DDR2 (ген)

DDR2
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи DDR2, MIG20a, NTRKR3, TKT, TYRO10, discoidin domain receptor tyrosine kinase 2, WRCN
Зовнішні ІД OMIM: 191311 MGI: 1345277 HomoloGene: 68505 GeneCards: DDR2
Пов'язані генетичні захворювання
spondyloepimetaphyseal dysplasia-short limb-abnormal calcification syndrome[1]
Реагує на сполуку
сорафеніб[2]
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001014796
NM_006182
NM_001354982
NM_001354983
NM_022563
RefSeq (білок)
NP_001014796
NP_006173
NP_001341911
NP_001341912
NP_072075
Локус (UCSC) Хр. 1: 162.63 – 162.79 Mb Хр. 1: 169.8 – 169.94 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

DDR2 (англ. Discoidin domain receptor tyrosine kinase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 855 амінокислот, а молекулярна маса — 96 736[6].

Послідовність амінокислот
1020304050
MILIPRMLLVLFLLLPILSSAKAQVNPAICRYPLGMSGGQIPDEDITASS
QWSESTAAKYGRLDSEEGDGAWCPEIPVEPDDLKEFLQIDLHTLHFITLV
GTQGRHAGGHGIEFAPMYKINYSRDGTRWISWRNRHGKQVLDGNSNPYDI
FLKDLEPPIVARFVRFIPVTDHSMNVCMRVELYGCVWLDGLVSYNAPAGQ
QFVLPGGSIIYLNDSVYDGAVGYSMTEGLGQLTDGVSGLDDFTQTHEYHV
WPGYDYVGWRNESATNGYIEIMFEFDRIRNFTTMKVHCNNMFAKGVKIFK
EVQCYFRSEASEWEPNAISFPLVLDDVNPSARFVTVPLHHRMASAIKCQY
HFADTWMMFSEITFQSDAAMYNNSEALPTSPMAPTTYDPMLKVDDSNTRI
LIGCLVAIIFILLAIIVIILWRQFWQKMLEKASRRMLDDEMTVSLSLPSD
SSMFNNNRSSSPSEQGSNSTYDRIFPLRPDYQEPSRLIRKLPEFAPGEEE
SGCSGVVKPVQPSGPEGVPHYAEADIVNLQGVTGGNTYSVPAVTMDLLSG
KDVAVEEFPRKLLTFKEKLGEGQFGEVHLCEVEGMEKFKDKDFALDVSAN
QPVLVAVKMLRADANKNARNDFLKEIKIMSRLKDPNIIHLLAVCITDDPL
CMITEYMENGDLNQFLSRHEPPNSSSSDVRTVSYTNLKFMATQIASGMKY
LSSLNFVHRDLATRNCLVGKNYTIKIADFGMSRNLYSGDYYRIQGRAVLP
IRWMSWESILLGKFTTASDVWAFGVTLWETFTFCQEQPYSQLSDEQVIEN
TGEFFRDQGRQTYLPQPAICPDSVYKLMLSCWRRDTKNRPSFQEIHLLLL
QQGDE

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, рецепторів, тирозинових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як остеогенез, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Vogel W., Gish G.D., Alves F., Pawson T. (1997). The discoidin domain receptor tyrosine kinases are activated by collagen. Mol. Cell. 1: 13—23. PMID 9659899 DOI:10.1016/S1097-2765(00)80003-9
  • Wall S.J., Werner E., Werb Z., DeClerck Y.A. (2005). Discoidin domain receptor 2 mediates tumor cell cycle arrest induced by fibrillar collagen. J. Biol. Chem. 280: 40187—40194. PMID 16186104 DOI:10.1074/jbc.M508226200
  • Vogel W.F., Abdulhussein R., Ford C.E. (2006). Sensing extracellular matrix: an update on discoidin domain receptor function. Cell. Signal. 18: 1108—1116. PMID 16626936 DOI:10.1016/j.cellsig.2006.02.012
  • Leitinger B. (2011). Transmembrane collagen receptors. Annu. Rev. Cell Dev. Biol. 27: 265—290. PMID 21568710 DOI:10.1146/annurev-cellbio-092910-154013

Примітки

Див. також