CCR5

CCR5
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2L87, 2RLL, 2RRS, 2MZX, 4MBS
Ідентифікатори
Символи	CCR5, CC-CKR-5, CCCKR5, CCR-5, CD195, CKR-5, CKR5, CMKBR5, IDDM22, C-C motif chemokine receptor 5 (gene/pseudogene), C-C motif chemokine receptor 5
Зовнішні ІД	OMIM: 601373 MGI: 107182 HomoloGene: 37325 GeneCards: CCR5
Пов'язані генетичні захворювання
type 1 diabetes mellitus 22, ВІЛ-заворювання[1]
Реагує на сполуку
aplaviroc, ценікрівірок, маравірок, vicriviroc, aplaviroc hydrochloride, AZD5672[2]
Онтологія гена Молекулярна функція • G protein-coupled receptor activity • coreceptor activity • chemokine (C-C motif) ligand 5 binding • virus receptor activity • signal transducer activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • chemokine receptor activity • C-C chemokine receptor activity • actin binding • phosphatidylinositol phospholipase C activity • C-C chemokine binding • chemokine binding Клітинна компонента • цитоплазма • integral component of membrane • ендосома • мембрана • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • external side of plasma membrane • cell surface Біологічний процес • G protein-coupled receptor signaling pathway • signaling • response to cholesterol • release of sequestered calcium ion into cytosol by sarcoplasmic reticulum • positive regulation of cytosolic calcium ion concentration • cell-cell signaling • dendritic cell chemotaxis • MAPK cascade • хемотаксис • cellular defense response • cell surface receptor signaling pathway • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • inflammatory response • cellular response to lipopolysaccharide • calcium ion transport • calcium-mediated signaling • GO:0072468 сигнальна трансдукція • fusion of virus membrane with host plasma membrane • chemokine-mediated signaling pathway • GO:0022415 viral process • defense response • negative regulation of macrophage apoptotic process • cytokine-mediated signaling pathway • cell chemotaxis Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1234	12774
Ensembl	ENSG00000160791	ENSMUSG00000079227
UniProt	P51681	P51682
RefSeq (мРНК)	NM_001100168 NM_000579 NM_001394783	NM_009917
RefSeq (білок)	NP_000570 NP_001093638	NP_034047
Локус (UCSC)	Хр. 3: 46.37 – 46.38 Mb	Хр. 9: 123.92 – 123.95 Mb
PubMed search	[3]	[4]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CCR5 (англ. C-C motif chemokine receptor 5 (gene/pseudogene)) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 352 амінокислот, а молекулярна маса — 40 524[6].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDYQVSSPIY		DINYYTSEPC		QKINVKQIAA		RLLPPLYSLV		FIFGFVGNML
VILILINCKR		LKSMTDIYLL		NLAISDLFFL		LTVPFWAHYA		AAQWDFGNTM
CQLLTGLYFI		GFFSGIFFII		LLTIDRYLAV		VHAVFALKAR		TVTFGVVTSV
ITWVVAVFAS		LPGIIFTRSQ		KEGLHYTCSS		HFPYSQYQFW		KNFQTLKIVI
LGLVLPLLVM		VICYSGILKT		LLRCRNEKKR		HRAVRLIFTI		MIVYFLFWAP
YNIVLLLNTF		QEFFGLNNCS		SSNRLDQAMQ		VTETLGMTHC		CINPIIYAFV
GEKFRNYLLV		FFQKHIAKRF		CKCCSIFQQE		APERASSVYT		RSTGEQEISV
GL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, білків внутрішньоклітинного сигналінгу, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, поліморфізм. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Samson M., Labbe O., Mollereau C., Vassart G., Parmentier M. (1996). Molecular cloning and functional expression of a new human CC-chemokine receptor gene. Biochemistry. 35: 3362—3367. PMID 8639485 DOI:10.1021/bi952950g
• Raport C.J., Gosling J., Schweichart V.L., Gray P.W., Charo I.F. (1996). Molecular cloning and functional characterization of a novel human CC chemokine receptor (CCR5) for RANTES, MIP-1beta, and MIP-1alpha. J. Biol. Chem. 271: 17161—17166. PMID 8663314 DOI:10.1074/jbc.271.29.17161
• Mummidi S., Ahuja S.S., McDaniel B.L., Ahuja S.K. (1997). The human CC chemokine receptor 5 (CCR5) gene. Multiple transcripts with 5'-end heterogeneity, dual promoter usage, and evidence for polymorphisms within the regulatory regions and noncoding exons. J. Biol. Chem. 272: 30662—30671. PMID 9388201 DOI:10.1074/jbc.272.49.30662
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Oppermann M., Mack M., Proudfoot A.E., Olbrich H. (1999). Differential effects of CC chemokines on CC chemokine receptor 5 (CCR5) phosphorylation and identification of phosphorylation sites on the CCR5 carboxyl terminus. J. Biol. Chem. 274: 8875—8885. PMID 10085131 DOI:10.1074/jbc.274.13.8875
• Schweneker M., Bachmann A.S., Moelling K. (2005). JM4 is a four-transmembrane protein binding to the CCR5 receptor. FEBS Lett. 579: 1751—1758. PMID 15757671 DOI:10.1016/j.febslet.2005.02.037

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з CCR5 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Сполуки, які фізично взаємодіють з CCR5 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
3. Human PubMed Reference:.
4. Mouse PubMed Reference:.
5. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1606 (англ.) . Архів оригіналу за 12 вересня 2015. Процитовано 30 серпня 2017. [Архівовано 2015-09-12 у Wayback Machine.]
6. UniProt, P51681 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

• Хромосома 3

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»