NFATC3
|
---|
|
| Ідентифікатори
|
---|
Символи
| NFATC3, NFAT4, NFATX, nuclear factor of activated T-cells 3, nuclear factor of activated T cells 3, NF-AT4c |
---|
Зовнішні ІД |
OMIM: 602698 MGI: 103296 HomoloGene: 27827 GeneCards: NFATC3
|
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція |
• DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • chromatin binding • transcription factor binding
|
---|
Клітинна компонента |
• цитоплазма • нуклеоплазма • клітинне ядро • гіалоплазма • transcription regulator complex
|
---|
Біологічний процес |
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • Fc-epsilon receptor signaling pathway • inflammatory response • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II • negative regulation of vascular associated smooth muscle cell differentiation • GO:0032617 творба цитокінів • calcineurin-NFAT signaling cascade • multicellular organism development
|
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | | Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних
| Ортологи |
---|
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
---|
Ensembl |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 16: 68.08 – 68.23 Mb
| Хр. 8: 106.79 – 106.86 Mb
|
---|
PubMed search |
[1]
| [2] |
---|
Вікідані | |
NFATC3 (англ. Nuclear factor of activated T-cells 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 075 амінокислот, а молекулярна маса — 115 594[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MTTANCGAHD | | ELDFKLVFGE | | DGAPAPPPPG | | SRPADLEPDD | | CASIYIFNVD |
PPPSTLTTPL | | CLPHHGLPSH | | SSVLSPSFQL | | QSHKNYEGTC | | EIPESKYSPL |
GGPKPFECPS | | IQITSISPNC | | HQELDAHEDD | | LQINDPEREF | | LERPSRDHLY |
LPLEPSYRES | | SLSPSPASSI | | SSRSWFSDAS | | SCESLSHIYD | | DVDSELNEAA |
ARFTLGSPLT | | SPGGSPGGCP | | GEETWHQQYG | | LGHSLSPRQS | | PCHSPRSSVT |
DENWLSPRPA | | SGPSSRPTSP | | CGKRRHSSAE | | VCYAGSLSPH | | HSPVPSPGHS |
PRGSVTEDTW | | LNASVHGGSG | | LGPAVFPFQY | | CVETDIPLKT | | RKTSEDQAAI |
LPGKLELCSD | | DQGSLSPARE | | TSIDDGLGSQ | | YPLKKDSCGD | | QFLSVPSPFT |
WSKPKPGHTP | | IFRTSSLPPL | | DWPLPAHFGQ | | CELKIEVQPK | | THHRAHYETE |
GSRGAVKAST | | GGHPVVKLLG | | YNEKPINLQM | | FIGTADDRYL | | RPHAFYQVHR |
ITGKTVATAS | | QEIIIASTKV | | LEIPLLPENN | | MSASIDCAGI | | LKLRNSDIEL |
RKGETDIGRK | | NTRVRLVFRV | | HIPQPSGKVL | | SLQIASIPVE | | CSQRSAQELP |
HIEKYSINSC | | SVNGGHEMVV | | TGSNFLPESK | | IIFLEKGQDG | | RPQWEVEGKI |
IREKCQGAHI | | VLEVPPYHNP | | AVTAAVQVHF | | YLCNGKRKKS | | QSQRFTYTPV |
LMKQEHREEI | | DLSSVPSLPV | | PHPAQTQRPS | | SDSGCSHDSV | | LSGQRSLICS |
IPQTYASMVT | | SSHLPQLQCR | | DESVSKEQHM | | IPSPIVHQPF | | QVTPTPPVGS |
SYQPMQTNVV | | YNGPTCLPIN | | AASSQEFDSV | | LFQQDATLSG | | LVNLGCQPLS |
SIPFHSSNSG | | STGHLLAHTP | | HSVHTLPHLQ | | SMGYHCSNTG | | QRSLSSPVAD |
QITGQPSSQL | | QPITYGPSHS | | GSATTASPAA | | SHPLASSPLS | | GPPSPQLQPM |
PYQSPSSGTA | | SSPSPATRMH | | SGQHSTQAQS | | TGQGGLSAPS | | SLICHSLCDP |
ASFPPDGATV | | SIKPEPEDRE | | PNFATIGLQD | | ITLDDVNEII | | GRDMSQISVS |
QGAGVSRQAP | | LPSPESLDLG | | RSDGL |
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
Примітки
Див. також
|
---|
(1) Основні домени |
---|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
(1.4) NF-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
| (2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
підродина 2 | |
---|
підродина 3 | |
---|
підродина 4 | |
---|
підродина 5 | |
---|
підродина 6 | |
---|
підродина 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
| (3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
(3.1) Гомеобокс | |
---|
(3.2) Парний бокс | |
---|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
(3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
(3.5) Триптофановий кластер | |
---|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
| (4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
(4.1) RHR | |
---|
(4.2) STAT | |
---|
(4.3) p53 | |
---|
(4.4) MADS | |
---|
(4.6) TATA | |
---|
(4.7) Високомобільна група | |
---|
(4.9) Grainyhead | |
---|
(4.10) Домен холодового шоку | |
---|
(4.11) Runt | |
---|
|
| (0) Інші фактори транскрипції |
---|
(0.2) HMGI(Y) | |
---|
(0.3) Pocket домен | |
---|
(0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
(0.6) Інші | |
---|
|
|
|