uk IRF5

IRF5
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3DSH
Ідентифікатори
Символи	IRF5, SLEB10, interferon regulatory factor 5
Зовнішні ІД	OMIM: 607218 MGI: 1350924 HomoloGene: 8088 GeneCards: IRF5
Пов'язані генетичні захворювання
	ревматоїдний артрит, inflammatory bowel disease 14
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • sequence-specific DNA binding; • identical protein binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of interleukin-12 production; • interferon-gamma-mediated signaling pathway; • процес імунної системи; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • positive regulation of interferon-alpha production; • response to muramyl dipeptide; • transcription, DNA-templated; • defense response to virus; • type I interferon signaling pathway; • response to peptidoglycan; • positive regulation of apoptotic process; • вроджений імунітет; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • positive regulation of interferon-beta production; • cytokine-mediated signaling pathway; • transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	3663
	27056
	ENSG00000128604
	ENSMUSG00000029771
	Q13568
	P56477
NM_001098627; NM_001098629; NM_001098630; NM_001242452; NM_032643;
	NM_001347928; NM_001364314
	NM_001252382; NM_012057; NM_001311083
NP_001092097; NP_001092099; NP_001092100; NP_001229381; NP_116032;
	NP_001334857; NP_001351243; NP_001092099.1
	NP_001239311; NP_001298012; NP_036187
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

IRF5 (англ. Interferon regulatory factor 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 498 амінокислот, а молекулярна маса — 56 044^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNQSIPVAPT	PPRRVRLKPW	LVAQVNSCQY	PGLQWVNGEK	KLFCIPWRHA
TRHGPSQDGD	NTIFKAWAKE	TGKYTEGVDE	ADPAKWKANL	RCALNKSRDF
RLIYDGPRDM	PPQPYKIYEV	CSNGPAPTDS	QPPEDYSFGA	GEEEEEEEEL
QRMLPSLSLT	EDVKWPPTLQ	PPTLRPPTLQ	PPTLQPPVVL	GPPAPDPSPL
APPPGNPAGF	RELLSEVLEP	GPLPASLPPA	GEQLLPDLLI	SPHMLPLTDL
EIKFQYRGRP	PRALTISNPH	GCRLFYSQLE	ATQEQVELFG	PISLEQVRFP
SPEDIPSDKQ	RFYTNQLLDV	LDRGLILQLQ	GQDLYAIRLC	QCKVFWSGPC
ASAHDSCPNP	IQREVKTKLF	SLEHFLNELI	LFQKGQTNTP	PPFEIFFCFG
EEWPDRKPRE	KKLITVQVVP	VAARLLLEMF	SGELSWSADS	IRLQISNPDL
KDRMVEQFKE	LHHIWQSQQR	LQPVAQAPPG	AGLGVGQGPW	PMHPAGMQ

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, транскрипція, регуляція транскрипції, противірусний захист, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Barnes B.J., Moore P.A., Pitha P.M. (2001). Virus-specific activation of a novel interferon regulatory factor, IRF-5, results in the induction of distinct interferon alpha genes. J. Biol. Chem. 276: 23382—23390. PMID 11303025 doi:10.1074/jbc.M101216200
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Barnes B.J., Kellum M.J., Field A.E., Pitha P.M. (2002). Multiple regulatory domains of IRF-5 control activation, cellular localization, and induction of chemokines that mediate recruitment of T lymphocytes. Mol. Cell. Biol. 22: 5721—5740. PMID 12138184 doi:10.1128/MCB.22.16.5721-5740.2002
Lin R., Yang L., Arguello M., Penafuerte C., Hiscott J. (2005). A CRM1-dependent nuclear export pathway is involved in the regulation of IRF-5 subcellular localization. J. Biol. Chem. 280: 3088—3095. PMID 15556946 doi:10.1074/jbc.M408452200
Balkhi M.Y., Fitzgerald K.A., Pitha P.M. (2008). Functional regulation of MyD88-activated interferon regulatory factor 5 by K63-linked polyubiquitination. Mol. Cell. Biol. 28: 7296—7308. PMID 18824541 doi:10.1128/MCB.00662-08
Chang Foreman H.C., Van Scoy S., Cheng T.F., Reich N.C. (2012). Activation of interferon regulatory factor 5 by site specific phosphorylation. PLoS ONE. 7: E33098—E33098. PMID 22412986 doi:10.1371/journal.pone.0033098