TAF10

TAF10
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2F69, 3M53, 3M54, 3M55, 3M56, 3M57, 3M58, 3M59, 3M5A, 4J7F, 4J7I, 4J83, 4J8O, 4WV4, 5EG2
Ідентифікатори
Символи	TAF10, TAF2A, TAF2H, TAFII30, TATA-box binding protein associated factor 10
Зовнішні ІД	OMIM: 600475 MGI: 1346320 HomoloGene: 86923 GeneCards: TAF10
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • histone acetyltransferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA polymerase binding • enzyme binding • estrogen receptor binding • thiol-dependent deubiquitinase • DNA binding • GO:0000983 RNA polymerase II general transcription initiation factor activity Клітинна компонента • цитоплазма • transcription factor TFTC complex • transcription factor TFIID complex • perinuclear region of cytoplasm • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • histone deubiquitination • histone H3 acetylation • DNA-templated transcription, initiation • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • protein homooligomerization • regulation of signal transduction by p53 class mediator • protein deubiquitination • liver development • GO:0097285 апоптоз • регуляція експресії генів • multicellular organism growth • regulation of DNA binding • hepatocyte differentiation • G1/S transition of mitotic cell cycle • positive regulation of nucleic acid-templated transcription Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6881	24075
Ensembl	ENSG00000166337	ENSMUSG00000043866
UniProt	Q12962	Q8K0H5
RefSeq (мРНК)	NM_006284	NM_020024
RefSeq (білок)	NP_006275	NP_064408
Локус (UCSC)	Хр. 11: 6.61 – 6.61 Mb	Хр. 7: 105.39 – 105.39 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TAF10 (англ. TATA-box binding protein associated factor 10) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 218 амінокислот, а молекулярна маса — 21 711[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSCSGSGADP		EAAPASAASA		PGPAPPVSAP		AALPSSTAAE		NKASPAGTAG
GPGAGAAAGG		TGPLAARAGE		PAERRGAAPV		SAGGAAPPEG		AISNGVYVLP
SAANGDVKPV		VSSTPLVDFL		MQLEDYTPTI		PDAVTGYYLN		RAGFEASDPR
IIRLISLAAQ		KFISDIANDA		LQHCKMKGTA		SGSSRSKSKD		RKYTLTMEDL
TPALSEYGIN		VKKPHYFT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання. Локалізований у ядрі.

Література

• Scheer E., Mattei M.-G., Jacq X., Chambon P., Tora L. (1995). Organization and chromosomal localization of the gene (TAF2H) encoding the human TBP-associated factor II 30 (TAFII30). Genomics. 29: 269—272. PMID 8530084 doi:10.1006/geno.1995.1243
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Brand M., Yamamoto K., Staub A., Tora L. (1999). Identification of TATA-binding protein-free TAFII-containing complex subunits suggests a role in nucleosome acetylation and signal transduction. J. Biol. Chem. 274: 18285—18289. PMID 10373431 doi:10.1074/jbc.274.26.18285
• Kouskouti A., Scheer E., Staub A., Tora L., Talianidis I. (2004). Gene-specific modulation of TAF10 function by SET9-mediated methylation. Mol. Cell. 14: 175—182. PMID 15099517 doi:10.1016/S1097-2765(04)00182-0
• Couture J.-F., Collazo E., Hauk G., Trievel R.C. (2006). Structural basis for the methylation site specificity of SET7/9. Nat. Struct. Mol. Biol. 13: 140—146. PMID 16415881 doi:10.1038/nsmb1045
• Cavusoglu N., Brand M., Tora L., van Dorsselaer A. (2003). Novel subunits of the TATA binding protein free TAFII-containing transcription complex identified by matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight mass spectrometry following one-dimensional gel electrophoresis. Proteomics. 3: 217—223. PMID 12601814 doi:10.1002/pmic.200390030

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11543 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
4. UniProt, Q12962 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 11

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»