PPARA

PPARA
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи PPARA, NR1C1, PPAR, PPARalpha, hPPAR, peroxisome proliferator activated receptor alpha, PPAR-alpha
Зовнішні ІД MGI: 104740 HomoloGene: 21047 GeneCards: PPARA
Реагує на сполуку
bezafibrate, ciprofibrate, clofibrate, farglitazar, fenofibrate, gemfibrozil, oleic monoethanolamide, pirinixic acid[1]
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001113418
NM_011144
RefSeq (білок)
NP_001001928
NP_005027
NP_001349801
NP_001349802
NP_001106889
NP_035274
Локус (UCSC) Хр. 22: 46.15 – 46.24 Mb Хр. 15: 85.62 – 85.69 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

PPARA (англ. Peroxisome proliferator activated receptor alpha) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 468 амінокислот, а молекулярна маса — 52 225[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MVDTESPLCPLSPLEAGDLESPLSEEFLQEMGNIQEISQSIGEDSSGSFG
FTEYQYLGSCPGSDGSVITDTLSPASSPSSVTYPVVPGSVDESPSGALNI
ECRICGDKASGYHYGVHACEGCKGFFRRTIRLKLVYDKCDRSCKIQKKNR
NKCQYCRFHKCLSVGMSHNAIRFGRMPRSEKAKLKAEILTCEHDIEDSET
ADLKSLAKRIYEAYLKNFNMNKVKARVILSGKASNNPPFVIHDMETLCMA
EKTLVAKLVANGIQNKEAEVRIFHCCQCTSVETVTELTEFAKAIPGFANL
DLNDQVTLLKYGVYEAIFAMLSSVMNKDGMLVAYGNGFITREFLKSLRKP
FCDIMEPKFDFAMKFNALELDDSDISLFVAAIICCGDRPGLLNVGHIEKM
QEGIVHVLRLHLQSNHPDDIFLFPKLLQKMADLRQLVTEHAQLVQIIKKT
ESDAALHPLLQEIYRDMY

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами, іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • Sher T., Yi H.F., McBride O.W., Gonzales F.J. (1993). cDNA cloning, chromosomal mapping, and functional characterization of the human peroxisome proliferator activated receptor. Biochemistry. 32: 5598—5604. PMID 7684926 DOI:10.1021/bi00072a015
  • Mukherjee R., Jow L., Noonan D., McDonnell D.P. (1994). Human and rat peroxisome proliferator activated receptors (PPARs) demonstrate similar tissue distribution but different responsiveness to PPAR activators. J. Steroid Biochem. Mol. Biol. 51: 157—166. PMID 7981125 DOI:10.1016/0960-0760(94)90089-2
  • Tugwood J.D., Aldridge T.C., Lambe K.G., Macdonald N., Woodyatt N.J. (1996). Peroxisome proliferator-activated receptors: structures and function. Ann. N. Y. Acad. Sci. 804: 252—265. PMID 8993548 DOI:10.1111/j.1749-6632.1996.tb18620.x
  • Kobayashi T., Kodani Y., Nozawa A., Endo Y., Sawasaki T. (2008). DNA-binding profiling of human hormone nuclear receptors via fluorescence correlation spectroscopy in a cell-free system. FEBS Lett. 582: 2737—2744. PMID 18619963 DOI:10.1016/j.febslet.2008.07.003
  • Li H., Gomes P.J., Chen J.D. (1997). RAC3, a steroid/nuclear receptor-associated coactivator that is related to SRC-1 and TIF2. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94: 8479—8484. PMID 9238002 DOI:10.1073/pnas.94.16.8479
  • Gorla-Bajszczak A., Juge-Aubry C., Pernin A., Burger A.G., Meier C.A. (1999). Conserved amino acids in the ligand-binding and tau(i) domains of the peroxisome proliferator-activated receptor alpha are necessary for heterodimerization with RXR. Mol. Cell. Endocrinol. 147: 37—47. PMID 10195690 DOI:10.1016/S0303-7207(98)00217-2

Примітки

Див. також