TCF7L2
Ідентифікатори
Символи
TCF7L2 , TCF-4, TCF4, transcription factor 7 like 2
Зовнішні ІД
OMIM : 602228 MGI: 1202879 HomoloGene: 7564 GeneCards: TCF7L2
Пов'язані генетичні захворювання
цукровий діабет 2-го типу , біполярний афективний розлад , рак молочної залози , ішемічна хвороба серця , метаболічні захворювання , колоректальний рак [ 1]
Онтологія гена
Молекулярна функція
• sequence-specific DNA binding • DNA binding • beta-catenin binding • gamma-catenin binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • transcription factor binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • armadillo repeat domain binding • protein kinase binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • chromatin binding
Клітинна компонента
• beta-catenin-TCF7L2 complex • PML body • нуклеоплазма • protein-DNA complex • клітинне ядро • transcription regulator complex
Біологічний процес
• positive regulation of heparan sulfate proteoglycan biosynthetic process • positive regulation of protein kinase B signaling • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • glucose homeostasis • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • response to glucose • Wnt signaling pathway • regulation of smooth muscle cell proliferation • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity • canonical Wnt signaling pathway involved in positive regulation of epithelial to mesenchymal transition • transcription, DNA-templated • positive regulation of protein export from nucleus • maintenance of DNA repeat elements • blood vessel development • myoblast fate commitment • canonical Wnt signaling pathway • pancreas development • positive regulation of protein binding • regulation of hormone metabolic process • проліферація • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • fat cell differentiation • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • beta-catenin-TCF complex assembly • Wnt signaling pathway, calcium modulating pathway • positive regulation of insulin secretion • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of type B pancreatic cell apoptotic process • negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway • positive regulation of epithelial cell proliferation
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 10: 112.95 – 113.17 Mb
Хр. 19: 55.73 – 55.92 Mb
PubMed search
[ 2]
[ 3] Вікідані
TCF7L2 (англ. Transcription factor 7 like 2 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[ 4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 619 амінокислот , а молекулярна маса — 67 919[ 5] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MPQLNGGGGD DLGANDELIS FKDEGEQEEK SSENSSAERD LADVKSSLVN
ESETNQNSSS DSEAERRPPP RSESFRDKSR ESLEEAAKRQ DGGLFKGPPY
PGYPFIMIPD LTSPYLPNGS LSPTARTLHF QSGSTHYSAY KTIEHQIAVQ
YLQMKWPLLD VQAGSLQSRQ ALKDARSPSP AHIVSNKVPV VQHPHHVHPL
TPLITYSNEH FTPGNPPPHL PADVDPKTGI PRPPHPPDIS PYYPLSPGTV
GQIPHPLGWL VPQQGQPVYP ITTGGFRHPY PTALTVNASM SRFPPHMVPP
HHTLHTTGIP HPAIVTPTVK QESSQSDVGS LHSSKHQDSK KEEEKKKPHI
KKPLNAFMLY MKEMRAKVVA ECTLKESAAI NQILGRRWHA LSREEQAKYY
ELARKERQLH MQLYPGWSAR DNYGKKKKRK RDKQPGETNE HSECFLNPCL
SLPPITDLSA PKKCRARFGL DQQNNWCGPC RRKKKCVRYI QGEGSCLSPP
SSDGSLLDSP PPSPNLLGSP PRDAKSQTEQ TQPLSLSLKP DPLAHLSMMP
PPPALLLAEA THKASALCPN GALDLPPAAL QPAAPSSSIA QPSTSSLHSH
SSLAGTQPQP LSLVTKSLE
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів , активаторів , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , сигнальний шлях Wnt, альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
Література
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Barker N., Huls G., Korinek V., Clevers H. (1999). Restricted high level expression of Tcf-4 protein in intestinal and mammary gland epithelium . Am. J. Pathol . 154 : 29—35. PMID 9916915 DOI :10.1016/S0002-9440(10)65247-9
Omer C.A., Miller P.J., Diehl R.E., Kral A.M. (1999). Identification of Tcf4 residues involved in high-affinity beta-catenin binding. Biochem. Biophys. Res. Commun . 256 : 584—590. PMID 10080941 DOI :10.1006/bbrc.1999.0379
Brantjes H., Roose J., van De Wetering M., Clevers H. (2001). All Tcf HMG box transcription factors interact with Groucho-related co-repressors. Nucleic Acids Res . 29 : 1410—1419. PMID 11266540 DOI :10.1093/nar/29.7.1410
Yamamoto H., Ihara M., Matsuura Y., Kikuchi A. (2003). Sumoylation is involved in beta-catenin-dependent activation of Tcf-4. EMBO J . 22 : 2047—2059. PMID 12727872 DOI :10.1093/emboj/cdg204
Hecht A., Stemmler M.P. (2003). Identification of a promoter-specific transcriptional activation domain at the C-terminus of the Wnt effector protein T-cell factor 4. J. Biol. Chem . 278 : 3776—3785. PMID 12446687 DOI :10.1074/jbc.M210081200
Примітки
Див. також
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші