ZBTB17

ZBTB17
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2LVR, 2LVT, 2LVU, 2M0D, 2M0E, 2M0F, 2N25, 2N26, 2Q81, 3M52, 4U2M, 4U2N, 5ION
Ідентифікатори
Символи	ZBTB17, MIZ-1, ZNF151, ZNF60, pHZ-67, zinc finger and BTB domain containing 17
Зовнішні ІД	OMIM: 604084 MGI: 107410 HomoloGene: 2575 GeneCards: ZBTB17
Пов'язані генетичні захворювання
дилатаційна кардіоміопатія[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • transcription coactivator binding • transcription factor binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • protein-DNA complex • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • multicellular organism development • gastrulation with mouth forming second • ectoderm development • IRE1-mediated unfolded protein response • negative regulation of cell cycle • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • negative regulation of cell population proliferation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7709	22642
Ensembl	ENSG00000116809	ENSMUSG00000006215
UniProt	Q13105	Q60821
RefSeq (мРНК)	NM_001242884 NM_001287603 NM_001287604 NM_003443 NM_001324137 NM_001324138	NM_009541 NM_001378826 NM_001378827 NM_001378828
RefSeq (білок)	NP_001229813 NP_001274532 NP_001274533 NP_001311066 NP_001311067 NP_003434	NP_033567 NP_001365755 NP_001365756 NP_001365757
Локус (UCSC)	Хр. 1: 15.94 – 15.98 Mb	Хр. 4: 141.17 – 141.2 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ZBTB17 (англ. Zinc finger and BTB domain containing 17) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 803 амінокислот, а молекулярна маса — 87 928[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDFPQHSQHV		LEQLNQQRQL		GLLCDCTFVV		DGVHFKAHKA		VLAACSEYFK
MLFVDQKDVV		HLDISNAAGL		GQVLEFMYTA		KLSLSPENVD		DVLAVATFLQ
MQDIITACHA		LKSLAEPATS		PGGNAEALAT		EGGDKRAKEE		KVATSTLSRL
EQAGRSTPIG		PSRDLKEERG		GQAQSAASGA		EQTEKADAPR		EPPPVELKPD
PTSGMAAAEA		EAALSESSEQ		EMEVEPARKG		EEEQKEQEEQ		EEEGAGPAEV
KEEGSQLENG		EAPEENENEE		SAGTDSGQEL		GSEARGLRSG		TYGDRTESKA
YGSVIHKCED		CGKEFTHTGN		FKRHIRIHTG		EKPFSCRECS		KAFSDPAACK
AHEKTHSPLK		PYGCEECGKS		YRLISLLNLH		KKRHSGEARY		RCEDCGKLFT
TSGNLKRHQL		VHSGEKPYQC		DYCGRSFSDP		TSKMRHLETH		DTDKEHKCPH
CDKKFNQVGN		LKAHLKIHIA		DGPLKCRECG		KQFTTSGNLK		RHLRIHSGEK
PYVCIHCQRQ		FADPGALQRH		VRIHTGEKPC		QCVMCGKAFT		QASSLIAHVR
QHTGEKPYVC		ERCGKRFVQS		SQLANHIRHH		DNIRPHKCSV		CSKAFVNVGD
LSKHIIIHTG		EKPYLCDKCG		RGFNRVDNLR		SHVKTVHQGK		AGIKILEPEE
GSEVSVVTVD		DMVTLATEAL		AATAVTQLTV		VPVGAAVTAD		ETEVLKAEIS
KAVKQVQEED		PNTHILYACD		SCGDKFLDAN		SLAQHVRIHT		AQALVMFQTD
ADFYQQYGPG		GTWPAGQVLQ		AGELVFRPRD		GAEGQPALAE		TSPTAPECPP
PAE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Lichter P., Bray P., Ried T., Dawid I.B., Ward D.C. (1992). Clustering of C2-H2 zinc finger motif sequences within telomeric and fragile site regions of human chromosomes. Genomics. 13: 999—1007. PMID 1505991 DOI:10.1016/0888-7543(92)90013-I
• Tommerup N., Vissing H. (1995). Isolation and fine mapping of 16 novel human zinc finger-encoding cDNAs identify putative candidate genes for developmental and malignant disorders. Genomics. 27: 259—264. PMID 7557990 DOI:10.1006/geno.1995.1040
• Piluso D., Bilan P., Capone J.P. (2002). Host cell factor-1 interacts with and antagonizes transactivation by the cell cycle regulatory factor Miz-1. J. Biol. Chem. 277: 46799—46808. PMID 12244100 DOI:10.1074/jbc.M206226200
• Zhao N., Wang J., Cui Y., Guo L., Lu S.-H. (2004). Induction of G1 cell cycle arrest and P15INK4b expression by ECRG1 through interaction with Miz-1. J. Cell. Biochem. 92: 65—76. PMID 15095404 DOI:10.1002/jcb.20025
• Phan R.T., Saito M., Basso K., Niu H., Dalla-Favera R. (2005). BCL6 interacts with the transcription factor Miz-1 to suppress the cyclin-dependent kinase inhibitor p21 and cell cycle arrest in germinal center B cells. Nat. Immunol. 6: 1054—1060. PMID 16142238 DOI:10.1038/ni1245

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з ZBTB17 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12936 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 28 серпня 2017. [Архівовано 2015-09-10 у Wayback Machine.]
5. UniProt, Q13105 (англ.) . Архів оригіналу за 7 жовтня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

• Хромосома 1

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»