PAX9
Ідентифікатори
Символи
PAX9 , STHAG3, paired box 9
Зовнішні ІД
OMIM : 167416 MGI: 97493 HomoloGene: 31360 GeneCards: PAX9
Пов'язані генетичні захворювання
tooth agenesis [ 1]
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• клітинне ядро
Біологічний процес
• regulation of odontogenesis • multicellular organism development • cellular response to growth factor stimulus • endoderm development • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • face morphogenesis • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • odontogenesis • animal organ morphogenesis
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 14: 36.66 – 36.68 Mb
Хр. 12: 56.74 – 56.76 Mb
PubMed search
[ 2]
[ 3] Вікідані
PAX9 (англ. Paired box 9 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.[ 4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 341 амінокислот , а молекулярна маса — 36 310[ 5] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MEPAFGEVNQ LGGVFVNGRP LPNAIRLRIV ELAQLGIRPC DISRQLRVSH
GCVSKILARY NETGSILPGA IGGSKPRVTT PTVVKHIRTY KQRDPGIFAW
EIRDRLLADG VCDKYNVPSV SSISRILRNK IGNLAQQGHY DSYKQHQPTP
QPALPYNHIY SYPSPITAAA AKVPTPPGVP AIPGSVAMPR TWPSSHSVTD
ILGIRSITDQ VSDSSPYHSP KVEEWSSLGR NNFPAAAPHA VNGLEKGALE
QEAKYGQAPN GLPAVGSFVS ASSMAPYPTP AQVSPYMTYS AAPSGYVAGH
GWQHAGGTSL SPHNCDIPAS LAFKGMQAAR EGSHSVTASA L
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
Література
Hetzer-Egger C., Schorpp M., Boehm T. (2000). Evolutionary conservation of gene structures of the Pax1/9 gene family. Biochim. Biophys. Acta . 1492 : 517—521. PMID 10899593 doi :10.1016/S0167-4781(00)00130-5
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi :10.1101/gr.2596504
Stapleton P., Weith A., Urbanek P., Kozmik Z., Busslinger M. (1993). Chromosomal localization of seven PAX genes and cloning of a novel family member, PAX-9. Nat. Genet . 3 : 292—298. PMID 7981748 doi :10.1038/ng0493-292
Peters H., Schuster G., Neubueser A., Richter T., Hoefler H. (1997). Isolation of the Pax9 cDNA from adult human esophagus. Mamm. Genome . 8 : 62—64. PMID 9021154 doi :10.1007/s003359900351
Mostowska A., Kobielak A., Biedziak B., Trzeciak W.H. (2003). Novel mutation in the paired box sequence of PAX9 gene in a sporadic form of oligodontia. Eur. J. Oral Sci . 111 : 272—276. PMID 12786960 doi :10.1034/j.1600-0722.2003.00036.x
Примітки
Див. також
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші