ZBTB18
Ідентифікатори
Символи
ZBTB18 , C2H2-171, MRD22, RP58, TAZ-1, ZNF238, zinc finger and BTB domain containing 18
Зовнішні ІД
OMIM : 608433 MGI: 1353609 HomoloGene: 21276 GeneCards: ZBTB18
Пов'язані генетичні захворювання
autosomal dominant non-syndromic intellectual disability 22 [ 1]
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • nucleic acid binding • DNA binding • sequence-specific DNA binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• nuclear chromosome • клітинне ядро
Біологічний процес
• multicellular organism development • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • skeletal muscle tissue development • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • cellular response to DNA damage stimulus
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 1: 244.05 – 244.06 Mb
Хр. 1: 177.27 – 177.28 Mb
PubMed search
[ 2]
[ 3] Вікідані
ZBTB18 (англ. Zinc finger and BTB domain containing 18 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [ 4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 522 амінокислот , а молекулярна маса — 58 354[ 5] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MEFPDHSRHL LQCLSEQRHQ GFLCDCTVLV GDAQFRAHRA VLASCSMYFH
LFYKDQLDKR DIVHLNSDIV TAPAFALLLE FMYEGKLQFK DLPIEDVLAA
ASYLHMYDIV KVCKKKLKEK ATTEADSTKK EEDASSCSDK VESLSDGSSH
IAGDLPSDED EGEDEKLNIL PSKRDLAAEP GNMWMRLPSD SAGIPQAGGE
AEPHATAAGK TVASPCSSTE SLSQRSVTSV RDSADVDCVL DLSVKSSLSG
VENLNSSYFS SQDVLRSNLV QVKVEKEASC DESDVGTNDY DMEHSTVKES
VSTNNRVQYE PAHLAPLRED SVLRELDRED KASDDEMMTP ESERVQVEGG
MESSLLPYVS NILSPAGQIF MCPLCNKVFP SPHILQIHLS THFREQDGIR
SKPAADVNVP TCSLCGKTFS CMYTLKRHER THSGEKPYTC TQCGKSFQYS
HNLSRHAVVH TREKPHACKW CERRFTQSGD LYRHIRKFHC ELVNSLSVKS
EALSLPTVRD WTLEDSSQEL WK
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів , білків розвитку , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція , регуляція транскрипції , поліморфізм.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку , ДНК .
Локалізований у ядрі .
Література
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Adams M.D., Kerlavage A.R., Fields C., Venter J.C. (1993). 3,400 new expressed sequence tags identify diversity of transcripts in human brain. Nat. Genet . 4 : 256—267. PMID 8358434 DOI :10.1038/ng0793-256
Fuks F., Burgers W.A., Godin N., Kasai M., Kouzarides T. (2001). Dnmt3a binds deacetylases and is recruited by a sequence-specific repressor to silence transcription. EMBO J . 20 : 2536—2544. PMID 11350943 DOI :10.1093/emboj/20.10.2536
Примітки
Див. також
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші