ZNF638 (англ. Zinc finger protein 638) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 978 амінокислот, а молекулярна маса — 220 625[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSRPRFNPRG | | DFPLQRPRAP | | NPSGMRPPGP | | FMRPGSMGLP | | RFYPAGRARG |
IPHRFAGHES | | YQNMGPQRMN | | VQVTQHRTDP | | RLTKEKLDFH | | EAQQKKGKPH |
GSRWDDEPHI | | SASVAVKQSS | | VTQVTEQSPK | | VQSRYTKESA | | SSILASFGLS |
NEDLEELSRY | | PDEQLTPENM | | PLILRDIRMR | | KMGRRLPNLP | | SQSRNKETLG |
SEAVSSNVID | | YGHASKYGYT | | EDPLEVRIYD | | PEIPTDEVEN | | EFQSQQNISA |
SVPNPNVICN | | SMFPVEDVFR | | QMDFPGESSN | | NRSFFSVESG | | TKMSGLHISG |
GQSVLEPIKS | | VNQSINQTVS | | QTMSQSLIPP | | SMNQQPFSSE | | LISSVSQQER |
IPHEPVINSS | | NVHVGSRGSK | | KNYQSQADIP | | IRSPFGIVKA | | SWLPKFSHAD |
AQKMKRLPTP | | SMMNDYYAAS | | PRIFPHLCSL | | CNVECSHLKD | | WIQHQNTSTH |
IESCRQLRQQ | | YPDWNPEILP | | SRRNEGNRKE | | NETPRRRSHS | | PSPRRSRRSS |
SSHRFRRSRS | | PMHYMYRPRS | | RSPRICHRFI | | SRYRSRSRSR | | SPYRIRNPFR |
GSPKCFRSVS | | PERMSRRSVR | | SSDRKKALED | | VVQRSGHGTE | | FNKQKHLEAA |
DKGHSPAQKP | | KTSSGTKPSV | | KPTSATKSDS | | NLGGHSIRCK | | SKNLEDDTLS |
ECKQVSDKAV | | SLQRKLRKEQ | | SLHYGSVLLI | | TELPEDGCTE | | EDVRKLFQPF |
GKVNDVLIVP | | YRKEAYLEME | | FKEAITAIMK | | YIETTPLTIK | | GKSVKICVPG |
KKKAQNKEVK | | KKTLESKKVS | | ASTLKRDADA | | SKAVEIVTST | | SAAKTGQAKA |
SVAKVNKSTG | | KSASSVKSVV | | TVAVKGNKAS | | IKTAKSGGKK | | SLEAKKTGNV |
KNKDSNKPVT | | IPENSEIKTS | | IEVKATENCA | | KEAISDAALE | | ATENEPLNKE |
TEEMCVMLVS | | NLPNKGYSVE | | EVYDLAKPFG | | GLKDILILSS | | HKKAYIEINR |
KAAESMVKFY | | TCFPVLMDGN | | QLSISMAPEN | | MNIKDEEAIF | | ITLVKENDPE |
ANIDTIYDRF | | VHLDNLPEDG | | LQCVLCVGLQ | | FGKVDHHVFI | | SNRNKAILQL |
DSPESAQSMY | | SFLKQNPQNI | | GDHMLTCSLS | | PKIDLPEVQI | | EHDPELEKES |
PGLKNSPIDE | | SEVQTATDSP | | SVKPNELEEE | | STPSIQTETL | | VQQEEPCEEE |
AEKATCDSDF | | AVETLELETQ | | GEEVKEEIPL | | VASASVSIEQ | | FTENAEECAL |
NQQMFNSDLE | | KKGAEIINPK | | TALLPSDSVF | | AEERNLKGIL | | EESPSEAEDF |
ISGITQTMVE | | AVAEVEKNET | | VSEILPSTCI | | VTLVPGIPTG | | DEKTVDKKNI |
SEKKGNMDEK | | EEKEFNTKET | | RMDLQIGTEK | | AEKNEGRMDA | | EKVEKMAAMK |
EKPAENTLFK | | AYPNKGVGQA | | NKPDETSKTS | | ILAVSDVSSS | | KPSIKAVIVS |
SPKAKATVSK | | TENQKSFPKS | | VPRDQINAEK | | KLSAKEFGLL | | KPTSARSGLA |
ESSSKFKPTQ | | SSLTRGGSGR | | ISALQGKLSK | | LDYRDITKQS | | QETEARPSIM |
KRDDSNNKTL | | AEQNTKNPKS | | TTGRSSKSKE | | EPLFPFNLDE | | FVTVDEVIEE |
VNPSQAKQNP | | LKGKRKETLK | | NVPFSELNLK | | KKKGKTSTPR | | GVEGELSFVT |
LDEIGEEEDA | | AAHLAQALVT | | VDEVIDEEEL | | NMEEMVKNSN | | SLFTLDELID |
QDDCISHSEP | | KDVTVLSVAE | | EQDLLKQERL | | VTVDEIGEVE | | ELPLNESADI |
TFATLNTKGN | | EGDTVRDSIG | | FISSQVPEDP | | STLVTVDEIQ | | DDSSDLHLVT |
LDEVTEEDED | | SLADFNNLKE | | ELNFVTVDEV | | GEEEDGDNDL | | KVELAQSKND |
HPTDKKGNRK | | KRAVDTKKTK | | LESLSQVGPV | | NENVMEEDLK | | TMIERHLTAK |
TPTKRVRIGK | | TLPSEKAVVT | | EPAKGEEAFQ | | MSEVDEESGL | | KDSEPERKRK |
KTEDSSSGKS | | VASDVPEELD | | FLVPKAGFFC | | PICSLFYSGE | | KAMTNHCKST |
RHKQNTEKFM | | AKQRKEKEQN | | EAEERSSR |
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК, РНК.
Локалізований у ядрі.
Література
Примітки
Див. також
|
---|
(1) Основні домени |
---|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
(1.4) NF-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
підродина 2 | |
---|
підродина 3 | |
---|
підродина 4 | |
---|
підродина 5 | |
---|
підродина 6 | |
---|
підродина 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
(3.1) Гомеобокс | |
---|
(3.2) Парний бокс | |
---|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
(3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
(3.5) Триптофановий кластер | |
---|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
(4.1) RHR | |
---|
(4.2) STAT | |
---|
(4.3) p53 | |
---|
(4.4) MADS | |
---|
(4.6) TATA | |
---|
(4.7) Високомобільна група | |
---|
(4.9) Grainyhead | |
---|
(4.10) Домен холодового шоку | |
---|
(4.11) Runt | |
---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
(0.2) HMGI(Y) | |
---|
(0.3) Pocket домен | |
---|
(0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
(0.6) Інші | |
---|
|
|