GLI1

GLI1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2GLI, 4BLB, 4KMD
Ідентифікатори
Символи	GLI1, GLI, GLI family zinc finger 1, PAPA8, PPD1
Зовнішні ІД	OMIM: 165220 MGI: 95727 HomoloGene: 3859 GeneCards: GLI1
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • microtubule binding • chromatin binding • зв'язування з іоном металу • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • війка • нуклеоплазма • ciliary base • ciliary tip • GO:0035085 Аксонема • клітинне ядро Біологічний процес • epidermal cell differentiation • proximal/distal pattern formation • диференціація клітин • pituitary gland development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of smoothened signaling pathway • lung development • positive regulation of cell migration • smoothened signaling pathway involved in regulation of cerebellar granule cell precursor cell proliferation • notochord regression • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of DNA replication • ventral midline development • multicellular organism development • regulation of smoothened signaling pathway • liver regeneration • response to wounding • regulation of osteoblast differentiation • osteoblast differentiation • Сперматогенез • positive regulation of cell population proliferation • cerebellar cortex morphogenesis • regulation of hepatocyte proliferation • canonical Wnt signaling pathway • smoothened signaling pathway • dorsal/ventral pattern formation • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • digestive tract morphogenesis • prostate gland development • positive regulation of cardiac muscle cell proliferation • positive regulation of cell cycle G1/S phase transition Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2735	14632
Ensembl	ENSG00000111087	ENSMUSG00000025407
UniProt	P08151	P47806
RefSeq (мРНК)	NM_001160045 NM_001167609 NM_005269	NM_010296
RefSeq (білок)	NP_001153517 NP_001161081 NP_005260	NP_034426
Локус (UCSC)	Хр. 12: 57.46 – 57.47 Mb	Хр. 10: 127.17 – 127.18 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GLI1 (англ. GLI family zinc finger 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 106 амінокислот, а молекулярна маса — 117 904[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MFNSMTPPPI		SSYGEPCCLR		PLPSQGAPSV		GTEGLSGPPF		CHQANLMSGP
HSYGPARETN		SCTEGPLFSS		PRSAVKLTKK		RALSISPLSD		ASLDLQTVIR
TSPSSLVAFI		NSRCTSPGGS		YGHLSIGTMS		PSLGFPAQMN		HQKGPSPSFG
VQPCGPHDSA		RGGMIPHPQS		RGPFPTCQLK		SELDMLVGKC		REEPLEGDMS
SPNSTGIQDP		LLGMLDGRED		LEREEKREPE		SVYETDCRWD		GCSQEFDSQE
QLVHHINSEH		IHGERKEFVC		HWGGCSRELR		PFKAQYMLVV		HMRRHTGEKP
HKCTFEGCRK		SYSRLENLKT		HLRSHTGEKP		YMCEHEGCSK		AFSNASDRAK
HQNRTHSNEK		PYVCKLPGCT		KRYTDPSSLR		KHVKTVHGPD		AHVTKRHRGD
GPLPRAPSIS		TVEPKREREG		GPIREESRLT		VPEGAMKPQP		SPGAQSSCSS
DHSPAGSAAN		TDSGVEMTGN		AGGSTEDLSS		LDEGPCIAGT		GLSTLRRLEN
LRLDQLHQLR		PIGTRGLKLP		SLSHTGTTVS		RRVGPPVSLE		RRSSSSSSIS
SAYTVSRRSS		LASPFPPGSP		PENGASSLPG		LMPAQHYLLR		ARYASARGGG
TSPTAASSLD		RIGGLPMPPW		RSRAEYPGYN		PNAGVTRRAS		DPAQAADRPA
PARVQRFKSL		GCVHTPPTVA		GGGQNFDPYL		PTSVYSPQPP		SITENAAMDA
RGLQEEPEVG		TSMVGSGLNP		YMDFPPTDTL		GYGGPEGAAA		EPYGARGPGS
LPLGPGPPTN		YGPNPCPQQA		SYPDPTQETW		GEFPSHSGLY		PGPKALGGTY
SQCPRLEHYG		QVQVKPEQGC		PVGSDSTGLA		PCLNAHPSEG		PPHPQPLFSH
YPQPSPPQYL		QSGPYTQPPP		DYLPSEPRPC		LDFDSPTHST		GQLKAQLVCN
YVQSQQELLW		EGGGREDAPA		QEPSYQSPKF		LGGSQVSPSR		AKAPVNTYGP
GFGPNLPNHK		SGSYPTPSPC		HENFVVGANR		ASHRAAAPPR		LLPPLPTCYG
PLKVGGTNPS		CGHPEVGRLG		GGPALYPPPE		GQVCNPLDSL		DLDNTQLDFV
AILDEPQGLS		PPPSHDQRGS		SGHTPPPSGP		PNMAVGNMSV		LLRSLPGETE
FLNSSA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Kinzler K.W., Ruppert J.M., Bigner S.H., Vogelstein B. (1988). The GLI gene is a member of the Kruppel family of zinc finger proteins. Nature. 332: 371—374. PMID 2832761 DOI:10.1038/332371a0
• Lo H.W., Zhu H., Cao X., Aldrich A., Ali-Osman F. (2009). A novel splice variant of GLI1 that promotes glioblastoma cell migration and invasion. Cancer Res. 69: 6790—6798. PMID 19706761 DOI:10.1158/0008-5472.CAN-09-0886
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kinzler K.W., Vogelstein B. (1990). The GLI gene encodes a nuclear protein which binds specific sequences in the human genome. Mol. Cell. Biol. 10: 634—642. PMID 2105456 DOI:10.1128/MCB.10.2.634
• Koyabu Y., Nakata K., Mizugishi K., Aruga J., Mikoshiba K. (2001). Physical and functional interactions between Zic and Gli proteins. J. Biol. Chem. 276: 6889—6892. PMID 11238441 DOI:10.1074/jbc.C000773200
• Maloverjan A., Piirsoo M., Michelson P., Kogerman P., Osterlund T. (2010). Identification of a novel serine/threonine kinase ULK3 as a positive regulator of Hedgehog pathway. Exp. Cell Res. 316: 627—637. PMID 19878745 DOI:10.1016/j.yexcr.2009.10.018

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4317 (англ.) . Архів оригіналу за 27 липня 2016. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2016-07-27 у Wayback Machine.]
4. UniProt, P08151 (англ.) . Архів оригіналу за 14 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 12

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»