TEAD4
Ідентифікатори
Символи
TEAD4 , EFTR-2, RTEF1, TCF13L1, TEF-3, TEF3, TEFR-1, hRTEF-1B, TEA domain transcription factor 4
Зовнішні ІД
OMIM : 601714 MGI: 106907 HomoloGene: 74463 GeneCards: TEAD4
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• нуклеоплазма • transcription regulator complex • клітинне ядро
Біологічний процес
• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • skeletal system development • muscle organ development • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • hippo signaling • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • embryonic organ development
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 12: 2.96 – 3.04 Mb
Хр. 6: 128.2 – 128.28 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
TEAD4 (англ. TEA domain transcription factor 4 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 434 амінокислот , а молекулярна маса — 48 329[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MEGTAGTITS NEWSSPTSPE GSTASGGSQA LDKPIDNDAE GVWSPDIEQS
FQEALAIYPP CGRRKIILSD EGKMYGRNEL IARYIKLRTG KTRTRKQVSS
HIQVLARRKA REIQAKLKDQ AAKDKALQSM AAMSSAQIIS ATAFHSSMAL
ARGPGRPAVS GFWQGALPGQ AGTSHDVKPF SQQTYAVQPP LPLPGFESPA
GPAPSPSAPP APPWQGRSVA SSKLWMLEFS AFLEQQQDPD TYNKHLFVHI
GQSSPSYSDP YLEAVDIRQI YDKFPEKKGG LKDLFERGPS NAFFLVKFWA
DLNTNIEDEG SSFYGVSSQY ESPENMIITC STKVCSFGKQ VVEKVETEYA
RYENGHYSYR IHRSPLCEYM INFIHKLKHL PEKYMMNSVL ENFTILQVVT
NRDTQETLLC IAYVFEVSAS EHGAQHHIYR LVKE
Кодований геном білок за функцією належить до активаторів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
Література
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Jacquemin P., Hwang J.-J., Martial J.A., Dolle P., Davidson I. (1996). A novel family of developmentally regulated mammalian transcription factors containing the TEA/ATTS DNA binding domain. J. Biol. Chem . 271 : 21775—21785. PMID 8702974 DOI :10.1074/jbc.271.36.21775
Примітки
Див. також
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші