ETV1
Ідентифікатори
Символи
ETV1 , ER81, ETS variant 1, ETS variant transcription factor 1
Зовнішні ІД
OMIM : 600541 MGI: 99254 HomoloGene: 3636 GeneCards: ETV1
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• клітинне ядро
Біологічний процес
• GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • peripheral nervous system neuron development • mechanosensory behavior • muscle organ development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • axon guidance • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • диференціація клітин
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 7: 13.89 – 13.99 Mb
Хр. 12: 38.83 – 38.92 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
ETV1 (англ. ETS variant 1 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 477 амінокислот , а молекулярна маса — 55 131[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MDGFYDQQVP YMVTNSQRGR NCNEKPTNVR KRKFINRDLA HDSEELFQDL
SQLQETWLAE AQVPDNDEQF VPDYQAESLA FHGLPLKIKK EPHSPCSEIS
SACSQEQPFK FSYGEKCLYN VSAYDQKPQV GMRPSNPPTP SSTPVSPLHH
ASPNSTHTPK PDRAFPAHLP PSQSIPDSSY PMDHRFRRQL SEPCNSFPPL
PTMPREGRPM YQRQMSEPNI PFPPQGFKQE YHDPVYEHNT MVGSAASQSF
PPPLMIKQEP RDFAYDSEVP SCHSIYMRQE GFLAHPSRTE GCMFEKGPRQ
FYDDTCVVPE KFDGDIKQEP GMYREGPTYQ RRGSLQLWQF LVALLDDPSN
SHFIAWTGRG MEFKLIEPEE VARRWGIQKN RPAMNYDKLS RSLRYYYEKG
IMQKVAGERY VYKFVCDPEA LFSMAFPDNQ RPLLKTDMER HINEEDTVPL
SHFDESMAYM PEGGCCNPHP YNEGYVY
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
Література
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Wu J., Janknecht R. (2002). Regulation of the ETS transcription factor ER81 by the 90-kDa ribosomal S6 kinase 1 and protein kinase A. J. Biol. Chem . 277 : 42669—42679. PMID 12213813 DOI :10.1074/jbc.M205501200
Janknecht R. (2003). Regulation of the ER81 transcription factor and its coactivators by mitogen- and stress-activated protein kinase 1 (MSK1). Oncogene . 22 : 746—755. PMID 12569367 DOI :10.1038/sj.onc.1206185
Gocke C.B., Yu H., Kang J. (2005). Systematic identification and analysis of mammalian small ubiquitin-like modifier substrates. J. Biol. Chem . 280 : 5004—5012. PMID 15561718 DOI :10.1074/jbc.M411718200
Примітки
Див. також
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші