ZBTB33
Ідентифікатори
Символи
ZBTB33 , ZNF-kaiso, ZNF348, zinc finger and BTB domain containing 33
Зовнішні ІД
OMIM : 300329 MGI: 1927290 HomoloGene: 4931 GeneCards: ZBTB33
Онтологія гена
Молекулярна функція
• methyl-CpG binding • sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• клітинна мембрана • ядерце • клітинне ядро • нуклеоплазма • цитоплазма • гіалоплазма
Біологічний процес
• GO:0007243 intracellular signal transduction • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • Wnt signaling pathway • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. X: 120.25 – 120.26 Mb
Хр. X: 37.28 – 37.29 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
ZBTB33 (англ. Zinc finger and BTB domain containing 33 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 672 амінокислот , а молекулярна маса — 74 484[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MESRKLISAT DIQYSGSLLN SLNEQRGHGL FCDVTVIVED RKFRAHKNIL
SASSTYFHQL FSVAGQVVEL SFIRAEIFAE ILNYIYSSKI VRVRSDLLDE
LIKSGQLLGV KFIAELGVPL SQVKSISGTA QDGNTEPLPP DSGDKNLVIQ
KSKDEAQDNG ATIMPIITES FSLSAEDYEM KKIIVTDSDD DDDDVIFCSE
ILPTKETLPS NNTVAQVQSN PGPVAISDVA PSASNNSPPL TNITPTQKLP
TPVNQATLSQ TQGSEKLLVS SAPTHLTPNI ILLNQTPLST PPNVSSSLPN
HMPSSINLLV QNQQTPNSAI LTGNKANEEE EEEIIDDDDD TISSSPDSAV
SNTSLVPQAD TSQNTSFDGS LIQKMQIPTL LQEPLSNSLK ISDIITRNTN
DPGVGSKHLM EGQKIITLDT ATEIEGLSTG CKVYANIGED TYDIVIPVKD
DPDEGEARLE NEIPKTSGSE MANKRMKVKH DDHYELIVDG RVYYICIVCK
RSYVCLTSLR RHFNIHSWEK KYPCRYCEKV FPLAEYRTKH EIHHTGERRY
QCLACGKSFI NYQFMSSHIK SVHSQDPSGD SKLYRLHPCR SLQIRQYAYL
SDRSSTIPAM KDDGIGYKVD TGKEPPVGTT TSTQNKPMTW EDIFIQQEND
SIFKQNVTDG STEFEFIIPE SY
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів , активаторів , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , сигнальний шлях Wnt.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку , ДНК .
Локалізований у цитоплазмі , ядрі .
Література
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Daniel J.M., Reynolds A.B. (1999). The catenin p120(ctn) interacts with Kaiso, a novel BTB/POZ domain zinc finger transcription factor . Mol. Cell. Biol . 19 : 3614—3623. PMID 10207085 DOI :10.1128/MCB.19.5.3614
Yoon H.-G., Chan D.W., Reynolds A.B., Qin J., Wong J. (2003). N-CoR mediates DNA methylation-dependent repression through a methyl CpG binding protein Kaiso. Mol. Cell . 12 : 723—734. PMID 14527417 DOI :10.1016/j.molcel.2003.08.008
Kondapalli J., Flozak A.S., Albuquerque M.L.C. (2004). Laminar shear stress differentially modulates gene expression of p120 catenin, Kaiso transcription factor, and vascular endothelial cadherin in human coronary artery endothelial cells. J. Biol. Chem . 279 : 11417—11424. PMID 14699141 DOI :10.1074/jbc.M306057200
Kelly K.F., Otchere A.A., Graham M., Daniel J.M. (2004). Nuclear import of the BTB/POZ transcriptional regulator Kaiso. J. Cell Sci . 117 : 6143—6152. PMID 15564377 DOI :10.1242/jcs.01541
Примітки
Див. також
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші