ATF7

ATF7
Ідентифікатори
Символи	ATF7, ATFA, activating transcription factor 7
Зовнішні ІД	OMIM: 606371 MGI: 2443472 HomoloGene: 4994 GeneCards: ATF7
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • enzyme binding • DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • mitogen-activated protein kinase binding • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • цитоплазма • nuclear periphery • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • GO:0022415 viral process • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	11016	223922
Ensembl	ENSG00000170653	ENSMUSG00000099083
UniProt	P17544	Q8R0S1
RefSeq (мРНК)	NM_001130059 NM_001130060 NM_001206682 NM_001206683 NM_006856 NM_001366555 NM_001366556 NM_001366558 NM_001366561 NM_001366562 NM_001366563	NM_146065 NM_001310066 NM_001310067 NM_001310070
RefSeq (білок)	NP_001123532 NP_001193611 NP_001193612 NP_006847 NP_001353484 NP_001353485 NP_001353487 NP_001353490 NP_001353491 NP_001353492	NP_001296995 NP_001296996 NP_001296999
Локус (UCSC)	Хр. 12: 53.51 – 53.63 Mb	Хр. 15: 102.43 – 102.53 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ATF7 (англ. Activating transcription factor 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 494 амінокислот, а молекулярна маса — 52 967[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGDDRPFVCN		APGCGQRFTN		EDHLAVHKHK		HEMTLKFGPA		RTDSVIIADQ
TPTPTRFLKN		CEEVGLFNEL		ASSFEHEFKK		AADEDEKKAR		SRTVAKKLVA
AAGPLDMSLP		STPDIKIKEE		EPVEVDSSPP		DSPASSPCSP		PLKEKEVTPK
PVLISTPTPT		IVRPGSLPLH		LGYDPLHPTL		PSPTSVITQA		PPSNRQMGSP
TGSLPLVMHL		ANGQTMPVLP		GPPVQMPSVI		SLARPVSMVP		NIPGIPGPPV
NSSGSISPSG		HPIPSEAKMR		LKATLTHQVS		SINGGCGMVV		GTASTMVTAR
PEQSQILIQH		PDAPSPAQPQ		VSPAQPTPST		GGRRRRTVDE		DPDERRQRFL
ERNRAAASRC		RQKRKLWVSS		LEKKAEELTS		QNIQLSNEVT		LLRNEVAQLK
QLLLAHKDCP		VTALQKKTQG		YLESPKESSE		PTGSPAPVIQ		HSSATAPSNG
LSVRSAAEAV		ATSVLTQMAS		QRTELSMPIQ		SHVIMTPQSQ		SAGR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Gaire M., Chatton B., Kedinger C. (1990). Isolation and characterization of two novel, closely related ATF cDNA clones from HeLa cells. Nucleic Acids Res. 18: 3467—3473. PMID 1694576 doi:10.1093/nar/18.12.3467
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Hai T., Curran T. (1991). Cross-family dimerization of transcription factors Fos/Jun and ATF/CREB alters DNA binding specificity. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88: 3720—3724. PMID 1827203 doi:10.1073/pnas.88.9.3720
• Pescini R., Kaszubska W., Whelan J., DeLamarter J.F., Hooft van Huijsduijnen R. (1994). ATF-a0, a novel variant of the ATF/CREB transcription factor family, forms a dominant transcription inhibitor in ATF-a heterodimers. J. Biol. Chem. 269: 1159—1165. PMID 8288576

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:792 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
4. UniProt, P17544 (англ.) . Архів оригіналу за 8 грудня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 12

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»