MTA1

MTA1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4BKX, 4PBY, 4PBZ, 4PC0, 5ICN, 5FXY
Ідентифікатори
Символи	MTA1, metastasis associated 1
Зовнішні ІД	OMIM: 603526 MGI: 2150037 HomoloGene: 3442 GeneCards: MTA1
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • zinc ion binding • chromatin binding • зв'язування з іоном металу • core promoter sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • histone deacetylase activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • histone deacetylase binding Клітинна компонента • цитоплазма • nuclear envelope • внутрішньоклітинна мембранна органела • нуклеоплазма • мікротрубочка • цитоскелет • клітинне ядро • гіалоплазма • NuRD complex Біологічний процес • response to ionizing radiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • Епігенетичне успадкування • ритмічний процес • circadian regulation of gene expression • transcription, DNA-templated • positive regulation of protein autoubiquitination • double-strand break repair • entrainment of circadian clock by photoperiod • GO:0072468 сигнальна трансдукція • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • locomotor rhythm • histone deacetylation • negative regulation of nucleic acid-templated transcription • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of nucleic acid-templated transcription • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9112	116870
Ensembl	ENSG00000182979	ENSMUSG00000021144
UniProt	Q13330	Q8K4B0
RefSeq (мРНК)	NM_001203258 NM_004689	NM_054081 NM_001346696 NM_001364620 NM_001364621 NM_001364622 NM_001364623
RefSeq (білок)	NP_001190187 NP_004680	NP_001333625 NP_473422 NP_001351549 NP_001351550 NP_001351551 NP_001351552
Локус (UCSC)	Хр. 14: 105.42 – 105.47 Mb	Хр. 12: 113.06 – 113.1 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

MTA1 (англ. Metastasis associated 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 715 амінокислот, а молекулярна маса — 80 786[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAANMYRVGD		YVYFENSSSN		PYLIRRIEEL		NKTANGNVEA		KVVCFYRRRD
ISSTLIALAD		KHATLSVCYK		AGPGADNGEE		GEIEEEMENP		EMVDLPEKLK
HQLRHRELFL		SRQLESLPAT		HIRGKCSVTL		LNETESLKSY		LEREDFFFYS
LVYDPQQKTL		LADKGEIRVG		NRYQADITDL		LKEGEEDGRD		QSRLETQVWE
AHNPLTDKQI		DQFLVVARSV		GTFARALDCS		SSVRQPSLHM		SAAAASRDIT
LFHAMDTLHK		NIYDISKAIS		ALVPQGGPVL		CRDEMEEWSA		SEANLFEEAL
EKYGKDFTDI		QQDFLPWKSL		TSIIEYYYMW		KTTDRYVQQK		RLKAAEAESK
LKQVYIPNYN		KPNPNQISVN		NVKAGVVNGT		GAPGQSPGAG		RACESCYTTQ
SYQWYSWGPP		NMQCRLCASC		WTYWKKYGGL		KMPTRLDGER		PGPNRSNMSP
HGLPARSSGS		PKFAMKTRQA		FYLHTTKLTR		IARRLCREIL		RPWHAARHPY
LPINSAAIKA		ECTARLPEAS		QSPLVLKQAV		RKPLEAVLRY		LETHPRPPKP
DPVKSVSSVL		SSLTPAKVAP		VINNGSPTIL		GKRSYEQHNG		VDGNMKKRLL
MPSRGLANHG		QARHMGPSRN		LLLNGKSYPT		KVRLIRGGSL		PPVKRRRMNW
IDAPDDVFYM		ATEETRKIRK		LLSSSETKRA		ARRPYKPIAL		RQSQALPPRP
PPPAPVNDEP		IVIED

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі.

Література

• Toh Y., Pencil S.D., Nicolson G.L. (1995). Analysis of the complete sequence of the novel metastasis-associated candidate gene, mta1, differentially expressed in mammary adenocarcinoma and breast cancer cell lines. Gene. 159: 97—104. PMID 7607577 DOI:10.1016/0378-1119(94)00410-T
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Talukder A.H., Gururaj A., Mishra S.K., Vadlamudi R.K., Kumar R. (2004). Metastasis-associated protein 1 interacts with NRIF3, an estrogen-inducible nuclear receptor coregulator. Mol. Cell. Biol. 24: 6581—6591. PMID 15254226 DOI:10.1128/MCB.24.15.6581-6591.2004
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Molli P.R., Singh R.R., Lee S.W., Kumar R. (2008). MTA1-mediated transcriptional repression of BRCA1 tumor suppressor gene. Oncogene. 27: 1971—1980. PMID 17922032 DOI:10.1038/sj.onc.1210839
• Kumar R., Balasenthil S., Manavathi B., Rayala S.K., Pakala S.B. (2010). Metastasis-associated protein 1 and its short form variant stimulates Wnt1 transcription through promoting its derepression from Six3 corepressor. Cancer Res. 70: 6649—6658. PMID 20682799 DOI:10.1158/0008-5472.CAN-10-0909

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7410 (англ.) . Архів оригіналу за 28 травня 2017. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2017-05-28 у Wayback Machine.]
4. UniProt, Q13330 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 14

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»