NFIL3

NFIL3
Ідентифікатори
Символи	NFIL3, E4BP4, IL3BP1, NF-IL3A, NFIL3A, nuclear factor, interleukin 3 regulated
Зовнішні ІД	OMIM: 605327 MGI: 109495 HomoloGene: 3928 GeneCards: NFIL3
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • identical protein binding Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • cellular response to interleukin-4 • GO:1901313 positive regulation of gene expression • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • циркадний ритм • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • transcription, DNA-templated • ритмічний процес • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4783	18030
Ensembl	ENSG00000165030	ENSMUSG00000056749
UniProt	Q16649	O08750
RefSeq (мРНК)	NM_005384 NM_001289999 NM_001290000	NM_017373
RefSeq (білок)	NP_001276928 NP_001276929 NP_005375	NP_059069
Локус (UCSC)	Хр. 9: 91.41 – 91.42 Mb	Хр. 13: 53.12 – 53.14 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NFIL3 (англ. Nuclear factor, interleukin 3 regulated) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 462 амінокислот, а молекулярна маса — 51 472[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MQLRKMQTVK		KEQASLDASS		NVDKMMVLNS		ALTEVSEDST		TGEELLLSEG
SVGKNKSSAC		RRKREFIPDE		KKDAMYWEKR		RKNNEAAKRS		REKRRLNDLV
LENKLIALGE		ENATLKAELL		SLKLKFGLIS		STAYAQEIQK		LSNSTAVYFQ
DYQTSKSNVS		SFVDEHEPSM		VSSSCISVIK		HSPQSSLSDV		SEVSSVEHTQ
ESSVQGSCRS		PENKFQIIKQ		EPMELESYTR		EPRDDRGSYT		ASIYQNYMGN
SFSGYSHSPP		LLQVNRSSSN		SPRTSETDDG		VVGKSSDGED		EQQVPKGPIH
SPVELKHVHA		TVVKVPEVNS		SALPHKLRIK		AKAMQIKVEA		FDNEFEATQK
LSSPIDMTSK		RHFELEKHSA		PSMVHSSLTP		FSVQVTNIQD		WSLKSEHWHQ
KELSGKTQNS		FKTGVVEMKD		SGYKVSDPEN		LYLKQGIANL		SAEVVSLKRL
IATQPISASD		SG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Cowell I.G., Skinner A., Hurst H.C. (1992). Transcriptional repression by a novel member of the bZIP family of transcription factors. Mol. Cell. Biol. 12: 3070—3077. PMID 1620116 DOI:10.1128/MCB.12.7.3070
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Cowell I.G., Hurst H.C. (1996). Protein-protein interaction between the transcriptional repressor E4BP4 and the TBP-binding protein Dr1. Nucleic Acids Res. 24: 3607—3613. PMID 8836190 DOI:10.1093/nar/24.18.3607
• Hulme D.J., Blair I.P., Dawkins J.L., Nicholson G.A. (2000). Exclusion of NFIL3 as the gene causing hereditary sensory neuropathy type I by mutation analysis. Hum. Genet. 106: 594—596. PMID 10942106 DOI:10.1007/s004390000306
• Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
• Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7787 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
4. UniProt, Q16649 (англ.) . Архів оригіналу за 21 лютого 2018. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 9

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»