NFATC2
Ідентифікатори
Символи
NFATC2 , NFAT1, NFATP, nuclear factor of activated T-cells 2, nuclear factor of activated T cells 2
Зовнішні ІД
OMIM : 600490 MGI: 102463 HomoloGene: 7861 GeneCards: NFATC2
Пов'язані генетичні захворювання
бічний аміотрофічний склероз [ 1]
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor binding • chromatin binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • phosphatase binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• цитоплазма • transcription regulator complex • нуклеоплазма • клітинне ядро • гіалоплазма • Рибонуклеопротеїни
Біологічний процес
• B cell receptor signaling pathway • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0032617 творба цитокінів • calcineurin-NFAT signaling cascade • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • myotube cell development • transcription, DNA-templated • cellular response to DNA damage stimulus • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • Fc-epsilon receptor signaling pathway • positive regulation of myoblast fusion • GO:1901313 positive regulation of gene expression • positive regulation of B cell proliferation • cell migration • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of regulatory T cell differentiation • negative regulation of vascular associated smooth muscle cell differentiation
Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 20: 51.39 – 51.56 Mb
Хр. 2: 168.32 – 168.44 Mb
PubMed search
[ 2]
[ 3] Вікідані
NFATC2 (англ. Nuclear factor of activated T-cells 2 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[ 4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 925 амінокислот , а молекулярна маса — 100 146[ 5] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MNAPERQPQP DGGDAPGHEP GGSPQDELDF SILFDYEYLN PNEEEPNAHK
VASPPSGPAY PDDVLDYGLK PYSPLASLSG EPPGRFGEPD RVGPQKFLSA
AKPAGASGLS PRIEITPSHE LIQAVGPLRM RDAGLLVEQP PLAGVAASPR
FTLPVPGFEG YREPLCLSPA SSGSSASFIS DTFSPYTSPC VSPNNGGPDD
LCPQFQNIPA HYSPRTSPIM SPRTSLAEDS CLGRHSPVPR PASRSSSPGA
KRRHSCAEAL VALPPGASPQ RSRSPSPQPS SHVAPQDHGS PAGYPPVAGS
AVIMDALNSL ATDSPCGIPP KMWKTSPDPS PVSAAPSKAG LPRHIYPAVE
FLGPCEQGER RNSAPESILL VPPTWPKPLV PAIPICSIPV TASLPPLEWP
LSSQSGSYEL RIEVQPKPHH RAHYETEGSR GAVKAPTGGH PVVQLHGYME
NKPLGLQIFI GTADERILKP HAFYQVHRIT GKTVTTTSYE KIVGNTKVLE
IPLEPKNNMR ATIDCAGILK LRNADIELRK GETDIGRKNT RVRLVFRVHI
PESSGRIVSL QTASNPIECS QRSAHELPMV ERQDTDSCLV YGGQQMILTG
QNFTSESKVV FTEKTTDGQQ IWEMEATVDK DKSQPNMLFV EIPEYRNKHI
RTPVKVNFYV INGKRKRSQP QHFTYHPVPA IKTEPTDEYD PTLICSPTHG
GLGSQPYYPQ HPMVAESPSC LVATMAPCQQ FRTGLSSPDA RYQQQNPAAV
LYQRSKSLSP SLLGYQQPAL MAAPLSLADA HRSVLVHAGS QGQSSALLHP
SPTNQQASPV IHYSPTNQQL RCGSHQEFQH IMYCENFAPG TTRPGPPPVS
QGQRLSPGSY PTVIQQQNAT SQRAAKNGPP VSDQKEVLPA GVTIKQEQNL
DQTYLDDVNE IIRKEFSGPP ARNQT
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у цитоплазмі , ядрі .
Література
Vihma H., Pruunsild P., Timmusk T. (2008). Alternative splicing and expression of human and mouse NFAT genes. Genomics . 92 : 279—291. PMID 18675896 doi :10.1016/j.ygeno.2008.06.011
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi :10.1101/gr.2596504
Crabtree G.R. (1999). Generic signals and specific outcomes: signaling through Ca2+, calcineurin, and NF-AT. Cell . 96 : 611—614. PMID 10089876 doi :10.1016/S0092-8674(00)80571-1
Bettelli E., Dastrange M., Oukka M. (2005). Foxp3 interacts with nuclear factor of activated T cells and NF-kappa B to repress cytokine gene expression and effector functions of T helper cells. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A . 102 : 5138—5143. PMID 15790681 doi :10.1073/pnas.0501675102
Yiu G.K., Kaunisto A., Chin Y.R., Toker A. (2011). NFAT promotes carcinoma invasive migration through glypican-6. Biochem. J . 440 : 157—166. PMID 21871017 doi :10.1042/BJ20110530
Примітки
Див. також
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші