SMAD9 (англ. SMAD family member 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 467 амінокислот, а молекулярна маса — 52 493[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MHSTTPISSL | | FSFTSPAVKR | | LLGWKQGDEE | | EKWAEKAVDS | | LVKKLKKKKG |
AMDELERALS | | CPGQPSKCVT | | IPRSLDGRLQ | | VSHRKGLPHV | | IYCRVWRWPD |
LQSHHELKPL | | ECCEFPFGSK | | QKEVCINPYH | | YRRVETPVLP | | PVLVPRHSEY |
NPQLSLLAKF | | RSASLHSEPL | | MPHNATYPDS | | FQQPPCSALP | | PSPSHAFSQS |
PCTASYPHSP | | GSPSEPESPY | | QHSVDTPPLP | | YHATEASETQ | | SGQPVDATAD |
RHVVLSIPNG | | DFRPVCYEEP | | QHWCSVAYYE | | LNNRVGETFQ | | ASSRSVLIDG |
FTDPSNNRNR | | FCLGLLSNVN | | RNSTIENTRR | | HIGKGVHLYY | | VGGEVYAECV |
SDSSIFVQSR | | NCNYQHGFHP | | ATVCKIPSGC | | SLKVFNNQLF | | AQLLAQSVHH |
GFEVVYELTK | | MCTIRMSFVK | | GWGAEYHRQD | | VTSTPCWIEI | | HLHGPLQWLD |
KVLTQMGSPH | | NPISSVS |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК.
Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
Примітки
Див. також
|
---|
(1) Основні домени |
---|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
(1.4) NF-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
підродина 2 | |
---|
підродина 3 | |
---|
підродина 4 | |
---|
підродина 5 | |
---|
підродина 6 | |
---|
підродина 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
(3.1) Гомеобокс | |
---|
(3.2) Парний бокс | |
---|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
(3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
(3.5) Триптофановий кластер | |
---|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
(4.1) RHR | |
---|
(4.2) STAT | |
---|
(4.3) p53 | |
---|
(4.4) MADS | |
---|
(4.6) TATA | |
---|
(4.7) Високомобільна група | |
---|
(4.9) Grainyhead | |
---|
(4.10) Домен холодового шоку | |
---|
(4.11) Runt | |
---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
(0.2) HMGI(Y) | |
---|
(0.3) Pocket домен | |
---|
(0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
(0.6) Інші | |
---|
|
|