TCF3

TCF3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2MH0, 2YPA, 2YPB, 3U5V
Ідентифікатори
Символи	TCF3, E2A, E47, ITF1, TCF-3, VDIR, bHLHb21, AGM8, transcription factor 3, p75
Зовнішні ІД	OMIM: 147141 MGI: 98510 HomoloGene: 2408 GeneCards: TCF3
Пов'язані генетичні захворювання
лімфогранульоматоз[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • sequence-specific DNA binding • protein dimerization activity • protein homodimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • mitogen-activated protein kinase kinase kinase binding • vitamin D response element binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • transcription factor binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • bHLH transcription factor binding • E-box binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • цитоплазма • transcription regulator complex • RNA polymerase II transcription regulator complex • клітинне ядро • nuclear speck • нуклеоплазма • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of muscle cell differentiation • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • нейробіологія розвитку • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle • B cell lineage commitment • positive regulation of cell cycle • positive regulation of B cell proliferation • positive regulation of neuron differentiation • B cell differentiation • immunoglobulin V(D)J recombination • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of hematopoietic stem cell differentiation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6929	21423
Ensembl	ENSG00000071564	ENSMUSG00000020167
UniProt	P15923	P15806
RefSeq (мРНК)	NM_001136139 NM_003200 NM_001351778 NM_001351779	NM_001164147 NM_001164148 NM_001164149 NM_001164150 NM_001164151 NM_001164152 NM_001164153 NM_011548 NM_001378903 NM_001378904 NM_001378905 NM_001378908 NM_001378910 NM_001378912 NM_001378913 NM_001378914
RefSeq (білок)	NP_001129611 NP_003191 NP_001338707 NP_001338708	NP_001157619 NP_001157620 NP_001157621 NP_001157622 NP_001157623 NP_001157624 NP_001157625 NP_035678 NP_001365832 NP_001365833 NP_001365834 NP_001365837 NP_001365839 NP_001365841 NP_001365842 NP_001365843
Локус (UCSC)	Хр. 19: 1.61 – 1.65 Mb	Хр. 10: 80.25 – 80.27 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TCF3 (англ. Transcription factor 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 654 амінокислот, а молекулярна маса — 67 600[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNQPQRMAPV		GTDKELSDLL		DFSMMFPLPV		TNGKGRPASL		AGAQFGGSGL
EDRPSSGSWG		SGDQSSSSFD		PSRTFSEGTH		FTESHSSLSS		STFLGPGLGG
KSGERGAYAS		FGRDAGVGGL		TQAGFLSGEL		ALNSPGPLSP		SGMKGTSQYY
PSYSGSSRRR		AADGSLDTQP		KKVRKVPPGL		PSSVYPPSSG		EDYGRDATAY
PSAKTPSSTY		PAPFYVADGS		LHPSAELWSP		PGQAGFGPML		GGGSSPLPLP
PGSGPVGSSG		SSSTFGGLHQ		HERMGYQLHG		AEVNGGLPSA		SSFSSAPGAT
YGGVSSHTPP		VSGADSLLGS		RGTTAGSSGD		ALGKALASIY		SPDHSSNNFS
SSPSTPVGSP		QGLAGTSQWP		RAGAPGALSP		SYDGGLHGLQ		SKIEDHLDEA
IHVLRSHAVG		TAGDMHTLLP		GHGALASGFT		GPMSLGGRHA		GLVGGSHPED
GLAGSTSLMH		NHAALPSQPG		TLPDLSRPPD		SYSGLGRAGA		TAAASEIKRE
EKEDEENTSA		ADHSEEEKKE		LKAPRARTSP		DEDEDDLLPP		EQKAEREKER
RVANNARERL		RVRDINEAFK		ELGRMCQLHL		NSEKPQTKLL		ILHQAVSVIL
NLEQQVRERN		LNPKAACLKR		REEEKVSGVV		GDPQMVLSAP		HPGLSEAHNP
AGHM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Kamps M.P., Murre C., Sun X.-H., Baltimore D. (1990). A new homeobox gene contributes the DNA binding domain of the t(1;19) translocation protein in pre-B ALL. Cell. 60: 547—555. PMID 1967983 doi:10.1016/0092-8674(90)90658-2
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Murre C., McCaw P.S., Baltimore D. (1989). A new DNA binding and dimerization motif in immunoglobulin enhancer binding, daughterless, MyoD, and myc proteins. Cell. 56: 777—783. PMID 2493990 doi:10.1016/0092-8674(89)90682-X
• Henthorn P., McCarrick-Walmsley R., Kadesch T. (1990). Sequence of the cDNA encoding ITF-1, a positive-acting transcription factor. Nucleic Acids Res. 18: 677—677. PMID 2308859 doi:10.1093/nar/18.3.677
• Zhang Y., Bina M. (1991). Sequence of a HeLa cDNA provides the DNA binding domain and carboxy terminus of HE47: a human helix-loop-helix protein related to the enhancer binding factor E47. DNA Seq. 2: 197—202. PMID 1818757 doi:10.3109/10425179109039690
• Henthorn P., Kiledjian M., Kadesch T. (1990). Two distinct transcription factors that bind the immunoglobulin enhancer microE5/kappa 2 motif. Science. 247: 467—470. PMID 2105528 doi:10.1126/science.2105528

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з TCF3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11633 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
5. UniProt, P15923 (англ.) . Архів оригіналу за 11 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 19

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»