HES6
|
---|
|
Ідентифікатори
|
---|
Символи
| HES6, C-HAIRY1, HES-6, bHLHb41, bHLHc23, hes family bHLH transcription factor 6 |
---|
Зовнішні ІД |
OMIM: 610331 MGI: 1859852 HomoloGene: 23111 GeneCards: HES6
|
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція |
• DNA binding • transcription factor binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • protein dimerization activity • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001104 transcription coregulator activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001106 transcription corepressor activity • sequence-specific DNA binding • sequence-specific double-stranded DNA binding
|
---|
Клітинна компонента |
• клітинне ядро • transcription regulator complex
|
---|
Біологічний процес |
• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • multicellular organism development • диференціація клітин • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • нейробіологія розвитку • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • somitogenesis • Сигнальний шлях Notch • regulation of neurogenesis • anterior/posterior pattern specification
|
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | | Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних
| Ортологи |
---|
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
---|
Ensembl |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 2: 238.24 – 238.24 Mb
| Хр. 1: 91.34 – 91.34 Mb
|
---|
PubMed search |
[1]
| [2] |
---|
Вікідані | |
HES6 (англ. Hes family bHLH transcription factor 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 224 амінокислот, а молекулярна маса — 24 129[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAPPAAPGRD | | RVGREDEDGW | | ETRGDRKARK | | PLVEKKRRAR | | INESLQELRL |
LLAGAEVQAK | | LENAEVLELT | | VRRVQGVLRG | | RAREREQLQA | | EASERFAAGY |
IQCMHEVHTF | | VSTCQAIDAT | | VAAELLNHLL | | ESMPLREGSS | | FQDLLGDALA |
GPPRAPGRSG | | WPAGGAPGSP | | IPSPPGPGDD | | LCSDLEEAPE | | AELSQAPAEG |
PDLVPAALGS | | LTTAQIARSV | | WRPW |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, білків розвитку.
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація, поліморфізм, альтернативний сплайсинг.
Локалізований у ядрі.
Література
Примітки
Див. також
|
---|
(1) Основні домени |
---|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
(1.4) NF-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
| (2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
підродина 2 | |
---|
підродина 3 | |
---|
підродина 4 | |
---|
підродина 5 | |
---|
підродина 6 | |
---|
підродина 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
| (3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
(3.1) Гомеобокс | |
---|
(3.2) Парний бокс | |
---|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
(3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
(3.5) Триптофановий кластер | |
---|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
| (4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
(4.1) RHR | |
---|
(4.2) STAT | |
---|
(4.3) p53 | |
---|
(4.4) MADS | |
---|
(4.6) TATA | |
---|
(4.7) Високомобільна група | |
---|
(4.9) Grainyhead | |
---|
(4.10) Домен холодового шоку | |
---|
(4.11) Runt | |
---|
|
| (0) Інші фактори транскрипції |
---|
(0.2) HMGI(Y) | |
---|
(0.3) Pocket домен | |
---|
(0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
(0.6) Інші | |
---|
|
|
|