HOXD8

HOXD8
Ідентифікатори
Символи	HOXD8, HOX4, HOX4E, HOX5.4, homeobox D8
Зовнішні ІД	OMIM: 142985 MGI: 96209 HomoloGene: 10473 GeneCards: HOXD8
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • anterior/posterior pattern specification • multicellular organism development • anterior/posterior axis specification, embryo • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • skeletal system morphogenesis • transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3234	15437
Ensembl	ENSG00000175879	ENSMUSG00000027102
UniProt	P13378	P23463
RefSeq (мРНК)	NM_019558 NM_001199746 NM_001199747	NM_001290730 NM_001290731 NM_008276
RefSeq (білок)	NP_001186675 NP_001186676 NP_062458	NP_001277659 NP_001277660 NP_032302
Локус (UCSC)	Хр. 2: 176.13 – 176.13 Mb	Хр. 2: 74.53 – 74.54 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HOXD8 (англ. Homeobox D8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 290 амінокислот, а молекулярна маса — 31 911[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSSYFVNPLY		SKYKAAAAAA		AAAGEAINPT		YYDCHFAPEV		GGRHAAAAAA
LQLYGNSAAG		FPHAPPQAHA		HPHPSPPPSG		TGCGGREGRG		QEYFHPGGGS
PAAAYQAAPP		PPPHPPPPPP		PPPCGGIACH		GEPAKFYGYD		NLQRQPIFTT
QQEAELVQYP		DCKSSSGNIG		EDPDHLNQSS		SPSQMFPWMR		PQAAPGRRRG
RQTYSRFQTL		ELEKEFLFNP		YLTRKRRIEV		SHALALTERQ		VKIWFQNRRM
KWKKENNKDK		FPVSRQEVKD		GETKKEAQEL		EEDRAEGLTN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5139 (англ.) . Архів оригіналу за 6 квітня 2016. Процитовано 28 серпня 2017. [Архівовано 2016-04-06 у Wayback Machine.]
4. UniProt, P13378 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

• Хромосома 2

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»