TAF5

TAF5
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2NXP
Ідентифікатори
Символи	TAF5, TAF2D, TAFII100, TAF(II)100, TAFII-100, TATA-box binding protein associated factor 5
Зовнішні ІД	OMIM: 601787 MGI: 2442144 HomoloGene: 5064 GeneCards: TAF5
Онтологія гена Молекулярна функція • protein dimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • histone acetyltransferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • GO:0000983 RNA polymerase II general transcription initiation factor activity Клітинна компонента • ядерце • actin cytoskeleton • клітинне ядро • transcription factor TFTC complex • transcription factor TFIID complex • нуклеоплазма Біологічний процес • transcription, DNA-templated • DNA-templated transcription, initiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • snRNA transcription by RNA polymerase II • regulation of signal transduction by p53 class mediator • histone acetylation • GO:0022415 viral process • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6877	226182
Ensembl	ENSG00000148835	ENSMUSG00000025049
UniProt	Q15542	Q8C092
RefSeq (мРНК)	NM_006951 NM_139052	NM_177342
RefSeq (білок)	NP_008882 NP_620640	NP_796316
Локус (UCSC)	Хр. 10: 103.37 – 103.39 Mb	Хр. 19: 47.06 – 47.07 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TAF5 (англ. TATA-box binding protein associated factor 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 800 амінокислот, а молекулярна маса — 86 830[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAALAEEQTE		VAVKLEPEGP		PTLLPPQAGD		GAGEGSGGTT		NNGPNGGGGN
VAASSSTGGD		GGTPKPTVAV		SAAAPAGAAP		VPAAAPDAGA		PHDRQTLLAV
LQFLRQSKLR		EAEEALRREA		GLLEEAVAGS		GAPGEVDSAG		AEVTSALLSR
VTASAPGPAA		PDPPGTGASG		ATVVSGSASG		PAAPGKVGSV		AVEDQPDVSA
VLSAYNQQGD		PTMYEEYYSG		LKHFIECSLD		CHRAELSQLF		YPLFVHMYLE
LVYNQHENEA		KSFFEKFHGD		QECYYQDDLR		VLSSLTKKEH		MKGNETMLDF
RTSKFVLRIS		RDSYQLLKRH		LQEKQNNQIW		NIVQEHLYID		IFDGMPRSKQ
QIDAMVGSLA		GEAKREANKS		KVFFGLLKEP		EIEVPLDDED		EEGENEEGKP
KKKKPKKDSI		GSKSKKQDPN		APPQNRIPLP		ELKDSDKLDK		IMNMKETTKR
VRLGPDCLPS		ICFYTFLNAY		QGLTAVDVTD		DSSLIAGGFA		DSTVRVWSVT
PKKLRSVKQA		SDLSLIDKES		DDVLERIMDE		KTASELKILY		GHSGPVYGAS
FSPDRNYLLS		SSEDGTVRLW		SLQTFTCLVG		YKGHNYPVWD		TQFSPYGYYF
VSGGHDRVAR		LWATDHYQPL		RIFAGHLADV		NCTRFHPNSN		YVATGSADRT
VRLWDVLNGN		CVRIFTGHKG		PIHSLTFSPN		GRFLATGATD		GRVLLWDIGH
GLMVGELKGH		TDTVCSLRFS		RDGEILASGS		MDNTVRLWDA		IKAFEDLETD
DFTTATGHIN		LPENSQELLL		GTYMTKSTPV		VHLHFTRRNL		VLAAGAYSPQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• Tanese N., Saluja D., Vassallo M.F., Chen J.-L., Admon A. (1996). Molecular cloning and analysis of two subunits of the human TFIID complex: hTAFII130 and hTAFII100. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93: 13611—13616. PMID 8942982 DOI:10.1073/pnas.93.24.13611
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Damania B., Alwine J.C. (1996). TAF-like function of SV40 large T antigen. Genes Dev. 10: 1369—1381. PMID 8647434 DOI:10.1101/gad.10.11.1369
• Brand M., Yamamoto K., Staub A., Tora L. (1999). Identification of TATA-binding protein-free TAFII-containing complex subunits suggests a role in nucleosome acetylation and signal transduction. J. Biol. Chem. 274: 18285—18289. PMID 10373431 DOI:10.1074/jbc.274.26.18285
• Cavusoglu N., Brand M., Tora L., van Dorsselaer A. (2003). Novel subunits of the TATA binding protein free TAFII-containing transcription complex identified by matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight mass spectrometry following one-dimensional gel electrophoresis. Proteomics. 3: 217—223. PMID 12601814 DOI:10.1002/pmic.200390030
• Bhattacharya S., Takada S., Jacobson R.H. (2007). Structural analysis and dimerization potential of the human TAF5 subunit of TFIID. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 104: 1189—1194. PMID 17227857 DOI:10.1073/pnas.0610297104

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11539 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
4. UniProt, Q15542 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 10

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»