uk NR2E1

NR2E1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4XAJ
Ідентифікатори
Символи	NR2E1, TLL, TLX, XTLL, nuclear receptor subfamily 2 group E member 1
Зовнішні ІД	OMIM: 603849 MGI: 1100526 HomoloGene: 37750 GeneCards: NR2E1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• sequence-specific DNA binding; • DNA binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • zinc ion binding; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • histone deacetylase binding; • зв'язування з іоном металу; • steroid hormone receptor activity; • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; • enzyme binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding;
Клітинна компонента	• нуклеоплазма; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• glial cell migration; • cell fate commitment; • negative regulation of astrocyte differentiation; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • negative regulation of neuron differentiation; • somatic stem cell population maintenance; • dentate gyrus development; • negative regulation of neural precursor cell proliferation; • regulation of cellular component organization; • extracellular matrix organization; • negative regulation of apoptotic process; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • behavioral fear response; • regulation of timing of neuron differentiation; • transcription, DNA-templated; • нейробіологія розвитку; • positive regulation of angiogenesis; • anterior commissure morphogenesis; • regulation of dendrite morphogenesis; • positive regulation of neural precursor cell proliferation; • multicellular organism development; • brain development; • positive regulation of cell cycle; • amygdala development; • retina development in camera-type eye; • forebrain generation of neurons; • layer formation in cerebral cortex; • positive regulation of cell population proliferation; • cerebral cortex development; • соціальна поведінка; • cerebral cortex neuron differentiation; • regulation of cell migration involved in sprouting angiogenesis; • camera-type eye development; • olfactory bulb development; • transcription initiation from RNA polymerase II promoter; • positive regulation of stem cell proliferation; • aggressive behavior; • зір; • steroid hormone mediated signaling pathway; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • довготривала потенціація;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	7101
	21907
	ENSG00000112333
	ENSMUSG00000019803
	Q9Y466
	Q64104
	NM_001286102; NM_003269
	NM_152229
	NP_001273031; NP_003260
	NP_689415
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

NR2E1 (англ. Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 385 амінокислот, а молекулярна маса — 42 589^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSKPAGSTSR	ILDIPCKVCG	DRSSGKHYGV	YACDGCSGFF	KRSIRRNRTY
VCKSGNQGGC	PVDKTHRNQC	RACRLKKCLE	VNMNKDAVQH	ERGPRTSTIR
KQVALYFRGH	KEENGAAAHF	PSAALPAPAF	FTAVTQLEPH	GLELAAVSTT
PERQTLVSLA	QPTPKYPHEV	NGTPMYLYEV	ATESVCESAA	RLLFMSIKWA
KSVPAFSTLS	LQDQLMLLED	AWRELFVLGI	AQWAIPVDAN	TLLAVSGMNG
DNTDSQKLNK	IISEIQALQE	VVARFRQLRL	DATEFACLKC	IVTFKAVPTH
SGSELRSFRN	AAAIAALQDE	AQLTLNSYIH	TRYPTQPCRF	GKLLLLLPAL
RSISPSTIEE	VFFKKTIGNV	PITRLLSDMY	KSSDI

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, рецепторів, активаторів, білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Jackson A., Panayiotidis P., Foroni L. (1998). The human homologue of the Drosophila tailless gene (TLX): characterization and mapping to a region of common deletion in human lymphoid leukemia on chromosome 6q21. Genomics. 50: 34—43. PMID 9628820 DOI:10.1006/geno.1998.5270
Kobayashi M., Yu R.T., Yasuda K., Umesono K. (2000). Cell-type-specific regulation of the retinoic acid receptor mediated by the orphan nuclear receptor TLX. Mol. Cell. Biol. 20: 8731—8739. PMID 11073974 DOI:10.1128/MCB.20.23.8731-8739.2000
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7973 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9Y466 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7973 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q9Y466 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]