uk SP1

SP1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1SP1, 1SP2, 1VA1, 1VA2, 1VA3
Ідентифікатори
Символи	SP1, entrez:6667, Sp1 transcription factor
Зовнішні ІД	OMIM: 189906 MGI: 98372 HomoloGene: 8276 GeneCards: SP1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein homodimerization activity; • HMG box domain binding; • transcription factor binding; • histone deacetylase binding; • зв'язування з іоном металу; • transcription factor activity, RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific binding; • bHLH transcription factor binding; • protein C-terminus binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • histone acetyltransferase binding; • nucleic acid binding; • sequence-specific DNA binding; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • DNA binding; • double-stranded DNA binding; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • core promoter sequence-specific DNA binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • нуклеоплазма; • protein-DNA complex; • клітинне ядро; • transcription repressor complex;
Біологічний процес	• positive regulation of hydrogen sulfide biosynthetic process; • ритмічний процес; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated; • GO:0022415 viral process; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • transcription, DNA-templated; • snRNA transcription by RNA polymerase II; • cellular response to insulin stimulus; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • regulation of cholesterol biosynthetic process; • GO:1901313 positive regulation of gene expression; • positive regulation of blood vessel endothelial cell migration; • positive regulation of angiogenesis; • positive regulation of vascular endothelial cell proliferation; • response to hydroperoxide;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	6667
	20683
	ENSG00000185591
	ENSMUSG00000001280
	P08047
	O89090
	NM_001251825; NM_003109; NM_138473
	NM_013672
	NP_001238754; NP_003100; NP_612482
	NP_038700
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SP1 (англ. Sp1 transcription factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 785 амінокислот, а молекулярна маса — 80 693^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSDQDHSMDE	MTAVVKIEKG	VGGNNGGNGN	GGGAFSQARS	SSTGSSSSTG
GGGQESQPSP	LALLAATCSR	IESPNENSNN	SQGPSQSGGT	GELDLTATQL
SQGANGWQII	SSSSGATPTS	KEQSGSSTNG	SNGSESSKNR	TVSGGQYVVA
AAPNLQNQQV	LTGLPGVMPN	IQYQVIPQFQ	TVDGQQLQFA	ATGAQVQQDG
SGQIQIIPGA	NQQIITNRGS	GGNIIAAMPN	LLQQAVPLQG	LANNVLSGQT
QYVTNVPVAL	NGNITLLPVN	SVSAATLTPS	SQAVTISSSG	SQESGSQPVT
SGTTISSASL	VSSQASSSSF	FTNANSYSTT	TTTSNMGIMN	FTTSGSSGTN
SQGQTPQRVS	GLQGSDALNI	QQNQTSGGSL	QAGQQKEGEQ	NQQTQQQQIL
IQPQLVQGGQ	ALQALQAAPL	SGQTFTTQAI	SQETLQNLQL	QAVPNSGPII
IRTPTVGPNG	QVSWQTLQLQ	NLQVQNPQAQ	TITLAPMQGV	SLGQTSSSNT
TLTPIASAAS	IPAGTVTVNA	AQLSSMPGLQ	TINLSALGTS	GIQVHPIQGL
PLAIANAPGD	HGAQLGLHGA	GGDGIHDDTA	GGEEGENSPD	AQPQAGRRTR
REACTCPYCK	DSEGRGSGDP	GKKKQHICHI	QGCGKVYGKT	SHLRAHLRWH
TGERPFMCTW	SYCGKRFTRS	DELQRHKRTH	TGEKKFACPE	CPKRFMRSDH
LSKHIKTHQN	KKGGPGVALS	VGTLPLDSGA	GSEGSGTATP	SALITTNMVA
MEAICPEGIA	RLANSGINVM	QVADLQSINI	SGNGF

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Takahara T., Kanazu S., Yanagisawa S., Akanuma H. (2000). Heterogeneous Sp1 mRNAs in human HepG2 cells include a product of homotypic trans-splicing. J. Biol. Chem. 275: 38067—38072. PMID 10973950 doi:10.1074/jbc.M002010200
Kadonaga J.T., Carner K.R., Masiarz F.R., Tjian R. (1987). Isolation of cDNA encoding transcription factor Sp1 and functional analysis of the DNA binding domain. Cell. 51: 1079—1090. PMID 3319186 doi:10.1016/0092-8674(87)90594-0
Jackson S.P., Tjian R. (1988). O-glycosylation of eukaryotic transcription factors: implications for mechanisms of transcriptional regulation. Cell. 55: 125—133. PMID 3139301 doi:10.1016/0092-8674(88)90015-3
Courey A.J., Tjian R. (1988). Analysis of Sp1 in vivo reveals multiple transcriptional domains, including a novel glutamine-rich activation motif. Cell. 55: 887—898. PMID 3142690 doi:10.1016/0092-8674(88)90144-4
Wang L., Mukherjee S., Jia F., Narayan O., Zhao L.J. (1995). Interaction of virion protein Vpr of human immunodeficiency virus type 1 with cellular transcription factor Sp1 and trans-activation of viral long terminal repeat. J. Biol. Chem. 270: 25564—25569. PMID 7592727 doi:10.1074/jbc.270.43.25564

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11205 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P08047 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 12

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11205 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, P08047 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

SP1

Література

Примітки

Див. також

Portal di Ensiklopedia Dunia