binding protein: a new human member of the ets oncogene family. Nucleic Acids Res . 21 : 547—553. PMID 8441666 doi :10.1093/nar/21.3.547
Guo B., Sharrocks A.D. (2009). Extracellular signal-regulated kinase mitogen-activated protein kinase signaling initiates a dynamic interplay between sumoylation and ubiquitination to regulate the activity of the transcriptional activator PEA3 . Mol. Cell. Biol . 29 : 3204—3218. PMID 19307308 doi :10.1128/MCB.01128-08
Примітки
Див. також
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші