POU5F1
Ідентифікатори
Символи
POU5F1 , OCT3, OCT4, OTF-3, OTF3, OTF4, Oct-3, Oct-4, POU class 5 homeobox 1, Oct3/4
Зовнішні ІД
OMIM : 164177 MGI: 101893 HomoloGene: 8422 GeneCards: POU5F1
Пов'язані генетичні захворювання
синдром Стівенса — Джонсона [ 1]
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • sequence-specific DNA binding • miRNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • transcription factor binding • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • ubiquitin protein ligase binding • RNA binding
Клітинна компонента
• цитоплазма • гіалоплазма • transcription regulator complex • нуклеоплазма • клітинне ядро • мітохондрія
Біологічний процес
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • somatic stem cell population maintenance • GO:1905617 negative regulation of gene silencing by miRNA • cell fate commitment involved in formation of primary germ layer • endodermal cell fate specification • anatomical structure morphogenesis • mRNA transcription by RNA polymerase II • regulation of asymmetric cell division • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • regulation of DNA methylation-dependent heterochromatin assembly • multicellular organism development • cardiac cell fate determination • response to wounding • BMP signaling pathway involved in heart induction • регуляція експресії генів • regulation of heart induction by regulation of canonical Wnt signaling pathway • blastocyst development • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of SMAD protein signal transduction
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 6: 31.16 – 31.18 Mb
Хр. 17: 35.82 – 35.82 Mb
PubMed search
[ 2]
[ 3] Вікідані
POU5F1 (англ. POU class 5 homeobox 1 ), більш відомий як Oct-4 (octamer-binding transcription factor 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[ 4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 360 амінокислот , а молекулярна маса — 38 571[ 5] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MAGHLASDFA FSPPPGGGGD GPGGPEPGWV DPRTWLSFQG PPGGPGIGPG
VGPGSEVWGI PPCPPPYEFC GGMAYCGPQV GVGLVPQGGL ETSQPEGEAG
VGVESNSDGA SPEPCTVTPG AVKLEKEKLE QNPEESQDIK ALQKELEQFA
KLLKQKRITL GYTQADVGLT LGVLFGKVFS QTTICRFEAL QLSFKNMCKL
RPLLQKWVEE ADNNENLQEI CKAETLVQAR KRKRTSIENR VRGNLENLFL
QCPKPTLQQI SHIAQQLGLE KDVVRVWFCN RRQKGKRSSS DYAQREDFEA
AGSPFSGGPV SFPLAPGPHF GTPGYGSPHF TALYSSVPFP EGEAFPPVSV
TTLGSPMHSN
Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у цитоплазмі , ядрі .
Література
Takeda J., Seino S., Bell G.I. (1992). Human Oct3 gene family: cDNA sequences, alternative splicing, gene organization, chromosomal location, and expression at low levels in adult tissues. Nucleic Acids Res . 20 : 4613—4620. PMID 1408763 DOI :10.1093/nar/20.17.4613
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Wey E., Lyons G.E., Schaefer B.W. (1994). A human POU domain gene, mPOU, is expressed in developing brain and specific adult tissues. Eur. J. Biochem. 220 : 753—762. PMID 7908264 DOI :10.1111/j.1432-1033.1994.tb18676.x
Abdel-Rahman B., Fiddler M., Rappolee D., Pergament E. (1995). Expression of transcription regulating genes in human preimplantation embryos . Hum. Reprod . 10 : 2787—2792. PMID 8567814 DOI :10.1093/oxfordjournals.humrep.a135792
Lee J., Kim H.K., Han Y.-M., Kim J. (2008). Pyruvate kinase isozyme type M2 (PKM2) interacts and cooperates with Oct-4 in regulating transcription. Int. J. Biochem. Cell Biol . 40 : 1043—1054. PMID 18191611 DOI :10.1016/j.biocel.2007.11.009
Spelat R., Ferro F., Curcio F. (2012). Serine 111 phosphorylation regulates OCT4A protein subcellular distribution and degradation. J. Biol. Chem . 287 : 38279—38288. PMID 23024368 DOI :10.1074/jbc.M112.386755
Примітки
Див. також
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші