GTF2B

GTF2B
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1C9B, 1DL6, 1RLY, 1RO4, 1TFB, 1VOL, 2PHG, 5IY7, 5IYA, 5IY6, 5IY9, 5IYB, 5IYD, 5IY8, 5IYC
Ідентифікатори
Символи	GTF2B, TF2B, TFIIB, general transcription factor IIB
Зовнішні ІД	OMIM: 189963 MGI: 2385191 HomoloGene: 1158 GeneCards: GTF2B
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • transcription factor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • thyroid hormone receptor binding • TBP-class protein binding • RNA polymerase II complex binding • acetyltransferase activity • promoter-specific chromatin binding • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding • zinc ion binding • histone acetyltransferase activity • transferase activity • acyltransferase activity • RNA polymerase II complex recruiting activity • GO:0000983 RNA polymerase II general transcription initiation factor activity Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • transcription factor TFIID complex • ядерні тільця • transcription preinitiation complex • хромосома • protein-DNA complex • RNA polymerase II transcription regulator complex Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • positive regulation of viral transcription • snRNA transcription by RNA polymerase II • GO:0022415 viral process • transcription preinitiation complex assembly • positive regulation of core promoter binding • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • protein acetylation • positive regulation by host of viral transcription • positive regulation of transcription initiation from RNA polymerase II promoter • transcriptional start site selection at RNA polymerase II promoter • transcription by RNA polymerase II • RNA polymerase II preinitiation complex assembly • RNA polymerase II core complex assembly • histone acetylation • DNA-templated transcription, initiation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2959	229906
Ensembl	ENSG00000137947	ENSMUSG00000028271
UniProt	Q00403	P62915
RefSeq (мРНК)	NM_001514	NM_145546
RefSeq (білок)	NP_001505	NP_663521
Локус (UCSC)	Хр. 1: 88.85 – 88.89 Mb	Хр. 3: 142.47 – 142.49 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GTF2B (англ. General transcription factor IIB) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 316 амінокислот, а молекулярна маса — 34 833[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASTSRLDAL		PRVTCPNHPD		AILVEDYRAG		DMICPECGLV		VGDRVIDVGS
EWRTFSNDKA		TKDPSRVGDS		QNPLLSDGDL		STMIGKGTGA		ASFDEFGNSK
YQNRRTMSSS		DRAMMNAFKE		ITTMADRINL		PRNIVDRTNN		LFKQVYEQKS
LKGRANDAIA		SACLYIACRQ		EGVPRTFKEI		CAVSRISKKE		IGRCFKLILK
ALETSVDLIT		TGDFMSRFCS		NLCLPKQVQM		AATHIARKAV		ELDLVPGRSP
ISVAAAAIYM		ASQASAEKRT		QKEIGDIAGV		ADVTIRQSYR		LIYPRAPDLF
PTDFKFDTPV		DKLPQL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

• Ha I., Lane W.S., Reinberg D. (1991). Cloning of a human gene encoding the general transcription initiation factor IIB. Nature. 352: 689—695. PMID 1876184 DOI:10.1038/352689a0
• Malik S., Hisatake K., Sumimoto H., Horikoshi M., Roeder R.G. (1991). Sequence of general transcription factor TFIIB and relationships to other initiation factors. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88: 9553—9557. PMID 1946368 DOI:10.1073/pnas.88.21.9553
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Umehara T., Kida S., Yamamoto T., Horikoshi M. (1995). Isolation and characterization of a cDNA encoding a new type of human transcription elongation factor S-II. Gene. 167: 297—302. PMID 8566795 DOI:10.1016/0378-1119(95)00634-6
• Yuan C.X., Gurley W.B. (2000). Potential targets for HSF1 within the preinitiation complex. Cell Stress Chaperones. 5: 229—242. PMID 11005381 DOI:10.1379/1466-1268(2000)005<0229:PTFHWT>2.0.CO;2
• Chen H.T., Legault P., Glushka J., Omichinski J.G., Scott R.A. (2000). Structure of a (Cys3His) zinc ribbon, a ubiquitous motif in archaeal and eucaryal transcription. Protein Sci. 9: 1743—1752. PMID 11045620 DOI:10.1110/ps.9.9.1743

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з GTF2B переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4648 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.
5. UniProt, Q00403 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

• Хромосома 1

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»